Proteome

Az oldal jelenlegi verzióját még nem ellenőrizték tapasztalt közreműködők, és jelentősen eltérhet a 2019. augusztus 25-én felülvizsgált verziótól ; az ellenőrzéshez 1 szerkesztés szükséges .

A proteom egy sejt, szövet vagy szervezet által meghatározott időtartam alatt termelt testfehérjék  összessége . Vagy még pontosabban : egy adott sejttípusban vagy szervezetben, adott időszakban, adott körülmények között expresszált fehérjék összessége . A kifejezés a „fehérje” (fehérje) szó származéka, eredete hasonló a „ genom ” szóhoz (egy szervezet összes génjének összessége).

A kifejezést számos különböző típusú biológiai rendszerre alkalmazták. A sejtproteom  olyan fehérjék halmaza, amelyek egy adott sejtben bizonyos környezeti feltételek mellett, például bizonyos hormonok hatására találhatók . Egy szervezet teljes proteomja az összes sejt proteomjainak összessége. A „proteóma” kifejezés egy szubcelluláris szervezet fehérjéinek halmazára is utal, mint például egy vírus (vírusproteom).

A proteom, különösen az eukariótákban , nagyobb, mint a genom, ami azt jelenti, hogy több fehérje van, mint gén . Ennek oka az alternatív splicing , valamint a fehérjék poszttranszlációs módosulása , például glikozilációjuk és foszforilációjuk .

Míg a genomot a nukleotidok szekvenciája határozza meg , a proteom nem az aminosavak szekvenciáinak összege . A proteom magában foglalja a benne található összes fehérje térbeli szerkezetét (lásd a másodlagos fehérje szerkezetét , harmadlagos fehérje szerkezetét ) és a köztük lévő funkcionális kölcsönhatást.

A proteomika  , a proteomok tudománya nagyrészt a fehérjék kétdimenziós elektroforézissel történő szétválasztása révén fejlődött ki . Az első mérés a fehérjék elválasztása elektromos töltésük alapján izoelektromos fókuszálással . A második dimenzió a fehérjék elválasztása molekulatömegük alapján az en:SDS-PAGE módszerrel .

Történelem

A "proteóma" kifejezést 1994 -ben Mark Wilkins ausztrál tudós javasolta [1] a 2D Electrophoresis: from protein maps to genomes" szimpóziumon Sienában , Olaszországban . A kifejezés nyomtatásban 1995 -ben [2] jelent meg egy közleményben. része Wilkins PhD értekezésének.

A Proteome kutatás jelentős nemzetközi tudományos projekt . 2001 - ben megalakult a Nemzetközi Human Proteome Organisation (HUPO )  , hogy ezzel foglalkozzon . A projekt résztvevői kiemelt figyelmet fordítanak a vér, a máj és az agy fehérjéire.

Lásd még

Jegyzetek

  1. Wilkins, Marc. Proteomikai adatbányászat  (neopr.)  // Szakértői áttekintés a proteomikáról . - Anglia , 2009. - December ( 6. kötet , 6. szám ). - S. 599-603 . - doi : 10.1586/epr.09.81 . — PMID 19929606 .
  2. Wasinger VC, Cordwell SJ, Cerpa-Poljak A., Yan JX, Gooley AA, Wilkins MR, Duncan MW, Harris R., Williams KL, Humphery-Smith I. Progress with gene-product mapping of the Mollicutes: Mycoplasma genitalium  ( angol)  // Elektroforézis : folyóirat. - 1995. - 1. évf. 7 , sz. 7 . - P. 1090-1094 . - doi : 10.1002/elps.11501601185 . — PMID 7498152 .

Linkek