Shine-Dalgarno sorozat

A Shine-Dalgarno szekvencia ( Eng.  Shine-Dalgarno szekvencia, Shine-Dalgarno box ) egy riboszómakötő hely egy prokarióta mRNS - molekulán , általában körülbelül 10 nukleotid távolságra a startkodontól . [1] John Shine és Lynn Dalgarno ausztrál tudósok írták le . [2] AUG

A konszenzus hat nukleotidból álló szekvencia AGGAGG; az E. coli esetében a Shine-Dalgarno szekvencia AGGAGGU. A komplementer szekvencia , az úgynevezett anti-Shine-Dalgarno szekvencia, a 16S riboszomális RNSCCUCCU -molekula 3' végén található . A Shine-Dalgarno és az anti-Shine-Dalgarno szekvenciák közötti komplementer kölcsönhatás arra szolgál, hogy az mRNS startkodont a riboszóma P helyére helyezze, hogy elindítsa a fehérje bioszintézist. [3]

A Shine-Dalgarno szekvencia mutációi csökkentik a transzláció hatékonyságát . Ennek oka az mRNS- 30S -riboszomális alegység komplex képződésének hatékonyságának csökkenése . Kimutatták, hogy az anti-Shine-Dalgarno szekvencia komplementer mutációi helyreállítják a transzlációs hatékonyságot.

A Shine-Dalgarno és az anti-Shine-Dalgarno szekvencia komplex kialakulásának pillanatában az IF2-GTP, IF1, IF3 transzlációs iniciációs faktorok, valamint az iniciátor formil - metionil- tRNS ( fMet-tRNS ) kötődnek a 30S-riboszomálishoz. alegység. Az 50S-riboszomális alegység ezután csatlakozik a kialakult pre-iniciációs komplexhez. [négy]

Gram-negatív baktériumok riboszómáinak S1 fehérje

Gram-negatív baktériumokban a Shine-Dalgarno szekvencia jelenléte nem szükséges a start kodon felismeréséhez . Például kimutatták, hogy a Shine-Dalgarno szekvencia deléciója a 16S rRNS-ből nem vezet a transzláció megindításához a rossz helyeken. Ezenkívül néhány prokarióta mRNS egyáltalán nem tartalmazza a Shine-Dalgarno szekvenciát. Úgy tűnik, az S1 riboszomális fehérje β-ban gazdag szekvenciákhoz kötődik AU, amelyek 15-30 nukleotid távolságra vannak a startkodontól.

Lásd még

Jegyzetek

  1. ↑ Kapp LD, Lorsch JR Az eukarióta transzláció molekuláris mechanikája // Annual Review of Biochemistry 73/2004, 657-704
  2. ↑ Shine J., Dalgarno L. A cisztronspecifitás meghatározója bakteriális riboszómákban // Természet. - 1975. - 1. évf. 254, 5495. sz . — P. 34–8. - doi : 10.1038/254034a0 . — PMID 803646 .
  3. ↑ Noller HF A bakteriális riboszóma szerkezete és néhány hatása a transzlációs szabályozásra // Translational Control in Biology and Medicine / Szerkesztette: N. Sonenberg, JWB Hershey és MB Mathews. Cold Spring Harbor, NY: Cold Spring Harbor Press, 2007. 41-58.
  4. ↑ Benelli D., Londei P. Kezdje az elején: a transzlációs iniciáció evolúciója // Research in Microbiology 160, 2009, 493-501

Irodalom

Linkek