Autonóm replikációs szekvencia

Az autonóm replikációs szekvencia ( ARS) az élesztő genomjának olyan DNS-  szekvenciája , amely tartalmazza a replikációs origót (ori), és felelős a replikáció megindításáért .

Működés és szerkezet

Kezdetben az ARS szekvenciákat a bimbózó Saccharomyces cerevisiae élesztőben a kromoszómális DNS fragmenseiként írták le, amelyek növelik a transzformáció gyakoriságát és biztosítják a plazmidok stabilitását . Így az ezeket tartalmazó plazmidok nagy gyakorisággal transzformálták az élesztősejteket [1] . Ezt követően hasonló elemeket találtak a Schizosaccharomyces pombe élesztőben [2] .

A további vizsgálatok során kiderült, hogy az ARS-ek replikációs origót tartalmaznak, vagyis a replikáció elindításáért felelős elemek - replikátorok . 5 ezer bp hosszú DNS-szakaszon. n. az ARS-nek három különálló eleme van. Beindulásuk a sejtciklus minden S-fázisában egyszer történik , bár a hatékonyság és az aktiválási idő (az S-fázis elején vagy végén) eltérő lehet a különböző ARS-eknél [3] .

A S. cerevisiae esetében az ARS hossza 100-200 nt. n. Az ARS a következő 2 kötelező elemet tartalmazza: A tartomány , amely 11 n konzervatív szekvenciát tartalmaz. n. - ACS, amely egy 6 fehérjéből álló komplexhez kötődik - az eredetfelismerő  komplexhez (ORC ) és egy nagy , A - T párokban gazdag B doménhez az A elem mellett, azonban szekvenciáik között nincs hasonlóság. Az ACS szekvencia a következő: 5'-T/ATTTAYRTTTT/A-3'ahol Y jelentése pirimidin és R jelentése purin . Az ORC-nek más eukariótákban is vannak homológjai , mint például a Drosophila , a Xenopus , az egerek és az emberek. S. cerevisiae - ben az iniciációs faktorok ORC-hez való kötődését a mai napig jól tanulmányozták [1] .

Meg kell jegyezni, hogy az eukarióta replikációs mechanizmusok és az ebben részt vevő fehérjék hasonlósága ellenére replikációs origójuk jelentős eltéréseket mutathat. Például a S. pombe élesztőben , amely sok hasonlóságot mutat a magasabb eukarióta sejtekkel, az ARS sokkal hosszabb, mint a S. cerevisiae -ben , és 600-1500 bp-t tartalmaz. n., és DNS-szekvenciájuk hasonlósága csak abban rejlik, hogy mindkettőben A-T-ben gazdag régiók jelen vannak [1] .

Megállapították, hogy a B domén mutációi csökkentik az ARS elem aktivitását, azonban az A domén mutációja esetén az egész elem teljesen inaktívvá válik.

Jegyzetek

  1. 1 2 3 VINAY KUMAR SRIVASTAVA, DHARANI DHAR DUBEY. Autonóm replikáló szekvenciaelemek feltérképezése a hasadó élesztő, Schizosaccharomyces pombe II. kromoszómájának 73 kb-os régiójában  // Journal of Genetics. - 2007. - T. 86 , 2. sz . - S. 139-148 .
  2. Clyne RK, Kelly TJ Autonóm replikáló szekvencia (ARS) elemek azonosítása eukarióta sejtekben. // Módszerek .. - 1997. - T. 13 , 3. sz . - S. 221-233 .
  3. Konichev, Sevastyanova, 2012 , p. 230.

Irodalom