Ostreococcus

Ostreococcus
Az Ostreococcus tauri elektronmikroszkópos felvétele
tudományos osztályozás
Tartomány:eukariótákKirályság:NövényekAlkirályság:zöld növényekOsztály:zöld algaOsztály:MamiellophyceaeRendelés:MamiellalesCsalád:batycoccaceaeNemzetség:Ostreococcus
Nemzetközi tudományos név
Ostreococcus Courties & Chrét. -Din.

Az Ostreococcus  (lat.) a Mamiellophyceae osztályba tartozó egysejtű kokcoid zöldalgák nemzetsége . Részei a pikoplanktonnak , amely kulcsszerepet játszik az óceáni szénciklusban . Ebbe a nemzetségbe tartoznak a legkisebb szabadon élő eukarióták , amelyek mérete mindössze 0,8 mikron .

Tanulmánytörténet

A nemzetség első ismert faját , az Ostreococcus tauri -t 1994 - ben írták le a To -tóból származó pikoplankton áramlási citometriás vizsgálata során [1] . Az egysejtű fotoszintetikus organizmusok kényelmesen vizsgálhatók áramlási citometriával a klorofill és más, a napfény elnyelésére használt fluoroforok autofluoreszcenciája [2] . Az újonnan leírt fajokat a klorofillok és karotinoidok összetétele [1] , valamint a sejt ultraszerkezete alapján a Prasinophyceae osztályba sorolták be. Ezt követően a faj helyzetét 18S rRNS analízissel igazoltuk [3] . A 18S rRNS vizsgálata során nyert molekuláris filogenetikai adatok lehetővé tették egy új osztály - a Mamiellophyceae - izolálását , amely a Bathycoccaceae családba tartozó Ostreococcus fajokat foglalja magában [4] . A Mamiellophyceae az egyik ökológiailag legsikeresebb eukarióta csoport, amely a tengeri és esetleg édesvízi fotoszintetikus pikoplanktont alkotja. A metagenomikus elemzés [5] és a metabarkódolás [6] lehetővé tette az Ostreococcus kimutatását az óceánok különböző részein.

Leírás

Az Ostreococcus nemzetséghez tartoznak a legkisebb ismert szabadon élő eukarióták, mivel a legtöbb sejt mérete nem haladja meg a 0,8 mikront [1] . A sejt ultrastruktúrája egyszerű: ezek kokcoid sejtek, amelyeknek nincs sejtfaluk, és egy kloroplasztot , egy mitokondriumot , egy Golgi-készüléket és egy sejtmagot tartalmaznak [1] . Az Ostreococcus genomja nagyon kicsi [7] . A nemzetség három fajának genomiális szekvenciái ismertek : O. tauri RCC422 (mérete 13 megabázis (Mb), a genomot 2006- ban szekvenálták [8] és az adatokat 2014-ben frissítették [9] ), az O. lucimarinus CCMP2514 [10 ] ] és az RCC809 [11] törzs . Ezeknek az algáknak a GC összetétele magasabb, mint a magasabb rendű növényeké , azonban két szokatlan kromoszómát alacsony GC összetétel jellemzi, és számos prokarióta eredetű transzpozont és gént hordoznak [7] . Ismeretes , hogy a vírusok megfertőzik az Ostreococcus nemzetség képviselőit , de egyes vonalak rezisztenciát fejlesztenek ki ellenük. A rezisztencia oka lehet a szokatlan 19-es kromoszóma génjeinek csaknem fele, amely, amint a kariotípusok összehasonlítása is mutatja , fizikai átrendeződéseken ment keresztül [7] . 2012-ben a nemzetség két fajának metabolikus útvonaltérképét rekonstruálták a KEGG adatbázis segítségével [12] .

Ökológia

Az Ostreococcus fajok az egész világon elterjedtek az óceánok fotozónájában , ahol megkötik a szén-dioxidot és oxigént szabadítanak fel , így termelők [7] .

Osztályozás

Az AlgaeBase adatbázisa szerint 2017 januárjától a nemzetség 2 nemzetséget foglal magában [13] :

Más források szerint egy másik fajt is megkülönböztetnek - Ostreococcus lucimarinus [10] , valamint legalább egy törzset, amely nem tartozik a korábban felsorolt ​​fajok egyikéhez sem - Ostreococcus sp. RCC809 [11] .

Jegyzetek

  1. ↑ 1 2 3 4 Courties Claude , Vaquer André , Troussellier Marc , Lautier Jacques , Chrétiennot-Dinet Marie J. , Neveux Jacques , Machado Cordelia , Claustre Hervé. A legkisebb eukarióta szervezet  (angol)  // Természet. - 1994. - július ( 370. évf. , 6487. sz.). - P. 255-255 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/370255a0 .
  2. ↑ Davey HM , Kell DB Heterogén mikrobiális populációk áramlási citometriája és sejtválogatása: az egysejtes elemzések jelentősége.  (angol)  // Mikrobiológiai áttekintések. - 1996. - 1. évf. 60, sz. 4 . - P. 641-696. — PMID 8987359 .
  3. ↑ Courties Claude , Perasso Roland , Chrétiennot-Dinet Marie-Josèphe , Gouy Manolo , Guillou Laure , Troussellier Marc. AZ OSTREOCOCCUS TAURI (CHLOROPHYTA, PRASINOPHYCEAE) FILOGENETIKAI ELEMZÉSE ÉS GENOMMÉRETE  // Journal of Phycology. - 1998. - október ( 34. köt. , 5. szám ). - S. 844-849 . — ISSN 0022-3646 . - doi : 10.1046/j.1529-8817.1998.340844.x .
  4. ↑ Marin Birger , Melkonian Michael. A Mamiellophyceae osztály molekuláris filogeneze és osztályozása. november. (Chlorophyta) a nukleáris és plasztid által kódolt rRNS-operonok szekvencia-összehasonlítása alapján  // Protist. - 2010. - április ( 161. évf. , 2. szám ). - S. 304-336 . — ISSN 1434-4610 . - doi : 10.1016/j.protis.2009.10.002 .
  5. ↑ Piganeau Gwenaël , Moreau Herve. A Sargasso-tenger metagenomjának szűrése adatokért az Ostreococcus (Prasinophyceae, Chlorophyta  ) genom evolúciójának vizsgálatához  // Gene. - 2007. - December ( 406. évf . , 1-2. sz. ). - P. 184-190 . — ISSN 0378-1119 . - doi : 10.1016/j.gene.2007.09.015 .
  6. ↑ Demir-Hilton Elif , Sudek Sebastian , Cuvelier Marie L , Gentemann Chelle L , Zehr Jonathan P , Worden Alexandra Z. Global Distribution patterns of different clades of the photosynthetic picoeukaryote Ostreococcus  // The ISME Journal. - 2011. - február 3. ( 5. köt. , 7. sz.). - S. 1095-1107 . — ISSN 1751-7362 . - doi : 10.1038/ismej.2010.209 .
  7. ↑ 1 2 3 4 Yau S. , Hemon C. , Derelle E. , Moreau H. , Piganeau G. , Grimsley N. A Viral Immunity Chromosome in the Marine Picoeukaryote, Ostreococcus tauri.  (angol)  // PLoS kórokozók. - 2016. - Kt. 12, sz. 10 . — P. e1005965. - doi : 10.1371/journal.ppat.1005965 . — PMID 27788272 .
  8. ↑ Derelle E. , Ferraz C. , Rombauts S. , Rouze P. , Worden AZ , Robbens S. , Partensky F. , Degroeve S. , Echeynie S. , Cooke R. , Saeys Y. , Wuyts J. , Jabbari K. . , Bowler C. , Panaud O. , Piegu B. , Ball SG , Ral J.-P. , Bouget F.-Y. , Piganeau G. , De Baets B. , Picard A. , Delseny M. , Demaille J. , Van de Peer Y. , Moreau H. A legkisebb szabadon élő eukarióta, az Ostreococcus tauri genomelemzése számos egyedi tulajdonságot tár fel   // Proceedings of a Nemzeti Tudományos Akadémia. - 2006. - július 25. ( 103. évf. , 31. sz.). - P. 11647-11652 . — ISSN 0027-8424 . - doi : 10.1073/pnas.0604795103 .
  9. ↑ Blanc-Mathieu Romain , Verhelst Bram , Derelle Evelyne , Rombauts Stephane , Bouget François-Yves , Carré Isabelle , Château Annie , Eyre-Walker Adam , Grimsley Vangel , Moreau Hervé , Piégu Yewitric , Schönnnn , Peégu Yewitz . , Piganeau Gwenaël. Az Ostreococcus tauri modell tengeri alga továbbfejlesztett genomja az Illumina de novo szerelvények értékelésével  //  BMC Genomics. - 2014. - Kt. 15 , sz. 1 . - 1103. o . — ISSN 1471-2164 . - doi : 10.1186/1471-2164-15-1103 .
  10. ↑ 1 2 Palenik B. , Grimwood J. , Aerts A. , Rouze P. , Salamov A. , Putnam N. , Dupont C. , Jorgensen R. , Derelle E. , Rombauts S. , Zhou K. , Otillar R. , Merchant SS , Podell S. , Gaasterland T. , Napoli C. , Gendler K. , Manuell A. , Tai V. , Vallon O. , Piganeau G. , Jancek S. , Heijde M. , Jabbari K. , Bowler C . , Lohr M. , Robbens S. , Werner G. , Dubchak I. , Pazour GJ , Ren Q. , Paulsen I. , Delwiche C. , Schmutz J. , Rokhsar D. , Van de Peer Y. , Moreau H. , Grigoriev IV Az apró eukarióta Ostreococcus genomikai betekintést nyújt a planktonspeciáció paradoxonába  //  Proceedings of the National Academy of Sciences. - 2007. - április 25. ( 104. évf. , 18. sz.). - P. 7705-7710 . — ISSN 0027-8424 . - doi : 10.1073/pnas.0611046104 .
  11. ↑ 12 Ostreococcus _ _ Letöltve: 2017. január 31. Az eredetiből archiválva : 2015. július 15.
  12. ↑ Krumholz Elias W. , Yang Hong , Weisenhorn Pamela , Henry Christopher S. , Libourel Igor GL Az Ostreococcus pikoalga genomszintű metabolikus hálózatának rekonstrukciója  // Journal of Experimental Botany. - 2011. - december 29. ( 63. évf. 6. szám ). - S. 2353-2362 . — ISSN 1460-2431 . doi : 10.1093 / jxb/err407 .
  13. ↑ Ostreococcus  . _ AlgaeBase: Taxonómia böngésző .  (Hozzáférés: 2017. február 3.) .
  14. ↑ Subirana Lucie , Péquin Bérangère , Michely Stéphanie , Escande Marie-Line , Meilland Julie , Derelle Evelyne , Marin Birger , Piganeau Gwenaël , Desdevises Yves , Moreau Hervé , Grimsley Nigel H. Reagens plasztika, a Genushyl Ostogenreo és a Genushyl Ostogenreo Cryptic Species, O. mediterraneus sp. november. (Mamiellales, Mamiellophyceae)  (angol)  // Protist. - 2013. - szeptember ( 164. évf. , 5. sz.). - P. 643-659 . — ISSN 1434-4610 . - doi : 10.1016/j.protis.2013.06.002 .

Linkek