MBD3

A metil-CpG-kötő domén 3 fehérje egy olyan fehérje , amelyet emberben az MBD3 gén kódol [1] [2] [3] .

Funkció

A DNS-metiláció az eukarióta genom egyik fő módosítása, és fontos szerepet játszik az emlősök fejlődésében. A MECP2 , MBD1 , MBD2 , MBD3 és MBD4 humán fehérjék a nukleáris fehérjék családjába tartoznak, amelyek egy metil-CpG-kötő domén jelenléte alapján egyesülnek . A család többi tagjával ellentétben azonban az MBD3 nem tud kötődni a metilált DNS-hez, hanem a hidroximetilezett DNS -hez kötődik [3] . Az MBD3 elsődleges szerkezete 71%-ban és 94%-ban megegyezik az MBD2 (1. izoforma) és az egér Mbd3 szerkezetével. Az MBD3 a NuRD több alegység komplex egyik alegysége, amely képes nukleoszómák módosítására és hiszton-deacetiláz aktivitással rendelkezik. Az MBD3 közvetíti a metasztázishoz kapcsolódó protein 2 ( MTA2 ) kötődését a hiszton-deacetiláz komplex magjához [3] .

Az MBD3 tartalmaz egy tekercses domént is, amely az MBD3 mindhárom ismert izoformájára jellemző. A coiled coil domén, és nem az MBD domén segít fenntartani az embrionális őssejtek pluripotenciáját azáltal, hogy a 2-es polikombin represszor komplexet (PRC2) a gének fejlődési és organogenezishez kapcsolódó részhalmazaihoz irányítja, és ezáltal fenntartja azok stabil represszióját [4] .

Interakciók

Az MBD3 kölcsönhatásba lép a következőkkel:

• AURKA , [5]
• GATAD2B , [6] [7]
• HDAC1 , [5] [8] [9]
• MTA2 , [5] [8] [9] és
• MBD2 . [8] [10]

Jegyzetek

1. ↑ Hendrich B., Bird A. Az emlős metil-CpG-kötő fehérjék családjának azonosítása és jellemzése  //  Mol Cell Biol : folyóirat. - 1998. - november ( 18. évf. , 11. sz.). - P. 6538-6547 . — PMID 9774669 .
2. ↑ Hendrich B., Abbott C., McQueen H., Chambers D., Cross S., Bird A. Az egér és humán Mbd1, Mbd2,  Mbd3 és Mbd4 gének  genomiális szerkezete és kromoszómatérképezése // Mamm Genome : folyóirat. - 1999. - szeptember ( 10. évf. , 9. sz.). - P. 906-912 . - doi : 10.1007/s003359901112 . — PMID 10441743 .
3. ↑ 1 2 Entrez gén: MBD3 metil-CpG kötődomén fehérje 3 . (határozatlan)
4. ↑ Hirasaki, M., Ueda, A., Asaka, MN, Uranishi, K., Suzuki, A., Kohda, M., ... & Koseki, H. (2018). A Coiled-Coil tartomány azonosítása az embrionális őssejtek leszármazási potenciáljának megőrzéséhez elengedhetetlen Mbd3 elemként . ŐSSEJTEK. doi : 10.1002/stem.2849
5. ↑ 1 2 3 Sakai H., Urano T., Ookata K., Kim MH, Hirai Y., Saito M., Nojima Y., Ishikawa F. Az MBD3 és a HDAC1, a NuRD komplex két komponense az Aurora-ban található. A-pozitív centroszómák M-fázisban  (angol)  // J. Biol. Chem.  : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 277. sz . 50 . - P. 48714-48723 . - doi : 10.1074/jbc.M208461200 . — PMID 12354758 .
6. ↑ Brackertz M., Boeke J., Zhang R., Renkawitz R. Két erősen rokon p66 fehérje alkotja az MBD2-vel és MBD3-mal kölcsönhatásba lépő, erős transzkripciós represszorok új családját  //  J. Biol. Chem.  : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 277. sz . 43 . - P. 40958-40966 . - doi : 10.1074/jbc.M207467200 . — PMID 12183469 .
7. ↑ Feng Q., Cao R., Xia L., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Zhang Y. A MeCP1 komplex p66/p68 komponenseinek azonosítása és funkcionális jellemzése   // Mol . sejt. Biol. : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 22 , sz. 2 . - P. 536-546 . - doi : 10.1128/MCB.22.2.536-546.2002 . — PMID 11756549 .
8. ↑ 1 2 3 Zhang Y., Ng HH, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. A NuRD alegységek elemzése hiszton dezacetiláz magkomplexet  és /DNS-metilációval való kapcsolatot  Genes Dev.  : folyóirat. - 1999. - 1. évf. 13 , sz. 15 . - P. 1924-1935 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
9. ↑ 1 2 Saito M., Ishikawa F. A humán MBD3 mCpG-kötő doménje nem kötődik az mCpG-hez, de kölcsönhatásba lép a NuRD/Mi2 HDAC1 és MTA2 komponenseivel  //  J. Biol. Chem.  : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 277. sz . 38 . - P. 35434-35439 . - doi : 10.1074/jbc.M203455200 . — PMID 12124384 .
10. ↑ Jiang CL, Jin SG, Pfeifer GP Az MBD3L1 egy transzkripciós represszor, amely kölcsönhatásba lép a metil-CpG-kötő protein 2-vel (MBD2) és a NuRD komplex komponenseivel  //  J. Biol. Chem.  : folyóirat. - 2004. - 20. évf. 279. sz . 50 . - P. 52456-52464 . - doi : 10.1074/jbc.M409149200 . — PMID 15456747 .

Irodalom

• Shen L., Zhang Y. 5-hidroximetilcitozin  : keletkezés, sors és genomi eloszlás  // Current Opinion in Cell Biology : folyóirat. — Elsevier , 2013. — 20. évf. 25 , sz. 3 . - 289-296 . o . - doi : 10.1016/j.ceb.2013.02.017 . — PMID 23498661 .
• Abbott WM, Mellor A., ​​Edwards Y., Feizi T. Soluble bovine galactose-binding lectin. A cDNS klónozás feltárja a teljes aminosavszekvenciát és antigén kapcsolatot a mielin bázikus fehérje fő encephalitogen doménjével. (angol)  // Biochem. J. : folyóirat. - 1989. - 1. évf. 259 , sz. 1 . - P. 283-290 . — PMID 2470348 .
• Zhang Y., LeRoy G., Seelig HP, Lane WS, Reinberg D. A dermatomyositis-specifikus autoantigén Mi2 egy olyan komplex komponense, amely hiszton-deacetilázt és nukleoszóma-remodelling aktivitást tartalmaz. (angol)  // Cell  : napló. - Cell Press , 1998. - Vol. 95 , sz. 2 . - 279-289 . o . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)81758-4 . — PMID 9790534 .
• Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, Kingston RE, Schreiber SL Kromatin-dezacetiláció ATP-függő nukleoszóma-remodelling komplexszel. (angol)  // Természet: folyóirat. - 1998. - Vol. 395 , sz. 6705 . - P. 917-921 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
• Zhang Y., Ng HH, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. A NuRD alegységek elemzése hiszton-dezacetiláz magkomplexet és DNS-metilációval való kapcsolatot tár fel. (angol)  // Genes Dev.  : folyóirat. - 1999. - 1. évf. 13 , sz. 15 . - P. 1924-1935 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
• Wade PA, Gegonne A., Jones PL, Ballestar E., Aubry F., Wolffe AP Mi-2 komplex összekapcsolja a DNS-metilációt a kromatin-átalakítással és a hiszton-dezacetilációval. (angol)  // Nat. Közönséges petymeg.  : folyóirat. - 1999. - 1. évf. 23 , sz. 1 . - P. 62-6 . - doi : 10.1038/12664 . — PMID 10471500 .
• Tatematsu KI, Yamazaki T., Ishikawa F. Az MBD2-MBD3 komplex félmetilezett DNS-hez kötődik, és DNMT1-et tartalmazó komplexet képez a replikációs gócokban a késői S fázisban. (angol)  // Gének sejtek : folyóirat. - 2000. - Vol. 5 , sz. 8 . - P. 677-688 . - doi : 10.1046/j.1365-2443.2000.00359.x . — PMID 10947852 .
• Humphrey GW, Wang Y., Russanova VR, Hirai T., Qin J., Nakatani Y., Howard BH Stabil hiszton-dezacetiláz komplexek, amelyeket a SANT domén CoREST/kiaa0071 és Mta-L1 fehérjék jelenléte különböztet meg. (angol)  // J. Biol. Chem.  : folyóirat. - 2001. - 20. évf. 276. sz . 9 . - P. 6817-6824 . - doi : 10.1074/jbc.M007372200 . — PMID 11102443 .
• Shi Y., Downes M., Xie W., Kao HY, Ordentlich P., Tsai CC, Hon M., Evans RM Sharp, egy indukálható kofaktor, amely integrálja a nukleáris receptor elnyomását és aktiválását. (angol)  // Genes Dev.  : folyóirat. - 2001. - 20. évf. 15 , sz. 9 . - P. 1140-1151 . - doi : 10.1101/gad.871201 . — PMID 11331609 .
• Feng Q., Cao R., Xia L., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Zhang Y. A MeCP1 komplex p66/p68 komponenseinek azonosítása és funkcionális jellemzése. (angol)  // Mol. sejt. Biol. : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 22 , sz. 2 . - P. 536-546 . - doi : 10.1128/MCB.22.2.536-546.2002 . — PMID 11756549 .
• Schlegel J., Güneysu S., Mennel HD A metil-kötő domén fehérjék génjeinek expressziója humán gliomákban. (angol)  // Oncol. Ismétlés. : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 9 , sz. 2 . - P. 393-395 . - doi : 10.3892/vagy.9.2.393 . — PMID 11836615 .
• Saito M., Ishikawa F. A humán MBD3 mCpG-kötő doménje nem kötődik az mCpG-hez, hanem kölcsönhatásba lép a NuRD/Mi2 HDAC1 és MTA2 komponenseivel. (angol)  // J. Biol. Chem.  : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 277. sz . 38 . - P. 35434-35439 . - doi : 10.1074/jbc.M203455200 . — PMID 12124384 .
• Brackertz M., Boeke J., Zhang R., Renkawitz R. Két erősen rokon p66 fehérje alkotja az MBD2-vel és MBD3-mal kölcsönhatásba lépő, erős transzkripciós represszorok új családját. (angol)  // J. Biol. Chem.  : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 277. sz . 43 . - P. 40958-40966 . - doi : 10.1074/jbc.M207467200 . — PMID 12183469 .
• Sakai H., Urano T., Ookata K., Kim MH, Hirai Y., Saito M., Nojima Y., Ishikawa F. MBD3 és HDAC1, a NuRD komplex két komponense, az Aurora-A-pozitív centroszómákon találhatók M fázisban. (angol)  // J. Biol. Chem.  : folyóirat. - 2003. - 1. évf. 277. sz . 50 . - P. 48714-48723 . - doi : 10.1074/jbc.M208461200 . — PMID 12354758 .
• Fujita N., Jaye DL, Kajita M., Geigerman C., Moreno CS, Wade PA MTA3, egy Mi-2/NuRD komplex alegység, szabályozza a mellrák invazív növekedési útvonalát. (angol)  // Cell  : napló. - Cell Press , 2003. - Vol. 113. sz . 2 . - 207-219 . o . - doi : 10.1016/S0092-8674(03)00234-4 . — PMID 12705869 .
• Fujita N., Jaye DL, Geigerman C., Akyildiz A., Mooney MR, Boss JM, Wade PA MTA3 és a Mi-2/NuRD komplex szabályozza a sejtsorsot a B-limfocita differenciálódás során. (angol)  // Cell  : napló. - Cell Press , 2004. - Vol. 119. sz . 1 . - 75-86 . o . - doi : 10.1016/j.cell.2004.09.014 . — PMID 15454082 .