Faustovírus

Faustovírus

Faustovírus virion rekonstrukció krioelektronmikroszkóppal _
tudományos osztályozás
Csoport:Vírusok [2]Birodalom:incertae sedis [1]Kilátás:Faustovírus
Nemzetközi tudományos név
Faustovírus
A Baltimore Csoport
I: dsDNS vírusok

A Faustovirus  (latinul) egy óriási vírus , amely morfológiailag és genetikailag közel áll két másik óriási vírushoz , a Pacmanvirushoz és a Kaumoebavirushoz , valamint az Asfarviridae család vírusaihoz . A faustovírust 2015-ben izolálták a protista Vermamoeba vermiformisból [3] .

2018 novemberétől a Faustovirus nemzetség nem szerepel a Vírusok Taxonómiai Nemzetközi Bizottságának (ICTV) adatbázisában [4] .

Leírás

A Faustovírusnak körülbelül 200 nm méretű ikozaéderes virionjai vannak [3] . 2016-ban a Faustovirus virionokat részletesen tanulmányozták krioelektronmikroszkóppal . A vírus külső héjának fő kapszidfehérje ( MCP ) trimereket alkot , amelyek mindegyik monomerje két egymás után elhelyezkedő zselés tekercs szerkezeti motívumból áll . Egy zselés tekercs motívum 8 béta lapot tartalmaz . A kapszid fő fehérjéjének hasonló szerveződése számos vírusban megtalálható. A kapszomert az MCP hexamer képviseli , és körülbelül 75 Å átmérőjű . A legtöbb más óriásvírussal ellentétben a Faustovírusnak van egy második, belső kapszidrétege is, amelyet szintén fehérje-hexamerek alkotnak [5] .  

Genom

A Faustovírus genomját egy 466 265 bázispárból (bp) álló, cirkuláris, kétszálú DNS- molekula képviseli. A genom GC összetétele 36%. A genomban 451 fehérjét kódoló gén található , termékeik hossza 47-2980 aminosav (a.a.) között van. A Faustovirus genomjában nem azonosítottak tRNS -t kódoló géneket . A Faustovírus fehérjék mindössze 31%-a talált homológot az adatbázisokban . A legtöbb Faustovírus fehérje homológ az Asfarviridae fehérjéivel ; a Phycodnaviridae , Mimiviridae , Marseilleviridae és Ascoviridae családok vírusainak fehérjéihez kapcsolódó fehérjék is vannak . Egyes fehérjék rokonok a bakteriofág fehérjékkel , emellett számos fehérjének csak a sejtes organizmusok között van rokona: eukarióták , baktériumok és archaeák . A kapszidfehérjéket kódoló génekben számos intront azonosítottak [5] , köztük 6 önsplicing I. csoportba tartozó intront – ez nagyon atipikus eset a vírusok esetében [3] .

Életciklus

A Vermamoeba vermiformis sejtek fertőzése a vírusrészecskék protista általi fagocitózisával kezdődik . A fertőzés után 2-4 órával virionokat észlelnek a fagoszómák belsejében , amelyek egy része akár a sejtmag közelében is elhelyezkedhet , bár a vírusrészecskék és a sejtmag közötti kölcsönhatást nem találták. Ezután a fagoszómák tartalmukat a gazdasejt citoplazmájába engedik ki: a vírus belső membránja összeolvad a fagoszóma membránjával , és a virion tartalma kijön, hasonlóan a mimivírushoz . Ezt követően a virionok egy része már nem látható. A Faustovírus fehérjék és DNS felszabadulása a sejtbe 4-6 órával a fertőzés után következik be. Érdekes módon ezzel párhuzamosan a gazdasejt magja némi átrendeződésen megy keresztül, nevezetesen elveszti gömb alakú formáját. A fertőzés után 8-10 órával a sejt felkerekedik és elveszti a kapcsolatot a szubsztráttal, a citoplazmában pedig jól láthatóvá válik a vírusgyár , amely újonnan képződött vírusrészecskéket tartalmaz, és mitokondriumok vesznek körül . Egyes sejteknek csak üres kapszidjai vannak vírusgyáraikban. A fertőzés után 12-14 órával a vírusgyár szinte az összes szabad helyet elfoglalja a sejtben, majd 18-20 óra elteltével a legtöbb sejt lizálódik , és új virionok szabadulnak fel [3] .

Filogenetika és kapcsolatok

A DNS polimeráz B család génszekvenciájára épülő filogenetikai fa szerint a , a Kaumoebavirus , a Faustovirus és az Asfarviridae monofiletikus kládot alkotnak . Úgy tűnik, ezeknek a vírusoknak volt közös őse . A fő kapszidfehérjét kódoló lókusz szekvenciája közelebb hozza a Pacmanvirust az Asfarviridae -hoz , de a virion architektúrája közelebb áll a Faustovíruséhoz [6] .  

Jegyzetek

  1. ↑ A taxont a Vírusok Taxonómiájának Nemzetközi Bizottsága (ICTV) nem ismeri el.
  2. ↑ Vírusok taxonómiája a Vírusok  Taxonómiájának Nemzetközi Bizottsága (ICTV) honlapján .
  3. ↑ 1 2 3 4 Reteno DG , Benamar S. , Khalil JB , Andreani J. , Armstrong N. , Klose T. , Rossmann M. , Colson P. , Raoult D. , La Scola B. Faustovirus, egy aszfarvírussal kapcsolatos újdonság amőbákat fertőző óriási vírusok leszármazottja.  (angol)  // Journal Of Virology. - 2015. - július ( 89. évf. , 13. sz.). - P. 6585-6594 ​​. - doi : 10.1128/JVI.00115-15 . — PMID 25878099 .
  4. ↑ Faustovirus keresése az ICTV adatbázisban (lefelé irányuló kapcsolat) . Letöltve: 2018. november 11. Az eredetiből archiválva : 2013. október 4.. 
  5. ↑ 1 2 Klose T. , Reteno DG , Benamar S. , Hollerbach A. , Colson P. , La Scola B. , Rossmann MG Structure of faustovirus, a large dsDNS virus.  (angol)  // Az Amerikai Egyesült Államok Nemzeti Tudományos Akadémiájának közleménye. - 2016. - május 31. ( 113. évf. , 22. sz.). - P. 6206-6211 . - doi : 10.1073/pnas.1523999113 . — PMID 27185929 .
  6. ↑ Andreani J. , Khalil JYB , Sevvana M. , Benamar S. , Di Pinto F. , Bitam I. , Colson P. , Klose T. , Rossmann MG , Raoult D. , La Scola B. Pacmanvirus, a New Giant Icosahedral Vírus az Asfarviridae és a Faustovírusok kereszteződésében.  (angol)  // Journal Of Virology. - 2017. - július 15. ( 91. évf. , 14. sz.). - doi : 10.1128/JVI.00212-17 . — PMID 28446673 .