Dokkoló@Home

Dokkoló@Home

Grafika a kliens szoftverből
Típusú Elosztott számítástechnika
Operációs rendszer Többplatformos szoftver
Hardver platform x86
legújabb verzió • Charmm 34a2: 6,23
Állapot Lezárás 2014.05.23
Weboldal dokkoló.cis.udel.edu
 Médiafájlok a Wikimedia Commons oldalon
Dokkoló@Home
Felület BOINC
Szoftverletöltés mérete 7,7 MB
Munkaadatok betöltött mérete 1,2 MB
Az elküldött munkaadatok mennyisége 75-100 KB
Lemezterület _ 11 MB
Felhasznált memória mennyisége 169 MB
GUI van
Átlagos feladat számítási idő 5,5 óra
határidő 14 nap
GPU használatának képessége Nem
 Médiafájlok a Wikimedia Commons oldalon

A Docking@Home  egy önkéntes számítástechnikai projekt, amelyet a BOINC platform hajt . A projektnek a Delaware Egyetem ad otthont . A projekt fő célja a potenciális gyógyszerek fehérjékkel való kölcsönhatásának modellezése ( dokkolás ). [1] Április 7-én a Docking@Home vezetősége bejelentette, hogy a projektet 2014. május 23-án lezárták. [2]

Dokkolás

A molekuláris dokkolás olyan ligandum-fehérje komplexek keresése, amelyek minimális szabad energiával rendelkeznek, vagyis olyanok, amelyek komponensei optimálisan „illenek” egymáshoz. Az ilyen komplexumok keresése jól párhuzamosított feladat , ezért alkalmas elosztott számításra. [3] A Docking@Home projektben a ligandum fehérjekötő helyhez való kötődésének modellezése a CHARMM szoftvermodul segítségével történik . A folyamat több független kísérletből áll, eltérő térbeli orientációval és ligandumkonformációval . [egy]

Projekt részletei és statisztikák

Tudományos eredmények

Jegyzetek

  1. 1 2 http://ieeexplore.ieee.org/xpl/freeabs_all.jsp?arnumber=4228396 Archiválva 2014. március 27-én a Wayback Machine -nél pdf Archiválva : 2010. június 10-én a Wayback Machine -nél
  2. Projektzárási hírek Archivált 2014. október 17.
  3. Stephen Childs; Luc Bouge; Martti Forsell; Traff, Jesper; Achim utca; Ziegler, Wolfgang; Alexander, Michael Van Cleave. Euro-Par 2007 Workshopok: Párhuzamos feldolgozás: HPPC 2007, UNICORE Summit 2007 és VHPC 2007, Rennes, Franciaország, 2007. augusztus 28-31., Válogatott dokumentumok átdolgozása (előadásjegyzetek a számítástechnikából  ) . - Berlin: Springer, 2008. - P. 85. - ISBN 3-540-78472-1 .

Lásd még

Linkek