CHD4

A DNS-kötő protein 4 helikáz kromodomén  egy olyan enzim , amelyet emberben a CHD4 gén kódol . [1] [2] [3]

Ennek a génnek a terméke az SNF2/RAD54 helikáz családba tartozik. A nukleoszómális remodelling és a deacetiláz komplex fő összetevője, és fontos szerepet játszik az epigenetikai transzkripciós represszióban . A dermatomyositisben szenvedő betegek antitesteket termelnek e fehérje ellen. [3]

Interakciók

A CHD4-ről kimutatták, hogy kölcsönhatásba lép a HDAC1 -vel , [4] [5] [6] hiszton-dezacetiláz 2 -vel , [7] [8] [6] MTA2 -vel , [4] SATB1 -vel [9] és ATR -rel . [nyolc]

Jegyzetek

1. ↑ Seelig HP, Moosbrugger I., Ehrfeld H., Fink T., Renz M., Genth E. A fő dermatomyositis-specifikus Mi-2 autoantigén egy feltételezett helikáz, amely részt vesz a transzkripciós aktivációban  //  Arthritis Rheum : folyóirat. - 1995. - november ( 38. évf. , 10. sz.). - P. 1389-1399 . - doi : 10.1002/art.1780381006 . — PMID 7575689 .
2. ↑ Seelig HP, Renz M., Targoff IN, Ge Q., Frank MB A dermatomyositis-specifikus Mi-2 autoantigén fő antigén fehérjéjének két formája  //  Arthritis Rheum : folyóirat. - 1996. - november ( 39. évf. , 10. sz.). - P. 1769-1771 . - doi : 10.1002/art.1780391029 . — PMID 8843877 .
3. ↑ 1 2 Entrez-gén: CHD4 kromodomén-helikáz DNS-kötő fehérje 4 . (határozatlan)
4. ↑ 1 2 Yao, Ya-Li; Yang Wen Ming. A metasztázishoz kapcsolódó 1. és 2. fehérje különálló fehérjekomplexeket alkot hiszton-dezacetiláz aktivitással  //  J. Biol. Chem.  : folyóirat. - Egyesült Államok, 2003. - október ( 278. kötet , 43. szám ). - P. 42560-42568 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M302955200 . — PMID 12920132 .
5. ↑ Grozinger, CM; Hassig C.A.; Schreiber S L. Három fehérje határozza meg az élesztő Hda1p-hez kapcsolódó humán hiszton-dezacetilázok osztályát  (angol)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : Journal. - EGYESÜLT ÁLLAMOK, 1999. - április ( 96. köt. , 9. sz.). - P. 4868-4873 . — ISSN 0027-8424 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.4868 . — PMID 10220385 .
6. ↑ 12 Tong , JK; Hassig C.A.; Schnitzler GR; Kingston RE; Schreiber S L. Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodeling complex  (angol)  // Nature  : Journal. - ANGOLORSZÁG, 1998. - október ( 395. köt. , 6705. sz.). - P. 917-921 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
7. ↑ Hakimi, Mohamed-Ali; Dong Yuanshu; Lane William S; Speicher David W; Shiekhattar Ramin. Az X-kapcsolt mentális retardációs gén jelölt a hiszton-deacetilázt tartalmazó komplexek új családjának alkotóeleme  //  J. Biol. Chem.  : folyóirat. - Egyesült Államok, 2003. - február ( 278. kötet , 9. szám ). - P. 7234-7239 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
8. ↑ 12 Schmidt, D.R .; Schreiber S L. Molekuláris asszociáció az ATR és a nukleoszóma-átalakítási és dezacetilező komplex két komponense, a HDAC2 és a CHD4 között  //  Biochemistry : Journal. - EGYESÜLT ÁLLAMOK, 1999. - November ( 38. köt. , 44. sz.). - P. 14711-14717 . — ISSN 0006-2960 . - doi : 10.1021/bi991614n . — PMID 10545197 .
9. ↑ Yasui, Dag; Miyano Masaru, Cai Shutao, Varga-Weisz Patrick, Kohwi-Shigematsu Terumi. A SATB1 a kromatin átalakítását célozza meg a gének nagy távolságra történő szabályozására  // Nature  :  Journal. - Anglia, 2002. - október ( 419. kötet , 6907. sz.). - P. 641-645 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/nature01084 . — PMID 12374985 .

Irodalom

• Denslow SA, Wade PA Az emberi Mi-2  / NuRD komplex és génszabályozás  // Onkogén. - 2007. - Vol. 26 , sz. 37 . - P. 5433-5438 . - doi : 10.1038/sj.onc.1210611 . — PMID 17694084 .
• Ge Q., Nilasena DS, O'Brien CA, et al. A Mi-2 autoantigén 240 kD fehérje fő antigén régiójának molekuláris elemzése  //  J. Clin. Invest. : folyóirat. - 1995. - 1. évf. 96 , sz. 4 . - P. 1730-1737 . - doi : 10.1172/JCI118218 . — PMID 7560064 .
• Woodage T., Basrai MA, Baxevanis AD, et al. A CHD fehérjék családjának jellemzése  (angol)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : Journal. - 1997. - 1. évf. 94 , sz. 21 . - P. 11472-11477 . - doi : 10.1073/pnas.94.21.11472 . — PMID 9326634 .
• Zhang Y., LeRoy G., Seelig HP és munkatársai. A dermatomyositis-specifikus autoantigén Mi2 egy hiszton-deacetilázt és nukleoszóma-remodelling aktivitást tartalmazó komplex komponense  (angol)  // Cell  : Journal. - Cell Press , 1998. - Vol. 95 , sz. 2 . - 279-289 . o . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)81758-4 . — PMID 9790534 .
• Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR és mtsai. Kromatin dezacetiláció egy ATP-függő nukleoszóma-remodelling komplex által  (angol)  // Nature : Journal. - 1998. - Vol. 395 , sz. 6705 . - P. 917-921 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
• Zhang Y., Ng HH, Erdjument-Bromage H. és mtsai. A NuRD alegységek elemzése hiszton-deacetiláz magkomplexet és a DNS-metilációval való kapcsolatot tár fel  // Genes Dev  .  : folyóirat. - 1999. - 1. évf. 13 , sz. 15 . - P. 1924-1935 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
• Schmidt DR, Schreiber SL Molekuláris asszociáció az ATR és a nukleoszóma-remodelling és deacetilating komplex két komponense, a HDAC2 és a CHD4 között  (angolul)  // Biokémia : folyóirat. - 1999. - 1. évf. 38 , sz. 44 . - P. 14711-14717 . - doi : 10.1021/bi991614n . — PMID 10545197 .
• Humphrey GW, Wang Y., Russanova VR és munkatársai. Stabil hiszton-dezacetiláz komplexek, amelyeket a SANT domén-fehérjék, a CoREST/kiaa0071 és az Mta-L1 jelenléte különböztet meg  //  J. Biol. Chem.  : folyóirat. - 2001. - 20. évf. 276. sz . 9 . - P. 6817-6824 . - doi : 10.1074/jbc.M007372200 . — PMID 11102443 .
• Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, et al. A humán nucleolus irányított proteomikai elemzése  (angol)  // Curr. Biol.  : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 12 , sz. 1 . - P. 1-11 . - doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . — PMID 11790298 .
• Koipally J., Georgopoulos K. Az Ikaros repressziós áramkörének molekuláris boncolása  //  J. Biol. Chem.  : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 277. sz . 31 . - P. 27697-27705 . - doi : 10.1074/jbc.M201694200 . — PMID 12015313 .
• Saito M., Ishikawa F. A humán MBD3 mCpG-kötő doménje nem kötődik az mCpG-hez, hanem kölcsönhatásba lép a NuRD/Mi2 HDAC1 és MTA2 komponenseivel  //  J. Biol. Chem.  : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 277. sz . 38 . - P. 35434-35439 . - doi : 10.1074/jbc.M203455200 . — PMID 12124384 .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH és mtsai. Több mint 15 000 teljes hosszúságú emberi és egér cDNS-szekvencia előállítása és kezdeti elemzése  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : Journal  . - 2003. - 1. évf. 99 , sz. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
• Hakimi MA, Dong Y., Lane WS és mtsai. Az X-kapcsolt mentális retardációs gén jelölt a hiszton-deacetilázt tartalmazó komplexek új családjának alkotóeleme  //  J. Biol. Chem.  : folyóirat. - 2003. - 1. évf. 278. sz . 9 . - P. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
• Kwan AH, Gell DA, Verger A., ​​et al. Fehérje állvány tervezése PHD  ujjból (neopr.)  // Szerkezet. - 2004. - T. 11 , 7. sz . - S. 803-813 . - doi : 10.1016/S0969-2126(03)00122-9 . — PMID 12842043 .
• Shimono Y., Murakami H., Kawai K. és mtsai. A Mi-2 béta a BRG1 és RET ujjfehérjével társul a különböző régiókban, transzkripciót aktiváló és elnyomó képességekkel  //  J. Biol. Chem.  : folyóirat. - 2004. - 20. évf. 278. sz . 51 . - P. 51638-51645 . - doi : 10.1074/jbc.M309198200 . — PMID 14530259 .
• Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T. és mtsai. 21 243 teljes hosszúságú humán cDNS teljes szekvenálása és jellemzése   // Nat . Közönséges petymeg.  : folyóirat. - 2004. - 20. évf. 36 , sz. 1 . - P. 40-5 . - doi : 10.1038/ng1285 . — PMID 14702039 .
• Williams CJ, Naito T., Arco PG és mtsai. A kromatin átalakító Mi-2beta szükséges a CD4 expressziójához és a T-sejtek fejlődéséhez  //  Immunity : Journal. - Cell Press , 2004. - Vol. 20 , sz. 6 . - P. 719-733 . - doi : 10.1016/j.immuni.2004.05.005 . — PMID 15189737 .
• Lehner B., Sanderson CM A protein interakciós keretrendszer a humán mRNS degradációhoz  // Genome Res  . : folyóirat. - 2004. - 20. évf. 14 , sz. 7 . - P. 1315-1323 . - doi : 10.1101/gr.2122004 . — PMID 15231747 .