BioRxiv

bioRxiv
URL biorxiv.org
Kereskedelmi Nem
Webhely típusa A tudomány
nyelvek) angol
Tulajdonos Laboratórium a Cold Spring Harborban
Szerző Richard North, John Inglis
A munka kezdete 2013. november  ( 2013-11 )
Ország

A bioRxiv (ejtsd: bio(a)rhiv) egy ingyenes elektronikus archívum, amely biológiával kapcsolatos tudományos közleményeket és előnyomatokat tartalmaz, amelyet 2013-ban hoztak létre a Cold Spring Harbor Laboratory munkatársai, Richard Sever és John Inglis, hasonlóan a már népszerű arXiv.org -hoz .

A szerzők korábban át nem vizsgált tanulmányokat tesznek közzé a bioRxiv- ről, hogy visszajelzést kapjanak a portál többi tagjától, vagy hogy erősítsék a felfedezés elsőbbségét. A kéziratokat megjelenés előtt nem nézik át, de a moderátorok először ellenőrzik, hogy nem tartalmaznak-e plágiumot. A szerzők mintegy 30%-a a beérkezett hozzászólások alapján utólag szerkesztett változatot tesz közzé a portálon. Ennek eredményeként a bioRxiv-hez benyújtott kéziratok többsége lektorált folyóiratokban jelenik meg.

2021 novemberéig több mint 140 000 mű került fel a portálra.

Történelem

A BioRxiv az online preprint adattárak népszerűsége nyomán indult, amelyek közül az elsőt Paul Ginsparg, a Los Alamos National Laboratory fizikusa hozta létre 1991-ben, az ArXiv.org portál (ejtsd: [archív]). Mire az arXiv létrejött, a fizika területén az előnyomatok megosztásának gyakorlata már meglehetősen gyakori volt – a kutatók sikeresen elküldték egymásnak a kísérletekről szóló kiadatlan jelentéseiket vagy a dolgozatok vázlatváltozatait, mielőtt a folyóiratban megjelentek. Egy ilyen csere lehetővé tette, hogy ne csak észrevételeket és kritikákat kapjunk a kollégáktól az áttekintés előtt, hanem az adatok megkettőzésének megakadályozását vagy a felfedezés elsőbbségének megszilárdítását is [2] [3] . Az arXiv hamarosan széles körű népszerűségre tett szert, és 2021 júliusára körülbelül 1,9 millió mű került fel az oldalra [4] .

Kezdetben az arXiv.org kizárólag a fizika területéről fogadott el dolgozatokat, de a más tudományágak iránti kereslet növekedésével a Ginsparg 2003-ban kezdeményezte egy külön szekció létrehozását a kvantitatív biológia preprintek letöltésére, beleértve a biológiai statisztikákat , bioinformatikát , populációt . biológia . Ezzel egy időben a PeerJ nyílt hozzáférésű folyóirat külön rovatot nyitott a biológia előnyomatainak . Azonban annak ellenére, hogy ezek a rovatok egyre népszerűbbek a tárhelyekben (az arXiv-ben tárolt biológiai tanulmányokat később a Nature és a PLOS Biology publikálták ), a portálok nem törekedtek arra, hogy tovább bővítsék a művek publikálási lehetőségeit ezen a területen [5] [6]. .

2013-ban Richard Sever, a Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL) molekuláris biológusa John Inglis kollégájával közösen elindított egy hasonló arXiv portált bioRxiv néven, amelyet a HighWire [ [7] [5] üzemeltet . A BioRxiv formálisan a CSHL-hez csatlakozott [8] , és fő célja az volt, hogy felgyorsítsa az ismeretek terjesztését, és lehetőséget biztosítson kritikai megjegyzésekre és visszajelzésekre a még nem publikált biológiával kapcsolatos munkákkal kapcsolatban [9] . Csak a működés első évében 800 előnyomat [10] került fel a portálra , a 2013-tól 2016-ig tartó időszakra összesen pedig mintegy 3000 mű [11] . 2019-re számuk 40 000 -re nőtt [12] . 2021 novemberéig a portál több mint 140 000 előnyomat adatait tartalmazza [13] .

2016-ban a bioRxiv megállapodást írt alá a Biophysical Journal , ELife , The EMBO Journal , EMBO Molecular Medicine , EMBO Reports , G3: Genes, Genomes, Genetics , Molecular Systems Biology cégekkel , amely szerint a portálon közzétett előnyomatok szerzői közvetlenül a bioRxiv-en keresztül nyújthatják be cikkeiket felülvizsgálatra, anélkül, hogy újra fel kellene tölteniük a fájlokat és újra meg kellene adniuk az információkat a folyóirat honlapján [11] .

A bioRxiv tanácsadó testületébe tartozik többek között az arXiv alkotója, Paul Ginsparg és a Google Academy társalapítója, Anurag Acharya [9] .

Hogyan működik

Csak azok a kéziratok helyezhetők el a bioRxiv-en, amelyeket korábban nem publikáltak tudományos folyóiratokban, és amelyek nem estek át szakértői értékelésen. A cikk publikálásakor a szerzők újnak minősíthetik munkájukat, megerősíthetik vagy cáfolhatják a meglévő tudományos kutatásokat, és választhatnak egyet a 26 tematikus kategória közül. A cikk beküldése után a moderátorok ellenőrzik, hogy nincs-e benne sértő vagy tudománytalan tartalom, de magát a szöveget nem szerkesztik vagy nézik át. A cikkek általában a feltöltés után néhány órán belül nyilvánosak [14] . Ezt követően a kutatók közzétehetik a munka átdolgozott változatait, vagy linkeket adhatnak hozzá a preprint folyóirat publikációihoz [9] .

Minden előnyomathoz hozzá van rendelve egy DOI , amely más altmetrikus és PDF letöltési számadatokkal együtt minden felhasználó számára elérhető. Amikor egy előnyomatot cikkként tesznek közzé egy tudományos folyóiratban, a bioRxiv frissíti a régi verziót a kiadványra mutató hivatkozással. A bioRxiv-ről szóló cikkeket a Google keresőmotorja és a Google Scholar indexeli, de nem szerepelnek a PubMed rendszerben , amely csak lektorált anyagokat tárol [14] .

2016-ban a bioRxiv-ről publikált cikkek többsége az evolúcióbiológia , a genetika és a genomika témakörében jelent meg [14] .

A BioRxiv a biológiakutatás minden aspektusát lefedő, előzetesen nyomtatott cikkeket elfogad. A cikk közzétételekor a szerző a következő kategóriák egyikébe utalja azt [15] :

Befolyás

2019-ben a kutatók 7087, a bioRxiv-hez benyújtott papírt elemeztek, és összehasonlították az altmetriás méréseket a nem letétbe helyezett papírokkal. Az eredmények azt mutatták, hogy a bioRxiv-ben megjelent előnyomatokat átlagosan 36%-kal gyakrabban idézték, és 49%-kal magasabb altmetrikus értékekkel rendelkeztek [16] . A kapott adatok azt mutatják, hogy az előnyomatok közzétételének hosszú távú pozitív hatása van az idézetek számára, és nem csak a megjelenésük arányára, amint azt korábban az arXiv.org oldalon közzétett cikkek elemzése is bebizonyította [16] [17]. [16] .

A bioRxiv-en közzétett preprintek körülbelül 30%-a publikálatlan marad a folyóiratokban – hasonló adatokat kaptunk az arXiv publikációs tevékenységének elemzésekor. Ugyanakkor a bioRxiv később publikált preprintjeinek csaknem fele megjelenik az Elsevier , Nature , Public Library of Science és az Oxford University Press folyóiratokban [12] . A BioRxiv a legnépszerűbb az Egyesült Államok és az Egyesült Királyság kutatói körében, Kínában , Oroszországban és Törökországban sokkal kevésbé népszerű [18] .

Jegyzetek

  1. ↑ WorldCat  (pl.) - 1971.
  2. ↑ Pinfield, 2001 .
  3. ↑ Vivienne Bachelet. Mik azok az előnyomatok? . Medwave (2017). Letöltve: 2021. május 1. Az eredetiből archiválva : 2021. május 11.
  4. ↑ Havi beküldések . Cornell Egyetem. Hozzáférés időpontja: 2021-04-37. Archiválva : 2021. május 7.
  5. ↑ 1 2 Ewen Callaway. Az előnyomatok életre kelnek . Természet (2013. november 12.). Letöltve: 2021. július 2. Az eredetiből archiválva : 2021. december 15.
  6. ↑ Ewen Callaway. A genetikusok szem előtt tartják az arXiv potenciálját . Természet (2012. július 31.). Letöltve: 2021. június 29. Az eredetiből archiválva : 2021. augusztus 11.
  7. ↑ HighWire 25 évesen: Richard Sever (bioRxiv) visszatekint . High Wire (2020. augusztus 12.). Letöltve: 2021. július 5. Az eredetiből archiválva : 2021. július 9..
  8. ↑ A biológia előnyomtatási szervere . CSHL (2013. november 12.). Letöltve: 2021. július 3. Az eredetiből archiválva : 2021. július 9.
  9. ↑ 1 2 3 Jocelyn Kaiser. Az új Preprint szerver célja, hogy a biológusok válasza legyen a fizikusok arXiv kérdésére . Tudomány (2013. november 12.). Letöltve: 2021. június 28. Az eredetiből archiválva : 2021. július 9.
  10. ↑ Jocelyn Kaiser. BioRxiv 1 évesen: Ígéretes kezdet . Tudomány (2014. november 11.). Letöltve: 2021. június 29. Az eredetiből archiválva : 2021. július 28.
  11. ↑ 1 2 bioRxiv előnyomat most közvetlenül beküldhető vezető kutatási folyóiratokhoz . Fizika org (2016. január 15.). Letöltve: 2021. június 29. Az eredetiből archiválva : 2018. március 18.
  12. ↑ Anderson 12. , 2019 .
  13. ↑ Minden cikk . BioRxiv. Letöltve: 2021. november 22. Az eredetiből archiválva : 2021. november 21.
  14. ↑ 1 2 3 John Sever. bioRxiv: előrehaladási jelentés . ASAPbio. Letöltve: 2021. június 29. Az eredetiből archiválva : 2021. július 9.
  15. ↑ A bioRxiv-ről . bioRxiv. Letöltve: 2021. július 3. Az eredetiből archiválva : 2018. december 1..
  16. ↑ 1 2 3 Fraser, 2020 , p. 618-636.
  17. ↑ Gemma Conroy. Az előnyomatok növelik a cikkek hivatkozásait és említéseit . Természeti Index (2019. július 9.). Letöltve: 2021. július 3. Az eredetiből archiválva : 2021. július 9.
  18. ↑ Abdill, 2020 .

Irodalom

Linkek

  Ugrás a Wikidata elemre  A közösségi hálózatokon
Tematikus oldalak