Serpin
A serpinek ( an . Serpins , az angol szerin proteáz inhibitorok rövidítése , „szerin proteáz inhibitorok”) olyan fehérjék csoportja, amelyek bizonyos szerkezeti hasonlóságot mutatnak egymással, és amelyek közül sok gátolja a szerin proteázokat , vagyis azokat a proteázokat , amelyekben szerin található. aktív központ .
Bevezetés
Kezdetben ez a kifejezés a fehérjék egy osztályát jelöli, amelyek specifikusan gátolnak bizonyos szerin proteázokat (például az antitrombin egy szerpin, amely specifikusan gátolja a szerin proteáz trombint ). Később azonban kiderült, hogy egyes, a szerpinekhez szerkezetileg hasonló fehérjék nem rendelkeznek gátló hatással (például a fő tojásfehérje fehérje, az ovalbumin ), de ezek is a szerpinek közé tartoznak.
Osztályozás
2001 - ben megjelent a szerpinek osztályozása, amely szerint 500 serpinnek minősített fehérjét 16 kládra ( egy prekurzorból származó csoportra) osztottak. Lásd (Silverman et al.) Bibliográfia.
Az osztály fő képviselői
A következő fehérjék tartoznak a serpinek osztályába:
- Szerin proteázok:
- alfa-antitripszin ;
- alfa antikimotripszin ;
- alfa-antiplazmin ( fibrinolízis inhibitor );
- antitrombin (a véralvadás gátlója , különösen a X - es faktor, a IX -es faktor és a trombin ;
- C1 inhibitor ;
- Neuroserpin ;
- plazminogén aktivátor-1 inhibitor és plazminogén aktivátor-2 gátló ( fibrinolízis inhibitor );
- Protein Z-szerű proteáz inhibitor (ZPI, inaktiválja a X és a XI faktort )
Bibliográfia
- Silverman GA, Bird PI, Carrell RW, Church FC, Coughlin PB, Gettins PG, Irving JA, Lomas DA, Luke CJ, Moyer RW, Pemberton PA, Remold-O'Donnell E, Salvesen GS, Travis J, Whisstock JC. A szerpinek szerkezetileg hasonló, de funkcionálisan változatos fehérjék bővülő szupercsaládja. Evolúció, gátlási mechanizmus, új funkciók és átdolgozott nómenklatúra. J. Biol. Chem. 2001; 276:33293-6. PMID 11435447 .
- Gettins PGW. Serpin szerkezete, mechanizmusa és működése . Chem Rev 2002;102:4751-803. DOI 10.1021/cr010170+ .
- Irving JA, Steenbakkers PJ, Lesk AM, Op den Camp HJ, Pike RN, Whisstock JC. Serpinek prokariótákban. Mol Biol Evol. 2002. nov., 19(11):1881-90. PMID 12411597 .
- Irving JA, Pike RN, Lesk AM, Whisstock. A Serpin szupercsalád törzsfejlődése: Az aminosavak megőrzésének mintázatainak hatása a szerkezetre és a működésre. Genome Res. 2000; tíz; 1845-64. PMID 11116082 .