Proteobaktériumok

Az oldal jelenlegi verzióját még nem ellenőrizték tapasztalt közreműködők, és jelentősen eltérhet a 2021. január 28-án felülvizsgált verziótól ; az ellenőrzések 4 szerkesztést igényelnek .
Proteobaktériumok

Escherichia coli
tudományos osztályozás
Tartomány:baktériumokTípusú:Proteobaktériumok
Nemzetközi tudományos név
Proteobaktériumok Stackebrandt et al. 1986
Alcsoportok

Acidithiobacilla

  • Acidithiobacillales

Alfaproteobaktériumok
(Alfa proteobaktériumok)

  • Caulobacterales
  • Kopriimonadales
  • Kordiimonadales
  • Parvularculales
  • Rhizobiales
  • Rhodobacterales
  • Rhodospirillales
  • Rickettsiales
  • Sneathiellales
  • Sphingomonadales

Béta- proteobaktériumok
(béta-proteobaktériumok)

  • Burkholderiales
  • Hidrogenofilák
  • metilofilek
  • Neisseriales
  • Nitrosomonadales
  • Rhodocyclales
  • Procabacteriales

Gammaproteobaktériumok
(Gamma proteobaktériumok)

  • Aeromonadales
  • Alteromonadales
  • Cardiobacteriales
  • Chromatiales
  • Enterobaktériumok
  • Legionellales
  • Methylococcusok
  • Oceanospirillales
  • Pasteurellales
  • Pseudomonadales
  • Thiotrichales
  • Vibrionales
  • Xanthomonadales

Deltaproteobaktériumok
(Delta proteobaktériumok)

  • Bdellovibrionales
  • Desulfarculales
  • Desulfobacterales
  • Desulfovibrionales
  • Desulfurellales
  • Desulfuromonadales
  • Myxococcales
  • Syntrophobacterales

Epszilonproteobaktériumok
(Epszilon-proteobaktériumok)

  • Campylobacterales
  • Nautiliales

Zetaproteobaktériumok
(Zeta-proteobaktériumok)

  • Mariprofundales

Oligoflexia

  • Oligoflexales

A proteobaktériumok ( lat.  Proteobacteria ) a baktériumok legnagyobb csoportja – 1534 faj , vagyis az összes ismert baktériumfaj körülbelül egyharmada [1] .

A proteobaktériumok egy nagyon heterogén csoport, ebbe a csoportba tartoznak mind az eukarióta szimbionták , mind a nagyszámú patogén és opportunista mikroorganizmus , foto- és kemotróf baktériumfajták, autotrófok és heterotrófok egyaránt . Minden proteobaktérium gram-negatív , külső membránjuk lipopoliszacharidból épül fel . A csoportba tartoznak az obligát és fakultatív aerob és anaerob baktériumok is. A mozgás típusai is eltérőek, a csoportba tartoznak mind a flagellával rendelkező baktériumok , mind a mozgásképtelen baktériumok és az ún. "csúszó" típusú mozgás.

Morfológiailag is heterogén a csoport: ide tartoznak a rúd alakú baktériumok és a coccusok , valamint a spirál alakú baktériumok.

Carl Woese 1987-ben kiemelte ezt a csoportot, és viccesen "lila baktériumoknak és rokonaiknak" nevezte [2] . A csoportot az ókori görög Proteus istenről elnevezett 16S rRNS nukleotidszekvenciák elemzése alapján izolálták , aki tudta, hogyan változtassa meg az alakját tetszés szerint (a proteobaktériumok neve az e csoportban rejlő biokémiai, fiziológiai és morfológiai tulajdonságok széles skáláját tükrözi ).

A bakteriális nómenklatúra szabályai alapján a Proteobacterium taxon illegitim, mivel nincs meghatározott típusú alsó taxon [3] .

Taxonómia

A proteobaktériumokat osztályokra osztják , amelyeket a görög ábécé betűivel jelölnek: alfa- , béta- , gamma- , delta- és epszilonproteobaktériumok . Az osztályokra bontás is a 16S rRNS elemzése alapján történt . Az alfa-, béta-, delta- és epsilon-proteobaktérium-osztályok monofiletikusak [4] [5] [6] . Az Acidithiobacillus nemzetség a Gammaproteobacteria  osztályból 2013 -ban került át az Acidithiobacillus osztályba [ 7] . A legújabb adatok szerint ez a nemzetség a béta-proteobaktériumokat tekintve parafiletikus [8] . Viszonylag a közelmúltban írták le a hatodik osztályt - a zéta-proteobaktériumot ( Zetaproteobacteria ), amelynek képviselője eddig az egyetlen faj (tiszta kultúrában izolált) - a Mariprofundus ferrooxydans [9] , egy vasoxidáló neutrofil kemolitoautotróf, amelyet először a Loihi vulkán közelében fedeztek fel ben. 1996 [10] .

Alfa proteobaktériumok

Az alfa-proteobaktériumok osztályába nagyszámú fototróf tartozik, ide tartoznak még az eukarióták szimbiontái ( Rhizobium ), az obligát intracelluláris paraziták ( Rickettsia , Wolbachia ), az ecetsavbaktériumok ( Acetobacter , Gluconacetobacter ), az alkoholos fermentációra képes baktériumok ( Zymomonas mobilizációra ) , metilotrófok ( Methylobacteriaceae ) . A mitokondriumok feltételezett őse is ebből a csoportból származik.

Béta-proteobaktériumok

Ebbe az osztályba tartoznak az aerob és fakultatív anaerob baktériumok. Ez magában foglalja mind a kemoorganoheterotrófokat, mind a kemolitoautotrófokat (pl. az I. stádiumú nitrifikátorok Nitrosomonadaceae , a tiobaktériumok Thiobacillus ), a fototróf nemzetségeket ( Rhodocyclus és Rubrivivax ). Ebbe a csoportba tartoznak a fertőző ágensek is: Burkholderia mallei ( takonykór kórokozója ) és Burkholderia pseudomallei ( melioidózis kórokozója ), Bordetella pertussis ( szamárköhögés kórokozója ) és a Neisseria nemzetség ( agyhártyagyulladás és gonorrhoea kórokozói ).

Gamma proteobaktériumok

Ebbe az osztályba tartoznak mind a fototróf baktériumok (például Chromatium  -lila kénmentes baktériumok), a metanotrófok (például Methylococcus capsulatus ), mind a klinikai és tudományos jelentőségű baktériumok - az Enterobacteriaceae , Vibrionaceae , Pseudomonadaceae , Francisella Passellaceae és Legionteellaceae családok . Ebbe a csoportba tartoznak a különösen veszélyes fertőzések kórokozói: Yersinia pestis , Francisella tularensis , Haemophilus influenzae , Legionella pneumophila és Vibrio cholerae , valamint egy olyan tudományos szempontból fontos modellszervezet, mint az Escherichia coli .

Delta-proteobaktériumok

Ebbe a csoportba tartoznak az olyan jól ismert baktériumok, mint a sikló mozgásra és többsejtű termőtestek kialakítására képes myxobaktériumok , valamint a jól ismert szulfátredukáló baktériumok ( Desulfovibrio , Desulfobacter , Desulfococcus , Desulfonema ) és kénbaktériumok ( Desulfuromonas ). Ide tartoznak az anaerob vasbaktériumok ( Geobacter ) is. Ide tartoznak a Bdellovibrio nemzetségbe tartozó ismert ragadozóbaktériumok, a Lawsonia nemzetség obligát intracelluláris baktériumai, a Hippea nemzetség kemolitotrófjai is , amelyek ként és hidrogént képesek energiaforrásként használni. Az osztályba aerob és anaerob baktériumok egyaránt beletartoznak, fakultatív anaerobok ebben az osztályban nem ismertek. A legtöbb anaerob képes szervetlen elektronakceptorokat használni , így anaerob légzést végez . Az osztály képviselői fontos szerepet játszanak a természet elemeinek körforgásában .

Epsilon Proteobacteria

Ide tartozik a Campylobacterales rend a Campylobacteraceae és Helicobacteraceae családokkal , beleértve a geokémiailag fontos Sulfurospirillum nemzetséget [11] , az emberi fekélyek kórokozóját , a Helicobacter pylori -t . Ide tartoznak a Wolinella kérődzők emésztőrendszer szimbiontái is .

A proteobaktériumok törzsfejlődése

Jegyzetek

  1. ↑ A földi élet hálója, a proteobaktériumok . Letöltve: 2008. augusztus 16. Az eredetiből archiválva : 2008. október 11..
  2. ↑ Woese CR Bakteriális evolúció  //  Mikrobiológia és molekuláris biológia áttekintések. – Amerikai Mikrobiológiai Társaság, 1987. - 1. évf. 51 , sz. 2 . - P. 221-271 . — PMID 2439888 .
  3. ↑ A megrendelések nómenklatúrája: a Bakteriológiai Szabályzat (1990. évi felülvizsgálat) 15. és 21a. szabálya szerint szükséges javítások, valamint a megfelelő nómenklatúra típusának megjelölése ... (a hivatkozás nem elérhető) . Letöltve: 2008. augusztus 16. Az eredetiből archiválva : 2008. szeptember 7.. 
  4. ↑ Noel R. Krieg, Don J. Brenner, James T. Staley. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology: The Proteobacteria  (angol) . - Springer, 2005. - ISBN 978-0-387-95040-2 .
  5. ↑ Ciccarelli, F. D.; Doerks, T; Von Mering, C; Creevey, CJ; Snel, B; Bork, P. Egy nagy felbontású életfa automatikus rekonstrukciója felé  (angol)  // Science : Journal. - 2006. - Vol. 311 , sz. 5765 . - P. 1283-1287 . - doi : 10.1126/tudomány.1123061 . — PMID 16513982 .
  6. ↑ Yarza, P; Ludwig, W; Euzéby, J; Amann, R; Schleifer, KH; Glöckner, F.O.; Rosselló-Móra, R. Az All-Species Living Tree Project frissítése 16S és 23S rRNS szekvenciaelemzések alapján  //  Systematic and alkalmazott mikrobiológia : folyóirat. - 2010. - 20. évf. 33 , sz. 6 . - P. 291-299 . - doi : 10.1016/j.syapm.2010.08.001 . — PMID 20817437 . .
  7. ↑ Williams, KP; Kelly, DP Javaslat egy új osztályra a Proteobacteria törzsön belül, Acidithiobacillia classis nov., az Acidithiobacillales típusrenddel és a Gammaproteobacteria osztály módosított leírásával  //  International Journal of systematic and evolutionary microbiology : Journal. - 2013. - Kt. 63 , sz. 8. pont . - P. 2901-2906 . - doi : 10.1099/ijs.0.049270-0 . — PMID 23334881 .
  8. ↑ Williams, KP; Gillespie, JJ; Sobral, BWS; Nordberg, E.K.; Snyder, EE; Shallom, JM; Dickerman,  A.W. A gammaproteobaktériumok törzsfejlődése  // American Society for Microbiology. – Amerikai Mikrobiológiai Társaság, 2010. - 20. évf. 192. sz . 9 . - P. 2305-2314 . - doi : 10.1128/JB.01480-09 . — PMID 20207755 .
  9. ↑ Mariprofundus nemzetség  : [ eng. ]  // LPSN .
  10. ↑ Emerson D. , Moyer CL A neutrofil Fe-oxidáló baktériumok bőségesen fordulnak elő a Loihi Seamount hidrotermikus szellőzőnyílásainál, és jelentős szerepet játszanak a Fe-oxid-lerakódásban.  (angol)  // Alkalmazott és környezeti mikrobiológia. - 2002. - 20. évf. 68. sz. 6 . - P. 3085-3093. — PMID 12039770 .
  11. ↑ [https://web.archive.org/web/20080502223344/http://www.nature.com/nrmicro/journal/v4/n6/abs/nrmicro1414.html Archiválva : 2008. május 2. a Wayback Machine -nél A sokoldalú [epsi]-proteobaktériumok: kulcsszereplők a szulfidos élőhelyekben : Absztrakt : Nature Reviews Microbiology]

Lásd még

Linkek