Thermococcaceae

Thermococcaceae
Thermococcus gammatolerans
tudományos osztályozás
Tartomány:ArchaeaTípusú:EuryarchaeotesOsztály:Thermococci Zillig és Reysenbach 2002Rendelés:Thermococcales Zillig 1988Család:Thermococcaceae
Nemzetközi tudományos név
Thermococcaceae Zillig 1988
típusú nemzetség
Thermococcus Zillig 1983
Szisztematika a Wikifajtáknál Képek a Wikimedia Commons oldalon EZ   951477 NCBI   2259 EOL   7929

A Thermococcaceae  (lat.) ( Termococci ) az Euryarchaeota típusból származó archaeacsalád, a Thermococcales ( Thermococcales ) rendés a Thermococcusok [1] [ 2] osztályának egyetlen(a Protoarchaea Cavalier-Smith 2002 [3] szinonimája ). A család 3 nemzetséget, több mint 40 ismert fajt foglal magában, amivel a legnépesebb család az archaea tartományban. Valószínűleg a természetben létező ebbe az osztályba tartozó fajoknak csak egy kis részét tanulmányozták [4] .

Leírás

Jellemzőjük az optimális növekedésű nagyon magas hőmérséklet (80 °C felett), a semlegeshez közeli pH-érték (az optimális a legtöbb számára 6-8 tartományban van), valamint a tengervíz sótartalma. A leggyakoribb élőhelyek a víz alatti hidrotermikus szellőzők. A Thermococcus nemzetség képviselőit új-zélandi szárazföldi hidrotermákban is megtalálták. Jelenleg nincs információ a thermococcusok aerob és alacsony hőmérsékletű ökoszisztémákban, valamint magas vagy alacsony pH-jú környezetben való megtelepedéséről [4] .

Osztályozás

2017 júniusától a családba a következő taxonok tartoznak [1] [5] :

• A Palaeococcus Takai et al. 2000 [6]
  • Palaeococcus ferrophilus Takai et al. 2000 ( típusfaj )
  • Palaeococcus helgesonii Amend et al. 2006
  • Palaeococcus pacificus Zeng et al. 2013
• Pyrococcus Fiala és Stetter nemzetség 1986 [7]
  • Pyrococcus abyssi Erauso et al. 1993 – hiányzik az LPSN -ből
  • Pyrococcus endeavori - hiányzik az LPSN-ből
  • Pyrococcus furiosus Fiala és Stetter 1986 (típusfaj)
  • Pyrococcus glycovorans Barbier et al. 1999
  • Pyrococcus horikoshii González et al. 1999
  • Pyrococcus kukulkanii Callac et al. 2016
  • Pyrococcus woesei Zillig 1988
  • Pyrococcus yayanosii Birrien et al. 2011
• Thermococcus Zillig nemzetség 1983 [8]
  • Thermococcus acidaminovorans Dirmeier et al. 2001
  • Thermococcus aegaeus corrig. Arab et al. 2000
  • Thermococcus aggregans Canganella et al. 1998
  • Thermococcus alcaliphilus Keller et al. 1997
  • Thermococcus atlanticus Cambon-Bonavita et al. 2004
  • Thermococcus barophilus Marteinsson et al. 1999
  • Thermococcus barossii Duffaud et al. 2005
  • Thermococcus celer Zillig 1983 (típusfaj)
  • Thermococcus celericrescens Kuwabara et al. 2007
  • Thermococcus chitonophagus Huber és Stetter 1996
  • Thermococcus cleftensis Hensley et al. 2014
  • Thermococcus coalescens Kuwabara et al. 2005
  • Thermococcus eurythermalis Zhao et al. 2015
  • Thermococcus fumicolans Godfroy és Meunier 1996
  • Thermococcus gammatolerans Jolivet et al. 2003
  • Thermococcus gorgonarius Miroshnichenko et al. 1998
  • Thermococcus guaymasensis Canganella et al. 1998
  • Thermococcus hydrothermalis Godfroy et al. 1997
  • Thermococcus kodakarensis corrig. Atomi et al. 2005
  • Thermococcus litoralis Neuner et al. 2001
  • Thermococcus marinus - hiányzik az LPSN-ből
  • Thermococcus mexicalis - hiányzik az LPSN-ből
  • Thermococcus nautili Gorlas et al. 2014
  • Thermococcus onnurineus Bae et al. 2006 - hiányzik az LPSN-ből
  • Thermococcus pacificus Miroshnichenko et al. 1998
  • Thermococcus paralvinellae Hensley et al. 2014
  • Thermococcus peptonophilus González et al. 1996
  • Thermococcus piezophilus Dalmasso et al. 2016 - nem az LPSN-ben
  • Thermococcus prieurii Gorlas et al. 2013
  • Thermococcus profundus Kobayashi és Horikoshi 1995
  • Thermococcus radiotolerans - hiányzik az LPSN-ből
  • Thermococcus sibiricus Miroshnichenko et al. 2001
  • Thermococcus siculi Grote et al. 2000
  • Thermococcus stetteri Miroshnichenko 1990
  • Thermococcus thioreducens Pikuta et al. 2007
  • Thermococcus waimanguensis - hiányzik az LPSN-ből
  • Thermococcus waiotapuensis González et al. 2001
  • Thermococcus zilligii Ronimus et al. 1999

Jegyzetek

1. ↑ 1 2 Domének és törzsek osztályozása - Prokarióták (baktériumok) hierarchikus osztályozása : 2.0 verzió  : [ eng. ]  // LPSN. - 2016. - október 2.
2. ↑ Taxonómia böngésző : Thermococcusok  : [ eng. ]  // NCBI.  (Hozzáférés: 2017. július 23.) .
3. ↑ Protoarchaea osztály  : [ eng. ]  // LPSN.  (Hozzáférés: 2017. július 23.) .
4. ↑ 1 2 Slobodkina G. B. A hipertermofil archaeák képviselőinek molekuláris kimutatása és az archaeális hőstabil DNS polimeráz jellemzése Archivált 2012. május 9.  : szakdolgozat ... a biológiai tudományok kandidátusa: 03.00.07. - M. , 2005. - 118 p. : ill. — RSL OD.
5. ↑ Taxonómia böngésző: Thermococcaceae  : [ eng. ]  // NCBI.  (Hozzáférés: 2017. július 23.) .
6. ↑ Palaeococcus nemzetség  : [ eng. ]  // LPSN.  (Hozzáférés: 2017. július 23.) .
7. ↑ Pyrococcus nemzetség  : [ eng. ]  // LPSN.  (Hozzáférés: 2017. július 23.) .
8. ↑ Thermococcus nemzetség  : [ eng. ]  // LPSN.  (Hozzáférés: 2017. július 23.) .

Irodalom

• Cavalier-Smith T. Az archebaktériumok neomurán eredete, az univerzális fa negibakteriális gyökere és a bakteriális megaosztályozás  (angol)  // Int. J. Syst. Evol. mikrobiol. : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 52 , sz. 1. pont . - 7-76 . o . — PMID 11837318 .  (nem elérhető link)
• Woese CR, Kandler O., Wheelis ML Az organizmusok természetes rendszere felé: javaslat az Archaea, Bacteria és Eucarya tartományokhoz  (angolul)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : folyóirat. - 1990. - 1. évf. 87 , sz. 12 . - P. 4576-4579 . - doi : 10.1073/pnas.87.12.4576 . - Iránykód . — PMID 2112744 .
• Zillig W., Reysenbach AL Class IV (sic) [V]. Thermococcus osztály. november. // Bergey's Manual of Systematic Bacteriology 1. kötet: The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria  (angol) / DR Boone és RW Castenholz, szerk. — 2. - New York: Springer Verlag , 2001. - P. 169. - ISBN 978-0387987712 .
• Atomi H., Fukui T., Kanai T., Morikawa M. és Imanaka T. 2004. Thermococcus kodakaraensis sp . nov., egy jól tanulmányozott hipertermofil archeon, amely korábban Pyrococcus sp. KOD1 . Archaea 1 : 263-267.
• Fukuda W., Ismail YS, Fukui T., Atomi H. és Imanaka T. 2005. A Thermococcus kodakaraensis KOD1 hipertermofil archeonból származó archaeális almasav enzim jellemzése . Archaea 1 : 293-301.
• Fukui T., Atomi H., Kanai T., Matsumi R., Fujiwara S. és Imanaka T. 2005. A Thermococcus kodakaraensis KOD1 hipertermofil archeon teljes genomszekvenciája és összehasonlítása Pyrococcus genomokkal . Genome Research 15 , 352-363.
• Jolivet E., L'Haridon S., Corre E., Forterre P., Prieur D. 2003. Thermococcus gammatolerans sp. nov., egy mélytengeri hidrotermikus szellőzőből származó hipertermofil archeon, amely ellenáll az ionizáló sugárzásnak . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 53 , 847-851.
• Miroshnichenko ML, Gongadze GM, Rainey FA, ​​​​Kostyukova AS, Lysenko AM, Chernyh NA és Bonch-Osmolovskaya EA 1998. Thermococcus gorgonarius sp. november. és Thermococcus pacificus sp. nov.: heterotróf, rendkívül termofil archaea az új-zélandi tengeralattjáró forró szellőzőiből . International Journal of Systematic Bacteriology 48 : 23-29.

Linkek

• Hivatkozások a hipertermofil archaeákra .