IRF6

A 6-os interferon faktor szabályozása
Azonosítók
SzimbólumIRF6  ; LPS; OFC6; GÖDÖR.; PPS; PPS1; VWS; VWS1
Külső azonosítókOMIM:  607199 MGI :  1859211 HomoloGene :  4479 GeneCards : IRF6 gén
ortológusok
KilátásEmberiEgér
Entrez366454139
EgyüttesENSG00000117595ENSMUSG00000026638
UniProtO14896P97431
RefSeq (mRNS)NM_001206696NM_016851
RefSeq (fehérje)NP_001193625NP_058547
Locus (UCSC)Chr 1:
209,96 – 209,98 Mb
Chr 1:
193,15 – 193,17 Mb
Keresés a PubMedben[egy][2]

A 6-os interferon szabályozó faktor , más néven IRF6  , egy fehérje , amelyet emberben az IRF6 gén kódol . [egy]

Funkció

Ez a gén az interferon transzkripciót szabályozó faktor (IRF) család egy tagját kódolja . A családtagok egy erősen konzervált N-terminális hélix-turn-helix DNS-kötő doménre és egy kevésbé konzervált C-terminális fehérjekötő doménre oszlanak. [2]

Az IRF6 funkciója összefügg a kötőszövet képződésével , például a szájpadlásban. [3] Ez a gén az interferon transzkripciót szabályozó faktor (MAF) család egy tagját kódolja .

Patológia

Az IRF6 gén mutációja autoszomális domináns Van der Woude szindrómához (VWS) [4] vagy a kapcsolódó popliteális pterygium szindrómához [ ( PPS) vezethet . [5] 

A Van der Woude-szindróma magában foglalhatja az ajak- és szájpadhasadékot , valamint a fogászati ​​rendellenességeket és az ajkak fisztuláit. Ezen túlmenően, az IRF6-ban lévő megosztott allélok nem-szindrómás ajak- és/vagy szájpadhasadék esetekkel is összefüggésbe hozhatók a genomiális asszociációs vizsgálatokban és számos jelölt génvizsgálatban. [6] Ezek a rendellenességek az IRF6 gén mutációiból és a különböző típusú IRF6 mutációk fenotípusos heterogenitásából adódnak. [1] A szindrómák közötti fenotípusos eltérések egyik magyarázata a dimerizált mutáns fehérjék szerkezetére gyakorolt ​​eltérő hatáson alapul. A VWS mutációk haploinsufficienciához vezethetnek, míg a PPS mutációk a természet negatív dominanciájából származhatnak. [7] A VWS és a PPS mutációs spektrumát nemrégiben egyesítették. [nyolc]

Kimutatták, hogy az IRF6 fontos szerepet játszik a keratinociták fejlődésében. [9] [10] Az IRF6 szerepét az ajak- és szájpadhasadék gyakori formáiban is kimutatták [11] , és az ajakhasadék eseteinek kb. 20%-át magyarázhatja. [12] Az IRF6 változatai számos tanulmányban erős bizonyítékot szolgáltattak a szindrómás ajak- és/vagy szájpadhasadék összefüggésére. Birnbaum és munkatársai 2009-ben végzett tanulmánya megerősítette ennek a génnek az ajak- és/vagy szájpadhasadék etiológiájára gyakorolt ​​hatását, a GENEVA Cleft Consortium tanulmánya pedig, amely több populációból származó családokat vizsgált, megerősítette azt a megállapítást, hogy az IRF6 mutációk erősen összefüggenek a hasadékkal. ajak és/vagy szájpadlás. Az IRF6 ajak- és/vagy szájpadhasadékban betöltött szerepét alátámasztja az IRF6 elemzése olyan mutáns egerekben, amelyek hiperproliferatív epidermiszt mutatnak, nem mennek keresztül terminális differenciálódáson, ami többszörös epiteliális adhéziót eredményez, amely elzárhatja a szájüregeket és ajakhasadékhoz vezethet. . Állatkísérletek bizonyítják, hogy az IRF6 meghatározza a keratinociták proliferációját, és kulcsszerepet játszik a szájüreg kialakulásában is.

A közelmúltban egérgenetika, génexpressziós elemzés, kromatin immunprecipitációs vizsgálatok és luciferáz vizsgálatok segítségével az IRF6 a p63 közvetlen célpontja, amely számos, hasadási jellemzőkkel járó malformációs szindróma hátterében áll, és a p63 aktiválja az IRF6 transzkripcióját egy amplifikáló elemen keresztül. IRF6. Az erősítő elem változása csak az ajakhasadékra való érzékenységet növeli. És ajakhasadék szájpadhasadékkal vagy anélkül – ezeket a jellemzőket csak az IRF6 mutációt hordozó családokban észlelték. Ezenkívül ugyanabban a családban különböző típusú hasadékok sorolhatók be. [6]

Lásd még

Jegyzetek

  1. 1 2 Kondo S., Schutte BC, Richardson RJ, Bjork BC, Knight AS, Watanabe Y., Howard E., de Lima RL, Daack-Hirsch S., Sander A., ​​McDonald-McGinn DM, Zackai EH , Lammer EJ, Aylsworth AS, Ardinger HH, Lidral AC, Pober BR, Moreno L., Arcos-Burgos M., Valencia C., Houdayer C., Bahuau M., Moretti-Ferreira D., Richieri-Costa A., Dixon MJ, Murray JC Az IRF6 mutációi Van der Woude és poplitealis pterygium szindrómákat okoznak   // Nat . Közönséges petymeg.  : folyóirat. - 2002. - október ( 32. évf. , 2. sz.). - 285-289 . o . - doi : 10.1038/ng985 . — PMID 12219090 .
  2. Entrez gén: IRF6 . Az eredetiből archiválva: 2010. március 7.
  3. Blanton SH, Cortez A., Stal S., Mulliken JB, Finnell RH, Hecht JT Az IRF6 variációja hozzájárul a nonsyndromic ajak- és szájpadhasadékhoz   // Am . J. Med. Közönséges petymeg. A : folyóirat. - 2005. - szeptember ( 137A. köt . , 3. sz.). - P. 259-262 . - doi : 10.1002/ajmg.a.30887 . — PMID 16096995 .
  4. Van der Woude, A. Fistula labii inferioris congenita és kapcsolata ajak- és szájpadhasadékkal   // Am . J. Hum. Közönséges petymeg. : folyóirat. - 1954. - június ( 6. köt . 2. sz .). - P. 244-256 . — PMID 13158329 .
  5. Gorlin RJ, Sedano HO, Cervenka J. Popliteális pterygium szindróma. Szájpadhasadékot, poplitealis és intercruralis pterygiát, digitális és genitális anomáliákat magában foglaló szindróma  (angol)  // Gyermekgyógyászat : folyóirat. – Amerikai Gyermekgyógyászati ​​Akadémia, 1968. - február ( 41. kötet ). - P. 503-509 . — PMID 4384166 .
  6. 1 2 Dixon MJ, Marazita ML, Beaty TH, Murray JC Ajak- és szájpadhasadék: genetikai és környezeti hatások megértése   // Nat . Fordulat. Közönséges petymeg.  : folyóirat. - 2011. - március ( 12. évf. , 3. sz.). - 167-178 . o . - doi : 10.1038/nrg2933 . — PMID 21331089 .
  7. Little HJ, Rorick NK, Su LI, Baldock C., Malhotra S., Jowitt T., Gakhar L., Subramanian R., Schutte BC, Dixon MJ, Shore P. Missense mutációk, amelyek Van der Woude szindrómát és popliteális pterygiumot okoznak szindróma befolyásolja az IRF6 DNS-kötő és transzkripciós aktiváló funkcióit   // Human Molecular Genetics : folyóirat. – Oxford University Press , 2008. – November ( 18. évf. , 3. szám ). - P. 535-545 . doi : 10.1093 / hmg/ddn381 . — PMID 19036739 .
  8. de Lima RL, Hoper SA, Ghassibe M. et al. Exonikus mutációk prevalenciája és nem véletlenszerű megoszlása ​​a 6-os interferon szabályozó faktorban (IRF6) 307 Van der Woude-szindrómás és 37 poplitealis pterygium-szindrómás családban   // Genet . Med. : folyóirat. - 2009. - április ( 11. évf. , 4. sz.). - 241-247 . o . - doi : 10.1097/GIM.0b013e318197a49a . — PMID 19282774 .
  9. Richardson RJ, Dixon J., Malhotra S., Hardman MJ, Knowles L., Boot-Handford RP, Shore P., Whitmarsh A., Dixon MJ Az Irf6 a keratinocyte proliferation-differentiation  switch kulcsfontosságú meghatározója  // Nat. Közönséges petymeg.  : folyóirat. - 2006. - november ( 38. évf. , 11. sz.). - P. 1329-1334 . - doi : 10.1038/ng1894 . — PMID 17041603 .
  10. Ingraham CR, Kinoshita A., Kondo S., Yang B., Sajan S., Trout KJ, Malik MI, Dunnwald M., Goudy SL, Lovett M., Murray JC, Schutte BC Rendellenes bőr, végtag és koponya-morfogenezis 6-os interferon szabályozó faktor (Irf6) hiányos egerek  (angol)  // Nat. Közönséges petymeg.  : folyóirat. - 2006. - november ( 38. évf. , 11. sz.). - P. 1335-1340 . - doi : 10.1038/ng1903 . — PMID 17041601 .
  11. Zucchero TM, Cooper ME, Maher BS, Daack-Hirsch S., Nepomuceno B., Ribeiro L., Caprau D., Christensen K., Suzuki Y., Machida J., Natsume N., Yoshiura K., Vieira AR , Orioli IM, Castilla EE, Moreno L., Arcos-Burgos M., Lidral AC, Field LL, Liu YE, Ray A., Goldstein TH, Schultz RE, Shi M., Johnson MK, Kondo S., Schutte BC, Marazita ML, Murray JC Interferon regulatory factor 6 (IRF6) génváltozatok és az izolált ajak- vagy szájpadhasadék kockázata   // N. Engl . J. Med.  : folyóirat. — Vol. 351. sz . 8 . - P. 769-780 . - doi : 10.1056/NEJMoa032909 . — PMID 15317890 .
  12. Rakhimov F., Marazita ML, Visel A., Cooper ME, Hitchler MJ, Rubini M., Domann FE, Govil M., Christensen K., Bille C., Melbye M., Jugessur A., ​​Lie RT, Wilcox AJ, Fitzpatrick DR, Green ED, Mossey PA, Little J., Steegers-Theunissen RP, Pennacchio LA , Schutte BC, Murray JC . Az AP-2α kötőhely megszakítása IRF6 enhanszerben erősen összefügg az ajakhasadékkal  / Nat. Közönséges petymeg.  : folyóirat. - 2008. - november ( 40. évf. , 11. sz.). - P. 1341-1347 . - doi : 10.1038/ng.242 . — PMID 18836445 .