CHD3

A CHD3  (az angol C hromodomain - H elicase - D NA-binding protein 3 szóból) egy olyan enzim , amelyet emberben a CHD3 gén kódol . [1] [2] [3]

Ez a gén a CHD fehérjecsalád egy tagját kódolja, amelyet kromodomének (kromatin módosító szervezet) és SNF2-asszociált helikáz/ATPáz domének jelenléte jellemez. Ez a fehérje a Mi-2/NuRD komplexnek nevezett hiszton-dezacetiláz komplex egyik komponense , amely részt vesz a hiszton dezacetilezése során a kromatin átalakulásában. A kromatin átalakítása számos folyamathoz elengedhetetlen, beleértve a transzkripciót is . Az e fehérje elleni autoantitestek a dermatomyositisben szenvedő betegek egy alcsoportjában találhatók . Három alternatív splicing transzkriptum létezik, amelyek különböző izoformákat kódolnak. [3]

Interakciók

A CHD3-ról kimutatták, hogy kölcsönhatásba lép a HDAC1 -vel , [4] [5] hiszton-dezacetiláz 2 -vel [4] [6] [7] és SERBP1 -gyel . [8] [9]

Jegyzetek

1. ↑ Woodage T., Basrai MA, Baxevanis AD, Hieter P., Collins FS Characterization of the CHD family of proteins  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : Journal  . - 1997. - november ( 94. évf. , 21. sz.). - P. 11472-11477 . - doi : 10.1073/pnas.94.21.11472 . — PMID 9326634 .
2. ↑ Ge Q., Nilasena DS, O'Brien CA, Frank MB, Targoff IN A Mi-2 autoantigén 240 kD fehérje fő antigén régiójának molekuláris elemzése  // J  Clin Invest : folyóirat. - 1995. - november ( 96. évf. , 4. sz.). - P. 1730-1737 . - doi : 10.1172/JCI118218 . — PMID 7560064 .
3. ↑ 1 2 Entrez gén: CHD3 kromodomén helikáz DNS-kötő fehérje 3 . (határozatlan)
4. ↑ 12 Tong , JK; Hassig C.A.; Schnitzler GR; Kingston RE; Schreiber S L. Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodeling complex  (angol)  // Nature  : Journal. - ANGOLORSZÁG, 1998. - október ( 395. köt. , 6705. sz.). - P. 917-921 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
5. ↑ Kuzmicsev, A; Zhang Y; Erdjument Bromage H; TempstP; Reinberg D. A Sin3-Histone Deacetylase Complex szerepe a p33ING1 tumorszuppresszor jelölt növekedési szabályozásában  // Mol  . sejt. Biol. : folyóirat. - Egyesült Államok, 2002. - február ( 22. kötet , 3. szám ). - P. 835-848 . — ISSN 0270-7306 . - doi : 10.1128/MCB.22.3.835-848.2002 . — PMID 11784859 .
6. ↑ Hakimi, Mohamed-Ali; Dong Yuanshu; Lane William S; Speicher David W; Shiekhattar Ramin. Az X-kapcsolt mentális retardációs gén jelölt a hiszton-deacetilázt tartalmazó komplexek új családjának alkotóeleme  //  J. Biol. Chem.  : folyóirat. - Egyesült Államok, 2003. - február ( 278. kötet , 9. szám ). - P. 7234-7239 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
7. ↑ Hakimi, Mohamed-Ali; Bochar Daniel A; Schmiesing John A; Dong Yuanshu; Barak Orr G; Speicher David W; Yokomori Kyoko; Shiekhattar Ramin. Egy kromatin-átalakítási komplex, amely kohézint tölt be az emberi kromoszómákba  (angol)  // Nature  : Journal. – Anglia, 2002. – augusztus ( 418. köt. , 6901. sz.). - 994-998 . o . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/nature01024 . — PMID 12198550 .
8. ↑ Lemos, Taila A; Passos Dario O; Nery Flavia C; Kobarg Jörg. Egy új fehérjecsalád jellemzése, amely kölcsönhatásba lép a CHD-3 kromatin-remodelling faktor C-terminális régiójával  // FEBS Lett  . : folyóirat. - Hollandia, 2003. - Január ( 533. köt. , 1-3. sz. ). - P. 14-20 . — ISSN 0014-5793 . - doi : 10.1016/S0014-5793(02)03737-7 . — PMID 12505151 .
9. ↑ Stelzl, Ulrich; Worm Uwe, Lalowski Maciej, Haenig Christian, Brembeck Felix H., Goehler Heike, Stroedicke Martin, Zenkner Martina, Schoenherr Anke, Koeppen Susanne, Timm Jan, Mintzlaff Sascha, Abraham Claudia, Bock Nicole, Kietzmann Silvia, Toksözde A Enst, Droege Anja, Krobitsch Sylvia, Korn Bernhard, Birchmeier Walter, Lehrach Hans, Wanker Erich E. A humán fehérje-fehérje interakciós hálózat: erőforrás a proteom megjegyzéséhez  // Cell  :  Journal. - Egyesült Államok: Cell Press , 2005. - szeptember ( 122. kötet , 6. szám ). - P. 957-968 . — ISSN 0092-8674 . - doi : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . — PMID 16169070 .

Irodalom

• Bowen NJ, Fujita N., Kajita M., Wade PA Mi-2/NuRD: multiple complexes for many purpose   // Biochim . Biophys. Acta : folyóirat. - 2004. - 20. évf. 1677 , sz. 1-3 . - P. 52-7 . - doi : 10.1016/j.bbaexp.2003.10.010 . — PMID 15020045 .
• Gieser L., Swaroop A. Expressed szekvencia címkék és cDNS-klónok kromoszómális lokalizációja kivont retina pigment epithelium könyvtárból  (angol)  // Genomics  : Journal. - Akadémiai Kiadó , 1992. - 1. évf. 13 , sz. 3 . - P. 873-876 . - doi : 10.1016/0888-7543(92)90173-P . — PMID 1639417 .
• Seelig HP, Moosbrugger I., Ehrfeld H. és mtsai. A fő dermatomyositis-specifikus Mi-2 autoantigén egy feltételezett helikáz, amely részt vesz a transzkripciós aktiválásban  // Arthritis Rheum  . : folyóirat. - 1995. - 1. évf. 38 , sz. 10 . - P. 1389-1399 . - doi : 10.1002/art.1780381006 . — PMID 7575689 .
• Seelig HP, Renz M., Targoff IN és munkatársai. A dermatomyositis-specifikus Mi-2 autoantigén fő antigén fehérjéjének két formája  // Arthritis Rheum  . : folyóirat. - 1996. - 1. évf. 39 , sz. 10 . - P. 1769-1771 . - doi : 10.1002/art.1780391029 . — PMID 8843877 .
• Bonaldo MF, Lennon G., Soares MB Normalizálás és kivonás: két megközelítés a génfelfedezés megkönnyítésére  // Genome Res  . : folyóirat. - 1997. - 1. évf. 6 , sz. 9 . - P. 791-806 . - doi : 10.1101/gr.6.9.791 . — PMID 8889548 .
• Aubry F., Mattéi MG, Galibert F. Az Snf2-szerű helikáz család fehérjét kódoló humán 17p-helyzetű cDNS azonosítása  //  Eur . J Biochem. : folyóirat. - 1998. - Vol. 254 , sz. 3 . - P. 558-564 . - doi : 10.1046/j.1432-1327.1998.2540558.x . — PMID 9688266 .
• Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR és mtsai. Kromatin dezacetiláció egy ATP-függő nukleoszóma-remodelling komplex által  (angol)  // Nature : Journal. - 1998. - Vol. 395 , sz. 6705 . - P. 917-921 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
• Kleiderlein JJ, Nisson PE, Jessee J. és mtsai. CCG ismétlődések az emberi agy cDNS-eiben   // Hum . Közönséges petymeg.  : folyóirat. - 1999. - 1. évf. 103 , sz. 6 . - P. 666-673 . - doi : 10.1007/s004390050889 . — PMID 9921901 .
• Kim J., Sif S., Jones B. és mtsai. Az Ikaros DNS-kötő fehérjék a limfocitákban lévő kromatin-remodelling komplexek közvetlen képződését  (angolul)  // Immunity : Journal. - Cell Press , 1999. - Vol. 10 , sz. 3 . - P. 345-355 . - doi : 10.1016/S1074-7613(00)80034-5 . — PMID 10204490 .
• Wade PA, Gegonne A., Jones PL és mtsai. A Mi-2 komplex összekapcsolja a DNS-metilációt a kromatin-átalakítással és a hiszton-dezacetilációval  (angol)  // Nat. Közönséges petymeg.  : folyóirat. - 1999. - 1. évf. 23 , sz. 1 . - P. 62-6 . - doi : 10.1038/12664 . — PMID 10471500 .
• Cousin P., Billotte J., Chaubert P., Shaw P. A 17p13 és a p53-mal szomszédos gének fizikai térképe  // Genomics  :  Journal. - Akadémiai Kiadó , 2000. - 20. évf. 63 , sz. 1 . - P. 60-8 . doi : 10.1006/ geno.1999.6062 . — PMID 10662545 .
• Minty A., Dumont X., Kaghad M., Caput D. A p73alfa kovalens módosítása SUMO-1 segítségével. A p73-mal végzett kéthibrid szűrés új, SUMO-1-gyel kölcsönhatásba lépő fehérjéket és egy SUMO-1 interakciós motívumot azonosít  //  J. Biol. Chem.  : folyóirat. - 2000. - Vol. 275. sz . 46 . - P. 36316-36323 . - doi : 10.1074/jbc.M004293200 . — PMID 10961991 .
• Schultz DC, Friedman JR, Rauscher FJ Hiszton-dezacetiláz komplexek megcélzása KRAB-cink ujjfehérjéken keresztül: a KAP-1 PHD és bromodomainjei olyan együttműködő egységet alkotnak, amely a   NuRD Mi-2α alegységének új izoformáját toborozza // Gene Dev.  : folyóirat. - 2001. - 20. évf. 15 , sz. 4 . - P. 428-443 . - doi : 10.1101/gad.869501 . — PMID 11230151 .
• Yasui D., Miyano M., Cai S. és mtsai. A SATB1 a kromatin átalakítását célozza meg a gének nagy távolságra történő szabályozására  //  Nature : Journal. - 2002. - 20. évf. 419 , sz. 6907 . - P. 641-645 . - doi : 10.1038/nature01084 . — PMID 12374985 .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH és mtsai. Több mint 15 000 teljes hosszúságú emberi és egér cDNS-szekvencia előállítása és kezdeti elemzése  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : Journal  . - 2003. - 1. évf. 99 , sz. 26 . - P. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
• Lemos TA, Passos DO, Nery FC, Kobarg J. Egy új fehérjecsalád jellemzése, amely kölcsönhatásba lép a CHD-3 kromatin-remodeling faktor C-terminális régiójával  // FEBS Lett  . : folyóirat. - 2003. - 1. évf. 533 , sz. 1-3 . - P. 14-20 . - doi : 10.1016/S0014-5793(02)03737-7 . — PMID 12505151 .
• Fujita N., Jaye DL, Kajita M. és mtsai. Az MTA3, egy Mi-2/NuRD komplex alegység, szabályozza a mellrák invazív növekedési útvonalát  (angol)  // Cell  : Journal. - Cell Press , 2003. - Vol. 113. sz . 2 . - 207-219 . o . - doi : 10.1016/S0092-8674(03)00234-4 . — PMID 12705869 .
• Lee BH, Yoshimatsu K., Maeda A. és munkatársai. A Seoul és Hantaan hantavírusok nukleokapszid fehérjéjének társulása kis ubiquitin-szerű módosító 1-hez kapcsolódó molekulákkal  //  Virus Res. : folyóirat. - 2004. - 20. évf. 98 , sz. 1 . - 83-91 . o . - doi : 10.1016/j.virusres.2003.09.001 . — PMID 14609633 .