Bradyrhizobium japonicum

Bradyrhizobium japonicum

Bradyrhizobium japonicum USDA 110 törzs agarlemezen
tudományos osztályozás
Tartomány:baktériumokTípusú:ProteobaktériumokOsztály:Alfa proteobaktériumokRendelés:RhizobiumCsalád:BradyrhizobiaceaeNemzetség:BradyrhizobiumKilátás:Bradyrhizobium japonicum
Nemzetközi tudományos név
Bradyrhizobium japonicum
( Kirchner 1896 ) Jordánia 1982
Szinonimák
  • Rhizobacterium japonicum
    Kirchner 1896
  • Rhizobium japonicum
    (Kirchner 1896) Buchanan 1926     [1]

A Bradyrhizobium japonicum   (lat.) egy gócbaktérium faja, szaprofita nitrogénmegkötő szója szimbionta ( Glycine max ). Az egyik gazdaságilag legfontosabb baktériumfaj [2] .

Leírás

Gram -negatív pálcika alakú baktérium. A Bradyrhizobium nemzetség többi fajához hasonlóan lassan növekszik a tenyészetben, és szérum nélkül lúgosítja a táptalajt. 2002 óta létezik a B. japonicum genomszekvenciája . A genom mérete 9105828 bázispár, a GC szekvenciák tartalma körülbelül 64,1% [3] .

A B. japonicum képes lebontani a katechint floroglucinsavvá , amelyet azután dekarboxilezve phloroglucinum keletkezik , amely dehidroxilálódik rezorcinollá . A rezorcint pedig hidroxilezve hidroxi -kinol keletkezik [4] .

Nitrát lehelet

A B. japonicum rendelkezik a nosRZDFYLX génnel , amely a denitrifikációban részt vevő enzimet kódol. Ennek az enzimnek két katalitikus alegysége van, a Cu-a és a Cu-z (több hisztidin-maradékkal). Egy szekvenciális génexpressziós kaszkádot vált ki, amelyet „FixJ-FixK2-FixK1” néven említenek, és amely érzékeny az oxigénkoncentrációra. A FixJ pozitívan szabályozza a FixK2-t, amely aktiválja a nitrát légzési géneket, valamint a FixK1 fehérjét. A FixK1 mutánsok a nosRZDFYLX gén réztartalmú katalitikus alegységének (Cu-z) hibája miatt nem képesek nitrátlégzésre [5] .

Használat

Ezt a baktériumot gyakran használják modellszervezetként a légúti enzimek tanulmányozására [6] . A B. japonicum USDA 110 törzset, amelyet először 1957-ben izoláltak szójabab csomókból Floridában, az USA-ban, széles körben használják a molekuláris genetika, fiziológia és ökológia területén [7] . Ez annak köszönhető, hogy a B. japonicum USDA110 törzs magasabb szintű nitrogénkötéssel rendelkezik, mint a többi törzs [7] .

Jegyzetek

  1. ↑ A Rhizobium japonicum Buchanan 1980 átvitele a Bradyrhizobium gen. nov., hüvelyes növényekből származó lassan növekvő, gyökérgumóbaktériumok nemzetsége. Int. J. Syst. Bacteriol., 32, 136-139 (1982)].
  2. ↑ AB Hollis, WE Kloos & GE Elkan. DNS: Rhizobium japonicum és rokon   Rhizobiaceae DNS-hibridizációs vizsgálatai // Mikrobiológia. — Mikrobiológiai Társaság, 1981. - 1. évf. 123 . - P. 215-222 . - doi : 10.1099/00221287-123-2-215 .
  3. ↑ Takakazu Kaneko, Yasukazu Nakamura, Shusei Sato, Kiwamu Minamisawa, Toshiki Uchiumi, Shigemi Sasamoto, Akiko Watanabe, Kumi Idesawa, Mayumi Iriguchi, Kumiko Kawashima, Mitsuyo Kohara, Midori Matsumoto, Sayaka Manuha, Wasumoko, Sayaka Tumpu tabata. A nitrogénmegkötő szimbiotikus baktérium teljes genomi szekvenciája, Bradyrhizobium japonicum USDA110   : folyóirat . - 2002. - P. 189-197 .
  4. ↑ Waheeta Hopper és A. Mahadevan. A katechin lebontása Bradyrhizobium japonicum által  (angolul)  : folyóirat. – 1997.
  5. ↑ D. Nellen-Anthamatten, P. Rossi et al. Bradyrhizobium japonicum, FixK2, a FixLJ-függő szabályozási kaszkád kulcsfontosságú forgalmazója az alacsony oxigénszinttel indukálható gének szabályozásában  //  [Journal of Bacteriology] : folyóirat. - 1998. - Vol. 180 , sz. 19 . - P. 5251-5255 .
  6. ↑ Westenberg, DJ Bradyrhizobium japonicum (nem elérhető link) . Missouri Tudományos és Technológiai Egyetem (2008). Letöltve: 2011. július 11. Az eredetiből archiválva : 2012. szeptember 16.. 
  7. ↑ 1 2 [EBI] Európai Bioinformatikai Intézet Baktériumgenomok - BRADYRHIZOBIUM JAPONICUM . Európai Bioinformatikai Intézet (2011). Letöltve: 2011. július 12. Az eredetiből archiválva : 2011. május 14..