ARHGAP29

Az ARHGAP29 az első humán kromoszómán az 1p22 pozícióban  található gén , amely a Rho GTPase-activated protein (GAP) 29-et kódolja, [1] egy olyan fehérjét , amely a kisméretű, GTP -kötő fehérjék, például a RhoA ciklikus szabályozását közvetíti [2] .

Funkció

Az ARHGAP29 a fejlődő arcban expresszálódik, és az IRF6 fehérjétől lefelé hathat , hogy befolyásolja a craniofacialis fejlődését [3] .

Szerkezet

Az ARHGAP29 négy domént tartalmaz, köztük egy tekercselt régiót, amely kölcsönhatásba lép a Rap2-vel, [4] egy C1 domént, egy Rho régiót, egy GTPáz domént és egy kis C-terminális régiót, amely kölcsönhatásba lép a PTPL1-gyel [2] .

Klinikai jelentősége

Genomvizsgálatok és metaanalízis [5] kimutatták az ARHGAP29-et tartalmazó 1p22 lókusz és a nem szindrómás ajak-/szájpadhasadék közötti kapcsolatot [6] . A későbbi vizsgálatok [3] ritka kódoló variánsokat azonosítottak, köztük nonszensz mutációkat és kereteltolódásokat nem szindrómás ajak-/szájpadhasadékban szenvedő betegeknél . Az ARHGAP29 szerepét a craniofacialis fejlődésben azután állapították meg, hogy a szomszédos ABCA4 génből hiányoztak funkcionális vagy expressziós adatok, amelyek alátámasztották volna a nem szindrómás ajak-/szájpadhasadék etiológiai génjeként , bár az ABCA4 gén egyetlen nukleotid polimorfizmusát társították ezzel. betegség .

Jegyzetek

  1. ↑ Heasman SJ, Ridley AJ. 2008. Emlősök Rho GTPázai: új betekintések funkcióikba in vivo vizsgálatokból. Nat Rev Mol Cell Biol 9(9) 690-701.
  2. ↑ 1 2 Saras J, Franzen P, Aspenstrom P, Hellman U, Gonez LJ, Heldin CH. 1997. Egy új Rho GTPáz-aktiváló fehérje kölcsönhatásba lép a protein-tirozin-foszfatáz PTPL1" J Biol Chem 272(39) 24333-24338 PDZ doménjével.
  3. ↑ 1 2 Leslie, EJ; Mansilla MA, Biggs LC, Schuette K., Bullard S., Cooper M., Dunnwald M., Lidral AC, Marazita ML, Beaty TH, Murray JC Az expressziós és mutációs elemzések szerint az ARHGAP29 az ajakhasadék etiológiai génje, akár anélkül szájpadhasadék lókusz genomszintű asszociációval azonosítva az 1p22 kromoszómán  //  Birth Defects Research A. rész: Clinical and Molecular Teratology : Journal. - 2012. - Kt. 94 . - P. 934-942 . - doi : 10.1002/bdra.23076 . — PMID 23008150 .
  4. ↑ Myagmar BE, Umikawa M, Asato T, Taira K, Oshiro M, Hino A, Takei K, Uezato H, Kariya K. 2005. PARG1, protein-tirozin-foszfatázzal asszociált RhoGAP, mint feltételezett Rap2 effektor" Biochem Biophys Res. Commun 329(3) 1046-1052.
  5. ↑ Ludwig, KU; Mangold E., Herms S., Nowak S., Reutter H., Paul A., Becker J., Herberz R., AlChawa T., Nasser E., Böhmer AC, Mattheisen M., Alblas MA, Barth S., Kluck N., Lauster C., Braumann B., Reich RH, Hemprich A., Pötzsch S., Blaumeiser B., Daratsianos N., Kreusch T., Murray JC, Marazita ML, Ruczinski I., Scott AF, Beaty TH , Kramer FJ, Wienker TF, Steegers-Theunissen RP, Rubini M., Mossey PA, Hoffmann P., Lange C., Cichon S., Propping P., Knapp M., Nöthen MM Genome-wide meta-analyses of nonsyndromic cleft szájpadhasadékos vagy anélküli ajak hat új kockázati lókuszt azonosít  // Nature Genetics  : Journal  . - 2012. - Kt. 44 , sz. 9 . - P. 968-971 . - doi : 10.1038/ng.22360 . — PMID 22863734 .
  6. ↑ Beaty, T. H.; Murray JC, Marazita ML, Munger RG, Ruczinski I., Hetmanski JB, Liang KY, Wu T., Murray T., Fallin MD, Redett RA, Raymond G., Schwender H., Jin SC, Cooper ME, Dunnwald M. , Mansilla MA, Leslie E., Bullard S., Lidral AC, Moreno LM, Menezes R., Vieira AR, Petrin A., Wilcox AJ, Lie RT, Jabs EW, Wu-Chou YH, Chen PK, Wang H., Ye X., Huang S., Yeow V., Chong SS, Jee SH, Shi B., Christensen K., Melbye M., Doheny KF, Pugh EW, Ling H., Castilla EE, Czeizel AE, Ma L., Field LL, Brody L., Pangilinan F., Mills JL, Molloy AM, Kirke PN, Scott JM, Arcos-Burgos M., Scott AF A szájpadhasadékkal és anélküli ajakhasadék genom-szintű asszociációs vizsgálata kockázati változatokat azonosít a MAFB közelében és ABCA4. (angol)  // Nature Genetics  : Journal. - 2010. - 20. évf. 42 , sz. 6 . - P. 525-529 . - doi : 10.1038/ng.580 . — PMID 20436469 .