Affinitás (biokémia)

A biokémiában az affinitás (a kötési affinitás is) a molekulák más molekulákhoz való kötődési hajlamának mértéke, például fehérje - ligandum kölcsönhatásban a kötőpartnerek között : minél nagyobb az affinitás, annál nagyobb a asszociációs állandó Ka (más néven a kötési állandó).

Jellemzők

Jelenleg azonban az asszociációs állandó helyett az inverz mértéket, a K d disszociációs állandót alkalmazzák : minél nagyobb a fehérje affinitása ligandumához, annál kisebb a komplex disszociációs állandója. Az enzim-szubsztrát komplex képződésének/hasításának példáján [ES].

A tömeghatás törvénye szerinti definíciók vagy a kinetikai állandók (k sebességi állandók) itt találhatók:

asszociációs állandó (kötési állandó)	$K_{a}={[ES] \over [E]\cdot [S]}$	$K_{a}={k_{1} \over k'_{1}}$
disszociációs állandó	$K_{d}={[E]\cdot [S] \over [ES]}$	$K_{d}={k'_{1} \fölött k_{1))$ .

Az enzimkinetikában a Km -t , a Michaelis - állandót néha egy enzim szubsztráthoz való affinitásának mértékére használják. A gyakorlatban ennek van bizonyos joga, de elméletileg szigorúan meg kell különböztetni az ES komplex K d disszociációs állandóját és a Michaelis állandót. Briggs és Haldane szerint a Michaelis-állandó a k 2 változások számától is függ, és a következőképpen számítható ki:

K_{m}={k'_{1}+k_{2} \over k_{1))

K m -ből K d -be való származtatás csak akkor lehetséges . Ez a feltevés nem minden esetben megfelelő, de eredetileg Leonor Michaelis és Maud Menten tette a Michaelis-Menten egyenlet levezetésére . ${\displaystyle k_{2}\ll k'_{1))$

Az affinitás ligandumkötési vizsgálattal határozható meg .

Lásd még

Irodalom

Jeremy M. Berg, John L. Timochko, Lubert Strayer: Biokémia. 6. kiadás, Spectrum Academic Publishing, Heidelberg, 2007. ISBN 978-3-8274-1800-5 .
Donald Voet, Judith G. Voet: Biokémia. 3. Kiadás, John Wiley & Sons, New York, 2004. ISBN 0-471-19350-X .
Bruce Alberts , Alexander Johnson, Peter Walter, Julian Lewis, Martin Ruff, Keith Roberts: The Molecular Biology of the Cell , 5. kiadás, Taylor és Francis, 2007, ISBN 978-0-8153-4106-2 .