A kényelem kedvéért Japán prefektúráit gyakran régiókba sorolják . Ezek a régiók történelmileg alakultak ki, nem rendelkeznek közigazgatási apparátussal és nem is közigazgatási egységek. Például a térképek és a földrajztankönyvek Japánt nyolc régióra osztják, az időjárás-előrejelzések általában régiónként sorolják fel az időjárást, és sok szervezet a régió nevét is beleírja a nevében (Kinki Nippon Railway, Chugoku Bank, Tohoku Egyetem stb.). Noha Japánban nyolc felsőfokú bíróság működik, ezek illetékességi területei nem felelnek meg a tárgyalt régióknak.
Japán hagyományos régiói északról délre:
Hokkaido kivételével minden régió több prefektúrát tartalmaz. Hokkaido csak egy prefektúrát tartalmaz, Hokkaidót.
| Japán régiói és közigazgatási felosztásai | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Régiók | |||||||||||||||||
| Prefektúrák |
| ||||||||||||||||