A cisztatinok a szerin-proteáz inhibitor fehérjék családja , amelyek szerkezetileg homológok a csirke cisztatinjával. Egy tipikus cisztatin körülbelül 115 aminosavat tartalmaz , és 4 evolúciósan konzervált ciszteint tartalmaz, amelyek két diszulfidkötést képeznek . A cisztatinok glikoziláción és/vagy foszforiláción eshetnek át .