Francesco Maria II della Rovere ( olaszul: Francesco Maria II Della Rovere ; 1549. február 20., Pesaro – 1631. április 23. , Urbania ) volt Urbino utolsó hercege a della Rovere -dinasztiából .
II. Francesco Maria Urbino hercegének, Guidobaldo II della Rovere -nak és feleségének, Victoria Farnese pármai hercegnőnek a fia volt . 1565-1568 között II. Fülöp spanyol király udvarában nevelkedett . Apja 1574-ben bekövetkezett halála után elfoglalta Urbino trónját. 1585-ben II. Fülöp király felvette az Aranygyapjas Rendbe .
Első házasságában, 1570-ben, II. Francesco Maria feleségül vette Lucrezia d'Este -t, II. Ercole ferrarai herceg lányát . Ez a házasság gyermektelen volt, és 1576-ban válás következett. Francesco Maria azonban, hogy megőrizze Urbino hercegségét a della Rovere család képviselői számára, férfi örökösre volt szükség; különben a hercegség a pápai államok fennhatósága alá került volna . Ezért Lucrezia 1599-ben bekövetkezett halála után másodszor is feleségül vette unokatestvérét, Livia della Roverét (1585-1641), aki 36 évvel volt fiatalabb Francesco Mariánál. 1605. május 16-án megszületett örökösük, Federico Ubaldo , aki azonban 1623-ban meghalt, valószínűleg mérgezés következtében.
Mivel a hercegnek már nem lehetett közvetlen örököse, 1625-ben Francesco Maria átadta Urbino uralmát VIII. Urban pápának , és utolsó éveit visszavonultan töltötte Urbinóban. A herceg 1631-ben bekövetkezett halála után Urbino végül a pápai államok részévé vált. Francesco Maria unokája, fia, Federico Ubaldo - Vittoria lánya, aki férjhez ment Ferdinando II. Medici toszkán nagyherceghez , végrendeletben megkapta Urbino hercegeinek gazdag művészeti gyűjteményét, amely az Uffizi Képtár egyik alapja lett. Firenzében . _