Szintetikus morfogenezis

A szintetikus morfogenezis az élőlények szerveinek, rendszereinek és testrészeinek szabályozott fejlesztése specifikus molekuláris mechanizmusok aktiválásával, beleértve a programozható szövetek és szervek, szintetikus bioanyagok és programozható élőanyagok létrehozását , valamint összetett morfogén rendszerek de novo tervezését . 1] .

A dolgok jelenlegi állása

A morfogenezis lehetséges mechanizmusainak első megfontolása Alan Turing angol matematikus 1952-ben publikált munkája volt, "A morfogenezis kémiai alapjai", amely a fejlődésbiológia mechanizmusait írta le differenciálegyenletrendszerekben [2] . A természetes morfológiai rendszerek rendszerint moduláris hierarchikus felépítésűek. Ez a tulajdonság a biológiai rendszerek evolúciójának eredménye, amelyen belül a fő molekuláris folyamatok rögzültek, majd az intra- és intercelluláris kölcsönhatások dinamikus szabályozásának kombinációja. A szintetikus morfogenezis egy olyan megközelítés, amely a felnőtt szervezet által elvesztett szövetek, szervek és sejtfunkciók pótlására szolgál a normál ontogenezis helyi ismétlődésének indukálásával, vagy alapvetően új funkciójú szervek kialakításával [1] . Jelenleg azonban a klinikai szakemberek alkalmazási területeit általában korlátozzák a sejttranszdifferenciálódás és a formázás lehetőségei [3] , amihez három nagy probléma társul: a) a felhasznált biokonstruktor elemeinek hiányossága; b) a létrejövő biokonstrukciók zajállóságának biztosítása; c) korlátozott módszerek a biomérnöki megoldások megvalósítására.

Biokonstruktor elemek teljessége

A szintetikus biológia megközelítések alkalmazása lehetővé teszi az elemek teljességének problémájának tervezési megoldását, egy „biokonstruktor” elemeiből összeállítva egy biorendszert. A közelmúltban munkák jelentek meg a bioblokkok könyvtárainak rendszerezéséről, amelyek a szervek és szövetek összetevőinek tulajdonságait és funkcióit konstruálják [4] a további klinikai gyakorlatban való felhasználás céljából [5] . Az egyik ilyen felhasználási terület a különféle természetű pluripotens sejtekből a teljes morfogenezisig az emberi testben „üres szerv” létrehozása [6] . Jelenleg szintetikus génkonstrukciókat vezettek be a sejttípus, az anyagcsere állapot, a biokémiai jelek és a fény felismerésére a sejt alakjának, mozgékonyságának és differenciálódási programjának megváltoztatására, vagy sejthalál kiváltására. A szintetikus intercelluláris jelátvitel lehetővé teszi a sejtpopuláció számára, hogy döntéseket hozzon és koordinálja a viselkedést lokálisan és globálisan is [1] . A sejtsebészet hatékony szövetmérnöki eszközt kínál a sebészet és a helyreállító gyógyászat klinikai alkalmazásaihoz. Az egyszerű új rendszerek felépítése a valódi embriók tanulmányozásából származó morfológiai elméletekkel összhangban ezen elméletek szigorú tesztelésének eszközeként szolgál majd, amit nagyon nehéz megtenni az összetett embriók manipulálásával (a rendszerbiológia mint eszköztár). ). A szintetikus morfológia mérnöki követelményei közé tartozik a sejten belül funkcionálisan összekapcsolható szenzoros modulok, szabályozó modulok és effektor modulok könyvtárának fejlesztése. Jelentős számú szenzoros és szabályozó modul létezik már, és mint ilyen, a módosított emberi sejtek tervezéséhez szükséges könyvtár már elérhető közelségben van [7] .

Biokonstrukciók zajállósága

A fejlődésbiológia a szervezeti komplexitás és a zajjal szembeni rezisztencia jelenségével foglalkozik a gének sejtben történő expressziójában. Jelenleg különféle modellek léteznek ilyen folyamatokra, de még messze vagyunk attól, hogy megértsük a teljes képet, különösen a morfogenezist, amelyben a génexpressziót szigorúan szabályozni kell. Alapvetően szükséges a génexpresszió szabályozásának kérdéseit a különféle külső hatásoknak és a belső sztochaszticitásnak ellenálló szervezet fejlődésének szabályozása útján vizsgálni [8] . Erre a célra jelenleg különféle módszereket alkalmaznak a sejtek metabolikus folyamatainak modellezésére [9] . A módosított sejtközösségek transzkripciós profiljukban különböznek, és a génexpressziós mintázatok is megváltoznak a sejtközösségek kollektív dinamikája következtében. Ez arra utal, hogy a biológiai összefüggések széles körében a génexpresszió a populáció és a környezet dinamikájához kapcsolódó önszerveződési folyamatot tükröz [10] . Ez a jelenség összetett többkomponensű szövetek tervezésében használható fel, amelyek egyes tervezési hibáit önszerveződő és alkalmazkodó sejtközösségek kompenzálhatják.

Módszerek a biomérnöki megoldások megvalósítására

A szintetikus morfogenezis módszereit jelenleg a nukleinsavak szintézisére és szekvenálására, bioreaktorban történő sejttenyésztésre , differenciálódásra vagy transzdifferenciálódásra szolgáló molekuláris biológiai technológiák jelentik, amelyeken belül a sejtek képesek átmenni egy közvetlen (pluripotensből szomatikussá) ill. fordított út (szomatikustól a multi- vagy pluripotensig). A heterogén omikai adatok sejtalkotó módszerekkel való integrálása lehetővé tette a vérerek endothel sejtek működésének modellezését [11] . Az intercelluláris szervezetek felépítésének új irányai az új szimbiózisok létrehozásában is megállják a helyüket [12] .

Szervkészítmények

A szervbimbó -megközelítés olyan szövetmanipulált konstrukciók előállítására szolgáló módszerek összessége, amelyekben emberi vagy állati testüregeket használnak bioreaktorként a morfogenezis utolsó szakaszában [13] . Az ilyen nyersdarabok előgyártása különféle formázási módszerekkel (3D bionyomtatás; az extracelluláris mátrix sejtekkel való kolonizálása rotációs bioreaktorban stb.) végezhető, amelyet in vivo vagy in vitro inkubáció követ , például mesterséges fascia létrehozása. üres sejtekből és hordozóból 3D bioprinterben, és a munkadarab további "kiképzése" in vivo körülmények között [14] .

Perspektívák

A szervek és szövetek funkcióinak regenerálása mérnöki (szintetikus) biológiai módszerek alkalmazásával ígéretes szisztematikus megközelítés, melynek eredményei a klinikai gyakorlatban is hasznosíthatók. Kutatásra van szükség az organogenezist utánzó feltételek pontos meghatározásához , amely végül funkcionális szervek és mikrobiológiai közösségek létrejöttéhez vezethet. A szintetikus morfogenezis az emberi szervek és szövetek in vitro biomérnökségének alternatív megközelítése . A módszer alkalmazásának korlátja a szervezet azon képessége, hogy helyreállítsa a károsodásokat, eltávolítsa az anyagcseretermékeket stb. A génmanipulált állatok, például a minimalacok , amelyekből a sertés endogén retrovírusainak egy részét eltávolították, és a sejtekben az MHC -komplexummal helyettesítették [15] , akkor használhatók, ha egészségügyi okok miatt nem lehet szervet növeszteni a páciens testében.

Lásd még

Jegyzetek

  1. ↑ 1 2 3 Teague BP, Guye P., Weiss R. Synthetic morphogenesis // Cold Spring Harbor Perspectives in Biology. - 2016. - Kt. 8, 9. sz . — P. a023929. - doi : 10.1101/cshperspect.a023929 .
  2. AM Turing, FRS A morfogenezis kémiai alapjai   // Phil . Trans. R. Soc. London. B. - 1952-08-14. — Vol. 237 , iss. 641 . — P. 37–72 . - ISSN 2054-0280 0080-4622, 2054-0280 . - doi : 10.1098/rstb.1952.0012 . Archiválva az eredetiből 2017. október 9-én.
  3. JA Davies. Szintetikus Biológia: Rational Pathway Design for Regenerative Medicine  // Gerontológia. - 2015. - október. Archiválva az eredetiből 2017. július 5-én.
  4. E. Cachat, W. Liu, P. Hohenstein és JA Davies, „A könyvtár emlősök effektor moduljaiból szintetikus morfológiához.”, J. Biol. Eng., vol. 8, sz. 1. o. 2014. 26.
  5. WC Ruder et al., „Synthetic Biology moveing ​​into the clinic.”, Science, vol. 333. sz. 6047, pp. 1248–52, szept. 2011.
  6. T. Takebe, K. Sekine, M. Enomura, H. Koike, M. Kimura, T. Ogaeri, R.-R. Zhang, Y. Ueno, Y.-W. Zheng, N. Koike, S. Aoyama, Y. Adachi és H. Taniguchi: „IPSC-eredetű szervbimbó-transzplantációból származó vaszkularizált és funkcionális emberi máj.”, Nature, vol. 499, sz. 7459, pp. 481-484, júl. 2013.
  7. JA Davies, „Synthetic morphology: prospects for engineered, self-constructing anatomy.”, J. Anat., vol. 212. sz. 6, pp. 707–19, jún. 2008.
  8. MB Elowitz, AJ Levine, ED Siggia, PS Swain, P. Guptasarma, JL Spudich, HH McAdams, P. Heitzler, MS Ko, S. Fiering, R. Lutz, U. Deuschle, PC Maloney, B. Rotman, J Paulsson, M. Ehrenberg, D. Boyd, Becskei A., L. Serrano, MB Elowitz, S. Leibler, M. Thattai, A. van Oudenaarden, U. Alon, FN Capaldo, SD Barbour, MJ Casadaban, JS Parkinson, SE Houts, BJ Meyer, R. Maurer és M. Ptashne, „Stochastic gene expression in a single cell.” Science, vol. 297. sz. 5584, pp. 1183–6, aug. 2002.
  9. R. Rekhi és AA Qutub, „Systems megközelítések a szintetikus biológiához: út az emlősök tervezéséhez”, Front. Physiol., vol. 4. o. 285, 2013.
  10. E. Stolovicki és E. Braun, „Collective Dynamics of Gene Expression in Cell Populations”, PLoS One, vol. 6, sz. 6. o. e20530, jún. 2011.
  11. J. Frueh, N. Maimari, Y. Lui, Z. Kis, V. Mehta, N. Pormehr, C. Grant, E. Chalkias, M. Falck-Hansen, S. Bovens, R. Pedrigi, T. Homma , G. Coppola és R. Krams, „Systems and synthetic biology of the érfal”, FEBS Lett., vol. 586. sz. 15, pp. 2164–2170, 2012.
  12. JK Polka, SG Hays és PA Silver, „Térbeli szintetikus biológia építése rekeszekkel, állványokkal és közösségekkel.”, Cold Spring Harb. perspektíva. Biol., p. a024018, jún. 2016.
  13. T. Takebe, M. Enomura, E. Yoshizawa, M. Kimura, H. Koike, Y. Ueno, T. Matsuzaki, T. Yamazaki, T. Toyohara, K. Osafune, H. Nakauchi, HY Yoshikawa és H. Taniguchi, „Vascularized and Complex Organ Buds from Diverse Tissues via mesenchymal Cell-Driven Condensation”, Cell Stem Cell, vol. 16. sz. 5, pp. 556–565, 2015.
  14. Klabukov I.D. Mérnökbiológia problémagyűjtemény . - SSRN, 2016. - 56 p.
  15. Niemann, H. és Petersen, B. (2016). Multi-transzgénikus sertések előállítása: frissítés és perspektívák az xenotranszplantációhoz. Transgenic research ,  25 (3), 361-374. doi:10.1007/s11248-016-9934-8

Irodalom