DNS szekvenáló

Az oldal jelenlegi verzióját még nem ellenőrizték tapasztalt közreműködők, és jelentősen eltérhet a 2022. augusztus 3-án felülvizsgált verziótól ; az ellenőrzések 3 szerkesztést igényelnek .

A DNS-szekvenáló (szekvenáló) egy tudományos műszer vagy eszköz, amely automatikusan meghatározza a nukleotidszekvenciát a DNS  - lánc szekvenálásában . DNS-mintát töltenek be a szekvenálóba, munkájának eredménye egy adenin , timin , guanin , citozin bázisszekvenciák halmaza, általában A, T, G, C betűkkel szöveges karakterláncokként tárolva (az ún. ").

Az első automatizált szekvenátorokat az Applied Biosystems vezette be 1987-ben, és a Sanger-módszert alkalmazták . Ez a módszer a szekvenszerek első generációjának alapja. Segítségével 2001- ben befejeződött a Human Genome Project (az emberi genom teljes leolvasása ). Az első generációs telepítések az elektroforetikus rendszerek automatizálása voltak, amelyek meghatározták a jelölt DNS-fragmensek vándorlását a gélben, tömeg (hossz) szerint elválasztva azokat.

A Human Genome Project az alacsonyabb költségű, nagy áteresztőképességű, precíziós szekvenáló rendszerek, az úgynevezett Next Generation Sequencers (NGS) kifejlesztését indította el. Az ilyen rendszerek közül: 454, SOLiD, Illumina DNA. Az ilyen szekvenátorok a korábbi Sanger-módszerhez képest nagyságrendekkel felgyorsították a DNS-kódok leolvasásának folyamatát. Az ilyen eszközök DNS-mintáinak előkészítése automatizált, és körülbelül másfél órát vesz igénybe. Csupán néhány napba telik, hogy egy emberméretű genomot 15-ször leolvassunk.

Az újabb szekvenátorok harmadik generációs (pl. SMRT és Oxford Nanopore), és egyetlen DNS-molekulák egyedi nukleotidjainak valós idejű mérésével működnek (nukleotidok hozzáadásával vagy lánc áthúzásával egy nanopórusos fehérjeszerkezeten ).

Modern[ mikor? ] szekvencerek[ mi? ] olyan optikai rendszerekkel rendelkeznek, amelyek segítségével a jelek rögzítettek - festékterminátorok ( eng.  dye-terminators ) - különböző hullámhosszúságú és ennek megfelelően színű fluorokrómok a DNS-ben egy adott nukleotidhoz kötődnek (zöld- adenin , vörös- timin , fekete - guanin , kék - citozin ).

Automatizált szekvencerek

Az első Sanger-módszeren alapuló automatizált DNS-szekvenátort L. M. Smith fejlesztette ki, és az  Applied Biosystems 1987-ben hozta forgalomba. [egy]

Lásd még

Jegyzetek

  1. Robert Mullan Cook-Deegan. Az emberi genom projekt eredete . Washingtoni Egyetem. Letöltve: 2014. október 20. Az eredetiből archiválva : 2020. november 6..

Linkek