Proteoformák

Proteoformok ( angol proteoforms ) - fehérjemódosítások következtében létrejövő fehérjecsoportok vagy fehérjefajták : aminosavszubsztitúciók (egy aminosav polimorfizmusa) (SAP), alternatív splicing (AS) és poszttranszlációs módosítások (PTM), például foszforiláció . A "protein faj" vagy "proteoform" kifejezés a proteom legkisebb egységét jelenti, vagyis olyan polipeptidet , amelynek egyedi szekvenciája van, és egyedi poszttranszlációs módosításokat hordoz [1] .

Human Proteome Project

A Human Proteome projekt fő fázisának célja az volt, hogy a mesterproteomot kiegészítsék információkkal a különböző módosítások eredményeként létrejövő fehérjék formáiról, például a genomban nem szinonim egynukleotidos polimorfizmusok jelenlétéről, alternatív splicing folyamatokról és poszttranszlációs módosulásokról. Ennek eredményeként a kísérleti fázisban kapott mesterproteom helyett, amikor egy génnek csak egy (mester)fehérje felelt meg, a projekt fő fázisában az egy gén által kódolt lehetséges proteoformák teljes választékát elemeztük. Egy gén akár 100 fehérjét is kódolhat (azaz több millió proteoformát szervezeti léptékben), vagy több tízezret az emberi kromoszóma 18 esetében . A Human Proteome projekt fő fázisa lehetővé teszi a meglévő bioinformatikai prediktív algoritmusok kritikus értékelését, és adott esetben kísérleti adatokon alapuló új algoritmusok kidolgozását a nem kanonikus proteoformák kimutatására [2] .

Lásd még

• Proteomika
• Illesztés

Jegyzetek

1. ↑ Naryzhny, S. N., Zgoda, V. G., Mainskova, M. A., Ronzina, N. L., Belyakova, N. V., Legina, O. K., & Archakov, A. I. (2015). Az emberi sejt- és plazmaproteomok méretének kísérleti becslése . Biomedical Chemistry , 61(2), 279-285.
2. ↑ Ponomarenko, E. A., Zgoda, V. G., Kopylov, A. T., Attorney, E. V., Ilgisonis, E. V., Lisitsa, A. V., & Archakov, A. I. (2015). Oroszország a „human proteome” nemzetközi projektben: első eredmények és kilátások . Biomedical Chemistry , 61(2), 169-175.