Megállás nélküli leépülés

A Nonstop degradation [2] ( angolul  Non-stop decay ) egy mRNS minőségellenőrző mechanizmus , amelynek célja a stopkodon nélküli mRNS azonosítása és transzlációjuk megakadályozása . A nonstop degradáció során a riboszóma , amely jelentősen elmozdult az mRNS 3'-vége felé, disszociál , és az mRNS az exoszomális komplexbe ( eukariótákban ) vagy az RNáz R -be ( baktériumokban ) kerül továbbpusztulás céljából . [3] [4] .

2016-ban kimutatták, hogy a nonstop degradáció vírusellenes hatású, ha hepatitis B vírussal fertőződött meg . Ennek a vírusnak az egyik transzkriptumának (X-mRNS) van egy startkodonja a 3' végén , a fő stopkodon után. Ennek a transzkriptumnak a transzlációja során a riboszóma a 3'-végi startkodonhoz is kötődik, de "lefagy" a stopkodon hiánya miatt. Emiatt az X-mRNS-t a nonstop degradációs rendszer felismeri, és az exoszóma lebontja [5] .

Mechanizmus

A stopkodont nem tartalmazó mRNS-ek korai 3'-poliadenilációból származhatnak, amelyben a poliadenilációs szignálok a transzkriptum kódoló régiójában helyezkednek el [6] . A riboszóma, amely az ilyen mRNS-ekhez kötődik, addig fordítja azokat, amíg el nem éri a poli(A)-farokat, amelyen „lóg”, és nem tud disszociálni az mRNS-től [7] . Ha a stopkodonok nélküli mRNS nem eliminálódik, akkor sok riboszóma nem lesz képes a normál mRNS-ek transzlációjára, mivel hibás transzkriptumokhoz kapcsolódnak. A nonstop degradáció lelógó riboszómákat szabadít fel, és stopkodon nélkül küld mRNS-t a nukleázok által lebontandó. A nonstop degradáció két fő mechanizmuson keresztül megy végbe, amelyek valószínűleg együtt hatnak [8] [9] .

Path Ski7

A Ski7 fehérjének állítólag van egy doménje a riboszóma üres A-helyéhez való kötődéshez, és ezáltal segíti a "lógott" riboszómákat abban, hogy stopkodon nélkül megszabaduljanak a transzkriptumtól. Egy másik Ski7 domén kölcsönhatásba lép az exoszómával [10] . A riboszóma disszociációja után a Ski7 a hibás transzkriptumhoz kötődik, és ebben a formában a citoszolikus exoszómák elpusztítják a transzkriptumot . Az exoszóma Ski7-tel alkotott komplexe gyorsan deadenilezi az mRNS-t, majd az exoszóma a 3'-végtől az 5'-végig tartó irányban elpusztítja a transzkriptumot [8] [9] .

Ski7-től független útvonal

A második NSD útvonalat először élesztőben írták le. Ski7 hiányában a poli(A)-kötő fehérjék (PABP) disszociálnak a poli(A)-farokból. A PABP fehérjék disszociációja miatt a védő 5'- végsapka lekerül a transzkriptumról , és a transzkriptumot gyorsan lebontják az endogén exonukleázok , például az XrnI, az 5'-végtől a 3'-vég felé haladva. vége [9] . A Ski7 hiányzik az emlőssejtekben , és a nonstop degradáció magában foglalja az ugyanabból a családból származó Hbs1 fehérjét , a Dom34 fehérjét, amelyhez a Hbs1 kötődik, és az exoszóma/Ski komplexum összetevőit: Ski2/Mtr4 és Dis3 . A Hbs1-Dom34 az exoszómához/Skihez kötődik, és multiprotein komplexet képez . Ezenkívül a stopkodon nélküli transzkriptumokból szintetizált fehérjék eltávolításához a RING domént [11] tartalmazó liszterin fehérje szükséges .

Baktériumokban

A baktériumok speciális transz-transzlációs mechanizmussal rendelkeznek a lelógó riboszóma felszabadítására. A folyamatban részt vevő kulcsmolekulák egy specifikus transzport hírvivő RNS ( tmRNS ) és az SmpB fehérje. A tmRNS a "függő" riboszóma A-helyéhez kötődik, és a riboszómával kölcsönhatásba lépő hely végén az alanin aminosav kötődik . Nem messze tőle az SmpB tmRNS-hez kötődik. A riboszóma elkezdi lefordítani a tmRNS-t, miközben a hibás transzkriptumból szintetizált polipeptidhez egy speciális aminosav szekvencia kapcsolódik (a tmRNS-ből olvassák le), amely a polipeptidet a lebomláshoz irányítja. A tmRNS transzlációját befejező riboszóma disszociál és felszabadul [4] .

Jegyzetek

  1. Garneau NL , Wilusz J. , Wilusz CJ The highways and byways of mRNS decay.  (angol)  // Nature Reviews. Molekuláris sejtbiológia. - 2007. - február ( 8. köt . 2. sz .). - 113-126 . o . - doi : 10.1038/nrm2104 . — PMID 17245413 .
  2. Krebs J., Goldstein E., Kilpatrick S. Gének Lewin szerint. - M . : Tudáslaboratórium, 2017. - S. 618. - 919 p. - ISBN 978-5-906828-24-8 .
  3. Vasudevan S. , Peltz SW , Wilusz CJ Non-stop decay--a new mRNS surveillance pathway.  (angol)  // BioEssays : News and Reviews in Molecular, Cellular and Developmental Biology. - 2002. - szeptember ( 24. évf. , 9. sz.). - P. 785-788 . doi : 10.1002 / bies.10153 . — PMID 12210514 .
  4. ↑ 1 2 Venkataraman K. , Guja KE , Garcia-Diaz M. , Karzai AW Non-stop mRNS decay: a különleges attribútuma a transz-transzláció mediált riboszómamentésnek.  (angol)  // Frontiers In Microbiology. - 2014. - Kt. 5 . - 93-93 . o . - doi : 10.3389/fmicb.2014.00093 . — PMID 24653719 .
  5. Aly HH , Suzuki J. , Watashi K. , Chayama K. , Hoshino S. , Hijikata M. , Kato T. , Wakita T. RNS Exosome Complex Regulates Stability of the Hepatitis B Virus X-mRNS Transcript in a Non-stop -közvetített (NSD) RNS minőségellenőrzési mechanizmus.  (angol)  // The Journal Of Biological Chemistry. - 2016. - július 29. ( 291. évf . , 31. sz.). - P. 15958-15974 . - doi : 10.1074/jbc.M116.724641 . — PMID 27281821 .
  6. Temperley RJ Egy patogén mtDNS mikrodeléció vizsgálata transzlációfüggő deadenilációs bomlási útvonalat tár fel humán mitokondriumokban  //  Human Molecular Genetics. - 2003. - július 15. ( 12. évf. , 18. sz.). - P. 2341-2348 . — ISSN 1460-2083 . doi : 10.1093 / hmg/ddg238 .
  7. Karzai AW , Roche ED , Sauer RT Az SsrA-SmpB rendszer fehérje címkézéshez, irányított lebontáshoz és riboszómamentéshez.  (angol)  // Nature Structural Biology. - 2000. - június ( 7. köt. , 6. sz.). - P. 449-455 . - doi : 10.1038/75843 . — PMID 10881189 .
  8. 1 2 van Hoof A. , Frischmeyer PA , Dietz HC , Parker R. Terminációs kodont nem tartalmazó mRNS-ek exoszóma által közvetített felismerése és lebontása.  (angol)  // Tudomány (New York, NY). - 2002. - március 22. ( 295. évf. , 5563. sz.). - P. 2262-2264 . - doi : 10.1126/tudomány.1067272 . — PMID 11910110 .
  9. 1 2 3 Frischmeyer PA Egy mRNS-megfigyelési mechanizmus, amely megszünteti  a terminációs kodonokat nem tartalmazó átiratokat  // Tudomány . - 2002. - március 22. ( 295. évf. , 5563. sz.). - P. 2258-2261 . — ISSN 0036-8075 . - doi : 10.1126/tudomány.1067338 .
  10. Mironova L. N., Padkina M. V., Sambuk E. V. RNS: szintézis és funkciók. - Szentpétervár. : Ökovektor, 2017. - S. 272. - 287 p. - ISBN 978-5-906648-29-7 .
  11. Saito S. , Hosoda N. , Hoshino S. A Hbs1-Dom34 fehérje komplex funkciói a non-stop mRNS lebontásban emlőssejtekben.  (angol)  // The Journal Of Biological Chemistry. - 2013. - június 14. ( 288. évf . , 24. sz.). - P. 17832-17843 . - doi : 10.1074/jbc.M112.448977 . — PMID 23667253 .