A Moldovai Köztársaság megyéi a Moldovai Köztársaság közigazgatási felosztása, amely 1999 és 2002 között létezett.
1998-ban a Moldovai Köztársaság parlamentjének képviselői első olvasatban elfogadták az 1998. november 6-i „Helyi közigazgatásról” szóló törvény módosításáról és kiegészítéséről szóló törvénytervezetet. A dokumentum rendelkezik a falvak (községek), a városok (községek) és a régiók kompetenciáinak differenciálásáról.
Így 1999. január 1- jétől 2002. január 29-ig a Moldovai Köztársaság 9 (1999. október 22. óta - 10) körzetre, 1 önkormányzati és 2 közigazgatási-területi formációra oszlott.
2002. január 29-én az akkori parlamenti többséggel új törvényt fogadott el a közigazgatási-területi struktúra.