Strukturális genomika
A strukturális genomika egy adott genom által kódolt egyes fehérjék háromdimenziós szerkezetét igyekszik leírni . A kísérleti és modellezési megközelítések kombinációját alkalmazzák. Az alapvető különbség a strukturális genomika és a hagyományos szerkezeti előrejelzés között az, hogy a strukturális genomika megkísérli meghatározni a genom által kódolt egyes fehérjék szerkezetét, ahelyett, hogy egy bizonyos fehérjére összpontosítana. A teljes genomszekvenciák rendelkezésre állásával a struktúra előrejelzése gyorsabban elvégezhető a kísérleti és modellezési megközelítések kombinációjával, különösen azért, mert a nagyszámú rendezett genom és korábban felbontott fehérjeszerkezet elérhetősége lehetővé teszi a tudósok számára, hogy a korábban felbontott homológok szerkezetére építsenek.
Mivel egy fehérje szerkezete szorosan összefügg egy fehérje funkciójával, a szerkezeti genomika lehetővé teszi egy fehérje funkcióinak megismerését. A fehérjefunkciók tisztázása mellett a strukturális genomika felhasználható új fehérjeredők és gyógyszerkutatás lehetséges célpontjainak azonosítására.
Módszerek
A strukturális genomika számos módon használ teljes genomszekvenciákat a fehérjeszerkezetek meghatározására. A célfehérje génszekvenciája összehasonlítható egy ismert szekvenciával, és az ismert fehérje szerkezetéből következtetni lehet a strukturális információkra. A strukturális genomika olyan modellezésen alapuló megközelítést alkalmazhat, amely egy ismeretlen fehérje és egy megoldott fehérjeszerkezet közötti egyezésen alapul.
Lásd még
Irodalom
- Chandonia JM, Brenner SE A szerkezeti genomika hatása: elvárások és eredmények // Science : Journal. - 2006. - január ( 311. évf. , 5759. sz.). - P. 347-351 . - doi : 10.1126/tudomány.1121018 . — PMID 16424331 .
 Szótárak és enciklopédiák |
|---|