Kalapácsfejű ribozim

A kalapácsfejű ribozimek  kis, önmetsző RNS -ek , amelyek konzervált szekvenciával rendelkeznek , és megtalálhatók néhány viroidban , és egyes növényi vírusok szatellit RNS-eihez kapcsolódnak. [2]

A kalapácsfejű ribozimeket először növényi viroidokban fedezték fel , ezek specifikus harmadlagos szerkezetük miatt katalizálták az RNS-molekulák foszfodiészter kötéseinek szekvencia-specifikus elszakadását . [3] [4] A másodlagos szerkezet egy kalapács fejére hasonlít . kalapácsfejű .  

Önreplikáció

Ez a ribozim képes önreplikációra. A replikáció úgy történik, mint egy gördülő kerék [5] . Az RNS a gördülő gyűrű kiindulási pontján van bemetszve. A szabad dezoxinukleotidok elkezdenek kapcsolódni ennek a láncnak a felszabadult 3'-végéhez. Ahogy a leány RNS-szál megnyúlik, az 5'-vég elmozdul a szülőgyűrűtől. Amikor a 3' és 5' vége ugyanabban a pontban találkozik, az RNS szintézis leáll, és a leánygyűrű elválik a szülőgyűrűtől.

Linkek

• A Hammerhead ribozim másodlagos szerkezete . Virtuális Laboratórium Wiki . - (Képek). Letöltve: 2009-15-10. Az eredetiből archiválva : 2012. március 19. (Orosz)

• Az energiabecslés jelentéktelenségéről az RNS-modellezésben - egy tanulmány a Wikiversity-nél a harmadlagos szerkezet modellezéséről, példaként kalapácsfejű ribozim használatával

• A Chrysanthemum klorotikus foltos viroid szervezet viroid ribozimjának harmadlagos szerkezete, a YouTube RNAInSpace szoftverével előre megjósolva Boriszov, S.S. Jakovlev. A játékelmélet alkalmazása a ribonukleinsav hajtogatásának problémájára . (Orosz)

• A Chrysanthemum klorotikus foltos viroid szervezet viroid ribozimjának feltekeredésének modellpályája a YouTube -on található RNAInSpace szoftver segítségével Boriszov, S.S. Jakovlev. A játékelmélet alkalmazása a ribonukleinsav hajtogatásának problémájára . (Orosz)

Lásd még

• Hajtűt tartalmazó ribozim
• A replikáció kezdőpontja
• Illesztés

Jegyzetek

1. ↑ Martick M., Scott WG Az aktív helytől távoli harmadlagos érintkezők egy ribozimet indítanak el a katalízishez  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 2006. - Vol. 126. sz . 2 . - P. 309-320 . - doi : 10.1016/j.cell.2006.06.036 . — PMID 16859740 .
2. ↑ Forster AC, Symons RH Egy virusoid plusz és mínusz RNS-einek önhasítása és az aktív helyek szerkezeti modellje  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 1987. - Vol. 49 , sz. 2 . - P. 211-220 .
3. ↑ Prody GA, Bakos JT, Buzayan JM, Schneider IR, Bruening G. Dimeric Plant Virus Satellite RNA autolytic Processing  //  Science : Journal. - 1986. - 1. évf. 231. sz . 4745 . - P. 1577-1580 . - doi : 10.1126/tudomány.231.4745.1577 .
4. ↑ Hutchins CJ, Rathjen PD, Forster AC, Symons RH Az avokádó sunblotch viroid plusz és mínusz RNS transzkriptumainak önhasítása  // Nucleic Acids Res  . : folyóirat. - 1986. - 1. évf. 14 , sz. 9 . - P. 3627-3640 .
5. ↑ Flores R, Navarro JA, de la Peña M, Navarro B, Ambrós S, Vera A. Viroids with hammerhead ribozymes: some egyedi szerkezeti és funkcionális aspektusok a csoport többi tagjához viszonyítva  // Biol. Chem.. - 1999. - T. 380 , No. 7-8 . - S. 849-854 .