A Limnológiai Intézet ( lett: Limnoloģijas institūts ) egy tókutatásokkal foglalkozó tudományos intézet a Daugavpils Egyetem részeként Daugavpils városában ( Lettország ).
Latgale tározóinak kutatásával foglalkozik . 2004-2009 - ben programot dolgozott ki a Razna nemzeti park létrehozására az azonos nevű tó körül . A jekabpilsi búvárklub segítségével elvégezték a Dridzis - tó felmérését, melynek egyik eredménye lett Lettország legmélyebb tavának mélysége (66,2 méter, a korábbi 65,1 méter helyett). Az Intézet a Nyugat-Dvina (Daugava) folyó kutatásával is foglalkozik .
Az intézet vezetője Artur Shkut biológia professzor .