Fenna-Matthews-Olson komplexum

A Fenna-Matthews-Olson komplex (FMO) a zöld kénbaktériumok fénygyűjtő komplexének integrált antennája , amely közvetíti a gerjesztési energiának a kloroszómákból a membránba ágyazott bakteriális reakcióközpontokba (RC-k) való átvitelét.

Tanulmánytörténet

A pigment-fehérje komplexet először 1962-ben izolálta és írta le az úttörő biokémikus, John Melvin Olson (1929–2017) és asszisztense, Carol Romano. Az anyag forrása Elena Nikolaevna Kondratieva (1925-1995) szovjet mikrobiológus [2] által biztosított baktériumkultúra volt .

Az FMO lett az első pigment-fehérje komplex, amelynek háromdimenziós szerkezetét röntgenspektroszkópiával írták le . A komplexum nevét a felfedező John Olson, valamint Roger Fenna (szül. 1947) és Brian Matthews (sz. 1938) krisztallográfusokról kapta [3] .

Szerkezet

Vízoldható pigment - fehérje komplexek trimere. A három monomer mindegyike 7 bakterioklorofill a molekulát tartalmaz . Egy fehérjevázon keresztül kapcsolódnak össze, amely koordinációs kötést képez a központi magnéziumatommal, akár aminosav-maradékon (főleg hisztidin ), akár vízhidak révén (minden monomeren csak egy bakterioklorofill).

Mivel a komplex szerkezete ismert, lehetségesnek bizonyult ezen információk alapján optikai spektrumok kiszámítása a kísérleti adatokkal való összehasonlításhoz [4] [5] . A legegyszerűbb esetben csak a bakterioklorofillok exciton konjugációját vesszük figyelembe [6] . A valósághűbb modellek figyelembe veszik a pigment-fehérje konjugációt is [7] . Fontos tulajdonsága a bakterioklorofillok lokális energiaátvitele (pozíciós energiája), amely fehérjekörnyezetéből adódóan minden pigmentmolekulánál egyedi. A bakterioklorofillok helyzeti energiája határozza meg az energiaáramlás irányát.

Az FMO-RC szuperkomplex szerkezetéről sikerült némi információt szerezni, amelyet elektronmikroszkóppal [8] [9] , valamint FMO trimereken és az FMO-RC komplexen mért lineáris dikroizmus spektrumokkal kaptunk. Ezekből a mérésekből világossá vált, hogy az FMO-nak a reakcióközponthoz (RC) képest két tájolása lehetséges. Az a tájolás, amelyben a 3. és 4. bakterioklorofill az RC közelében helyezkedik el, az 1. és 6. bakterioklorofill pedig (Fenna és Matthews eredeti számozását követve) a kloroszómák felé néz, elősegíti a hatékony energiaátvitelt [10] .

Tesztobjektum

A PMO komplex a természetben ismert legegyszerűbb fénygyűjtő komplexumot képviseli, ezért alkalmas tesztobjektum olyan módszerek kifejlesztésére, amelyek azután átvihetők bonyolultabb rendszerekre, mint például a fotorendszer I. Az FMO meglepően hosszú kvantumkoherenciát mutat , ami fontos szerepet játszik az energiaátviteli folyamatokban [1] .

Gathering Light

A fotoszintézis során a fénygyűjtés klasszikus és kvantummechanikai eljárásokat is alkalmaz, és hatásfoka közel 100%. A klasszikus eljárásokban a fényenergia befogadásához a fotonnak az energia disszipációja előtt el kell érnie a reakcióközpontokat, vagyis kevesebb, mint egy nanoszekundum alatt. Ez azonban nem történik meg a fotoszintézis során. Mivel az energia sok szuperpozíciós állapotban létezhet, egy anyagon belül minden útvonalat bejárhat egyszerre. Amikor a foton megtalálja a megfelelő célt, a szuperpozíció összeomlik, így elérhetővé válik az energia. Ez azonban nem pusztán kvantumfolyamat, mivel egyes kvantumfolyamatok lelassítják a kvantált objektumok mozgását az anyagon belül. Például az Anderson lokalizáció megakadályozza a kvantumállapotok terjedését rendezetlen közegben. Mivel a kvantumállapot hullámként viselkedik, érzékeny az interferenciára és a külső hatásokra. További probléma a kvantum-Zéno-effektus , melynek lényege, hogy egy instabil kvantumállapot soha nem változik, ha folyamatosan mérjük/megfigyeljük, hiszen folyamatosan változtatja, megakadályozva az összeomlást [11] [12] .

A kvantumállapotok és a környezet kölcsönhatása egyfajta mérésként vagy megfigyelésként szolgál. A környezettel való klasszikus kölcsönhatás olyan mértékben megváltoztatja a kvantumállapot hullámszerűségét, hogy az Anderson lokalizációját zavarja, aminek következtében a kvantum-Zéno-effektus megnöveli a kvantumállapot élettartamát, ami lehetővé teszi, hogy elérje a kvantumállapotot. reakcióközpont [11] .

Számítástechnika

A fehérjemátrixban lévő reakcióközpont megtalálásának problémája formálisan egyenértékű a számítógépes technológia számos problémájával. A számítási problémák leképezésével a reakcióközpont gerjesztési energiájának keresésére a fénygyűjtés egy új típusú számítástechnikai eszközzé válhat, amely szobahőmérsékleten növeli a tervezési sebességet, és 100-1000-szeres hatásfokot ér el [11] .

Jegyzetek

  1. 1 2 Tronrud, DE; Schmid, M. F.; Matthews, BW A Prosthecochloris aestuarii -ból származó bakterioklorofill-fehérje szerkezete és röntgen-aminosav-szekvenciája 1,9 A felbontással  //  Journal of Molecular Biology : folyóirat. - 1986. - április ( 188. évf. , 3. sz.). - P. 443-454 . - doi : 10.1016/0022-2836(86)90167-1 . — PMID 3735428 .
  2. Blankenship RE, Brune DC, Olson JC Emlékezés John M. Olsonra (1929-2017) // Photosynthesis Research. - 2018. - Kt. 137. - P. 161-169. - doi : 10.1007/s11120-018-0489-9 .
  3. Fenna, RE; Matthews, BW Klorofil elrendezés a Chlorobium limicola  bakterioklorofil fehérjében (angol)  // Nature : Journal. - 1975. - 1. évf. 258 , sz. 5536 . - P. 573-577 . - doi : 10.1038/258573a0 . — .
  4. Vulto, Simone I.E.; Neerken, Sieglinde; Louwe, Robert JW; De Baat, Michiel A.; Amesz, Jan; Aartsma, Thijs J. Excited-state Structure and Dynamics in FMO Antenna Complexes from Photosynthetic Green Sulphur Bacteria  // The  Journal of Physical Chemistry B : folyóirat. - 1998. - Vol. 102 , sz. 51 . - P. 10630-10635 . doi : 10.1021 / jp983003v .
  5. Wendling, Markus; Przyjalgowski, Milosz A.; Gülen, Demet; Vulto, Simone I. E.; Aartsma, Thijs J.; Van Grondelle, Rienk van; Van Amerongen, Herbert van. A szerkezet és a polarizált spektroszkópia közötti kvantitatív kapcsolat a Prosthecochloris aestuarii FMO komplexumában : finomító kísérletek és szimulációk  //  Photosynthesis Research : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 71 , sz. 1-2 . - P. 99-123 . - doi : 10.1023/A:1014947732165 . — PMID 16228505 .
  6. Pearlstein, Robert M. A Prosthecochloris aestuarii bakterioklorofill egy antennafehérje trimerének optikai spektrumainak elmélete  //  Photosynthesis Research : folyóirat. - 1992. - 1. évf. 31 , sz. 3 . - P. 213-226 . - doi : 10.1007/BF00035538 . — PMID 24408061 .  (nem elérhető link)
  7. Renger, Thomas; Marcus, R.A.A fehérjedinamika és az exciton relaxáció kapcsolatáról pigment-fehérje komplexekben: A spektrális sűrűség becslése és az optikai spektrumok kiszámításának elmélete  //  Journal of Chemical Physics  : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 116. sz . 22 . - P. 9997-10019 . - doi : 10.1063/1.1470200 . - .
  8. Rémigy, Hervé-W; Stahlberg, Henning; Fotiadis, Dimitrios; Müller, Shirley A; Wolpensinger, Bettina; Engel, Andreas; Hauska, Gunter; Tsiotis, Georgios. A Chlorobium tepidum zöld kénbaktérium reakcióközpont-komplexuma : szerkezeti elemzés pásztázó transzmissziós elektronmikroszkóppal  //  Journal of Molecular Biology : folyóirat. - 1999. - július ( 290. évf. , 4. sz.). - P. 851-858 . - doi : 10.1006/jmbi.1999.2925 . — PMID 10398586 .
  9. Rémigy, Hervé-W.; Hauska, Gunter; Müller, Shirley A.; Tsiotis, Georgios. A zöld kénbaktériumok reakcióközpontja: haladás a szerkezeti felvilágosítás felé  //  Photosynthesis Research : folyóirat. - 2002. - 20. évf. 71 , sz. 1-2 . - P. 91-8 . - doi : 10.1023/A:1014963816574 . — PMID 16228504 .
  10. Tronrud, D.E.; Schmid, M. F.; Matthews, BW Hogyan váltják ki a fehérjék a gerjesztési energia transzfert a zöld kénbaktériumok FMO komplexumában  // Biophysical  Journal : folyóirat. - 2006. - október ( 91. évf. , 8. sz.). - P. 2778-2797 . - doi : 10.1529/biophysj.105.079483 . - . — PMID 16861264 .
  11. 123 MIT . _ A kvantumfénygyűjtési tippek a számítástechnika teljesen új formájához . Technologyreview.com (2013. november 25.). Letöltve: 2013. december 6. Az eredetiből archiválva : 2015. szeptember 24..
  12. Vattay, Gabor & Kauffman, Stuart A. (2013), Evolutionary Design in Biological Quantum Computing, arΧiv : 1311.4688 [cond-mat.dis-nn].