Az Eurázsiai Szabadalmi Hivatal (EAPO) az EAPO végrehajtó szerve . Amint azt az Art. 4 EAPC:
"Az eurázsiai iroda ellátja a Szervezet összes adminisztratív funkcióját. Ez a Szervezet titkársága."
Az EAPO élén az elnök áll, aki az EAPO legmagasabb tisztségviselője.
Az EAPO elnöke határozza meg annak felépítését és nevezi ki a személyzetet. Az EAPO tevékenységéért az igazgatási tanácsnak felel, és különösen széles körű hatáskörrel rendelkezik:
Minden tagállam saját EAPO-kvótával rendelkezik, amelyet az igazgatási utasítások 9. szabálya határoz meg.
A fent említett kvótákat a részt vevő államok gazdasági potenciáljának figyelembevételével határozzák meg, és százalékosak: Oroszország - 62, Fehéroroszország - 7, Kazahsztán - 7, Azerbajdzsán - 4, Örményország - 4, Kirgizisztán - 4, Moldova - 4 , Tádzsikisztán - 4, Türkmenisztán - 4.
Az EAPO által felvett alkalmazottakat a tagállamok nemzeti szabadalmi hivatalai ajánlják, figyelembe véve a kiosztott kvótákat. Ugyanakkor az ajánlott munkatársaknak rendelkezniük kell az ipari tulajdon területén végzett gyakorlati munkavégzésben szükséges képzettséggel és tapasztalattal, szervezési képességekkel és kielégítő orosz nyelvtudással.
Az EAPO alkalmazottai nem jogosultak részmunkaidőben dolgozni, és hivatali feladataik ellátásával össze nem egyeztethető tevékenységeket folytatni, kivéve a tudományos, oktatói és egyéb kreatív tevékenységeket.
Az Adminisztrációs Utasítás 11. szabálya szabályozza a munkavállalók feladatkörét, ideértve azt a kötelezettséget is, hogy a bizalmas jellegű információkat szolgálati jogviszonyuk megszűnése után sem szabad nyilvánosságra hozni és felhasználni.
Az EAPO és az EAPO alkalmazottai közötti viták esetén az EAPO székhelye szerinti ország munkajogának normáit kell alkalmazni. Ezenkívül az Eurázsiai Iroda alkalmazottai vagy korábbi alkalmazottai jogosultak a Nemzetközi Munkaügyi Szervezet Közigazgatási Bíróságához fordulni a munkaköri leírásukban vagy szerződéseikben meghatározott feltételek mellett.