A gélszűrés vagy méretkizárásos kromatográfia (szita, gélpermeáció, gélszűrős kromatográfia) a kromatográfia egyik fajtája , melynek során az anyagok molekulái méretükben szétválnak az állófázis pórusaiba való eltérő behatolási képességük miatt. Ebben az esetben a legnagyobb (nagyobb molekulatömegű ) molekulák, amelyek az állófázis minimális számú pórusaiba képesek behatolni, hagyják el először az oszlopot. A kis molekulaméretű anyagok, amelyek szabadon behatolnak a pórusokba, utoljára kerülnek ki. Az adszorpciós kromatográfiától eltérően a gélszűrés során az állófázis kémiailag inert marad, és nem lép kölcsönhatásba az elválasztandó anyagokkal.
Az oszlopba mintaoldatot vezetünk , amelynek térfogata korlátozza a kromatográfia minőségét. Analitikai elválasztásnál nem haladhatja meg a CV (teljes oszloptérfogat) 0,1%-át, preparatív tisztításnál pedig nem haladhatja meg a CV 8-10%-át. Az oszlop tele van porral, amelynek részecskéi vagy szemcséi bizonyos átmérőjű pórusokkal rendelkeznek. A pórusokban nem szereplő makromolekuláris anyagok átjutnak a szemcsék között, így retenciós térfogatuk megegyezik az oszlop térfogatával mínusz az állófázis térfogata (ún. szabad térfogat ). Először eluálódnak. A közepes méretű molekulák a szorbens pórusaiba illeszkednek, de nem teljesen. Ezért retenciós térfogatuk valamivel nagyobb, mint a szabad térfogat. Másodszor eluálódnak. A legkisebb molekulák az oldószermolekulákkal együtt szabadon behatolnak a pórusokba. Ezért a retenciós térfogatuk az oszlopban sokkal nagyobb, mint a szabad térfogat, és megközelíti az oszlop teljes térfogatát (azaz 100% CV). Utoljára eluálódnak.
A gél egy heterogén rendszer, amelyben a mozgófázis (általában víz) mindig egy álló vagy szilárd fázis pórusaiban van, amelyet gélmátrixnak neveznek.