A biológiai molekulák elsődleges szerkezete az atomi szerkezet pontos megjelölése és az atomok közötti kémiai kötések elrendezése (beleértve a sztereokémiát is ). Egy olyan standard biopolimer esetében, amelynek molekulájában nincsenek elágazások és keresztkötések (például DNS , RNS vagy fehérjék ), az elsődleges szerkezet fogalma egyet jelent a monomer maradékok ( nukleotidok vagy aminosavak ) szekvenciájával [1] . Az "elsődleges szerkezet" kifejezést Linnerström-Lang használta először egy 1951-es Lane Medical Lectures című kiadványban.
Az „elsődleges szerkezet” és az „aminosav- (vagy nukleotid-) szekvencia” kifejezéseket felcserélhetően használjuk. A sajnálatos "elsődleges szekvencia" kifejezést gyakran használják, elfelejtve, hogy nincs másodlagos vagy harmadlagos szekvencia. Azokat a térbeli struktúrákat, amelyeket a DNS-ben lévő aminosavláncok felvehetnek, másodlagos szerkezetnek nevezzük .
A fehérje elsődleges szerkezetét az N-terminális aminosavtól a karboxilvég felé (C) [1] , a nukleinsavak elsődleges szerkezetét pedig az 5' - végtől a 3'-végig szokás írni. vége .