Általános transzkripciós faktorok [1] ( az általános transzkripciós faktorok, GTF -ek, bazális transzkripciós faktorok ) – a fehérje- transzkripciós faktorok egy osztálya, amelyek segítenek az eukarióta RNS-polimeráz II -nek a promóteren történő helyes elhelyezésében , és hozzájárulnak két DNS-szál elválasztásához is. lehetővé teszik a transzkripció megkezdését ezen a helyen, és elősegítik az RNS-polimeráz felszabadulását a promoterből a transzkripció iniciációjából a transzkripció meghosszabbításába való átmenet során. A "közönséges" elnevezés abból adódik, hogy az RNS-polimeráz II által használt szinte valamennyi promoter működéséhez szükségesek. Ezenkívül a GTF-ek kölcsönhatásba lépnek az mediátorral , amely a transzkripciós apparátus egyik kulcsfontosságú eleme, amely szükséges az aktivátor fehérjék és GTF-ek megfelelő kölcsönhatásához az RNS-polimeráz II-vel [2] . Az általános transzkripciós faktorokat TFII-nek nevezzük (az angol transzkripciós faktor RNA polimeráz II szóból) [1] . A GTF-ek közé tartozik a TFIIA , TFIIB , TFIID , TFIIE , TFIIG , TFIIH [3] [4] .
Az eukarióta GTF-ek a bakteriális σ-faktor funkcióihoz hasonló funkciókat látnak el, ráadásul a TFIIH egyes részei ugyanolyan háromdimenziós szerkezettel rendelkeznek, mint a σ-faktor hasonló részei [5] .
Az általános faktorok az RNS-polimeráz II promóterén preiniciációs komplexumot ( transzkripciós iniciációs komplexet ) állítanak össze az alábbiak szerint . Az RNS-polimeráz II promoternek általában van egy speciális szekvenciája, az úgynevezett TATA box , amely a transzkripció kezdőhelyétől 25 nukleotidra található. A TFIID faktor felismeri és megköti a TATA dobozt a TBP alegységén keresztül , majd a TFIIB a mellette lévő DNS-hez kötődik. A TFIID erősen torzítja a DNS háromdimenziós szerkezetét a TATA box régióban, és ez a torzítás valószínűleg mechanikai referenciaként szolgál az aktív promoter pozíciójának meghatározásához. Ezt követően a fennmaradó közös transzkripciós faktorok és maga az RNS-polimeráz II kötődik a promoterhez, teljes értékű transzkripciós iniciációs komplexet képezve. Ezután a TFIIH ATP-t használva szétválasztja a két DNS-szálat a transzkripció kezdőpontján, és ezzel egyidejűleg a templátszálat kifelé teszi. Tartalmaz továbbá egy proteinkináz aktivitással rendelkező alegységet, amely foszforilezi az RNS-polimeráz II-t, aminek következtében konformációja megváltozik, így megszabadul a GTF-ektől, és megnyúlik. Az RNS polimeráz II foszforilációja a C-terminális doménben történik, amely 52 tandem 7 aminosav ismétlődésből áll; az 5. szerinmaradék minden ismétlésben foszforilálódik. Az RNS-polimeráz II-nek a DNS-től való elválasztása után a transzkripciós faktorok is elválik a DNS-től [6] .
A fenti kötési szekvenciát in vitro körülmények között figyeltük meg ; in vivo a közös transzkripciós faktorok összeállítási sorrendje a promóteren génenként változhat [6] .
Az alábbi táblázat felsorolja a gyakori transzkripciós faktorok funkcióit.
Név | Alegységek száma |
Funkciók [7] |
---|---|---|
TFIID TBP alegység TAF alegység |
1 ~ 11 |
Felismeri a TATA dobozt Felismer más DNS-szekvenciákat a transzkripció kezdőhelye körül, szabályozza a TBP általi DNS-kötést |
TFIIA | 2 [8] [9] | Kölcsönhatásba lép a TBP TFIID alegységgel, és részt vesz a TBP TATA-dobozhoz való kötődésében [10] |
TFIIB | egy | Felismeri a BRE elemet a promóterekben, pontosan orientálja az RNS polimeráz II-t a transzkripció kezdőpontján |
TFIIF | 3 | Stabilizálja az RNS polimeráz kölcsönhatását TBP-vel és TFIIB-vel, elősegíti a TFIIE és TFIIH kötődését |
TFIIE | 2 | Toborozza és szabályozza a TFIIH-t |
TFIIH | 9 | Letekerteti a DNS-t a transzkripció kezdőhelyén, foszforilálja az RNS-polimeráz II-t és felszabadítja a promoterből |