Nukleotid szekvencia
Nukleotidszekvencia , genetikai szekvencia – a nukleinsavak nukleotidmaradékainak sorrendje . Sorozatozással határozzuk meg .
A DNS nukleotidszekvenciájának rögzítéséhez az IUPAC ajánlása szerint a latin ábécé karaktereit kell használni. [egy]
- A = adenin [2]
- C = citozin
- G = guanin
- T = timin
- R = GA guanin vagy adenin – purin (pu r in) bázisok
- Y = TC pirimidin (p y rimidin ) bázisok
- K = ketocsoportot tartalmazó GT
- M = aminocsoportot tartalmazó AC
- S = GC "erős" ( erős), amely 3 hidrogénkötést képez
- W = AT "gyenge" ( w eak) 2 hidrogénkötést képez
- B = ÁSZF (bármilyen más, mint A)
- D = GAT (bármilyen, kivéve C)
- H = ACT (bármilyen más, mint G)
- V = GCA (bármilyen más, mint T)
- N = AGCT (bármilyen)
A szekvencia határozatlanságát jelző szimbólumokra akkor van szükség, ha a pontos szekvencia ismeretlen, irreleváns, vagy annak különböző változatai ismertek.
Az A, C, G, U ( uridin )
szimbólumok általában elegendőek az RNS -szekvenciák írásához .
Minden sorozat szóköz nélkül van írva, balról jobbra, az 5' végtől a 3' végéig .
Jegyzetek
- ↑ Nomenclature for Incompletely Specified Bases in Nucleic Acid Sequences Archiválva : 2017. augusztus 21., a Wayback Machine , NC-IUB, 1984.
- ↑ Az alapneveket az egyszerűség kedvéért használjuk, nem a nukleozidokat
Lásd még