A molukkói vallási konfliktus egy fegyveres konfliktus muszlim és keresztény közösségek között, amely 1999 és 2002 között zajlott le az indonéziai Maluku régióban .
A holland gyarmatosítókkal együtt érkezett Ambon szigetére a missziós oktatási tevékenység , amely elsősorban a keresztény lakosságot bátorította, a muszlimoktól eltérően a közszolgálatban is szívesebben támogatta őket. Lényeges, hogy az 1930-as népszámlálás eredményei szerint a keresztény területeken az írástudó lakosság aránya 50%, szemben az országszerte 7%-kal [1] . A gyarmati időktől az 1990-es évek elejéig Maluku szokatlanul magas arányban dolgozott a közszférában . Nyolc évvel később, 1998-ra ez a szám harmadával csökkent, ami aláásta az ezt a szektort használó keresztény lakosság stabilitását. Ugyanebben az évben Ázsiában folytatódott a pénzügyi válság , amely tovább csökkentette a közszférát. A konfliktus kirobbantásának kiváltó oka Indonézia második elnöke , Suharto tekintélyelvű „ Új Rend ” rezsimjének bukása volt , majd a rendetlenség, az általános gyengülés következtében országszerte felerősödtek a szeparatista, etnikai és vallási konfliktusok. a volt elnök nyomásgyakorlásának intézményeiről. Mire Suharto hatalma meggyengült, a fegyveres erők soraiban már különböző csoportok alakultak ki, amelyek saját, többnyire önző gazdagodási céljaikat követték. A biztonsági rendszer megbénult. Az ország harmadik elnökének , Habibinak a gazdaság decentralizálását célzó politikája csak súlyosbította a korrupciós helyzetet, és segített néhány szereplőnek megerősíteni pozícióját. Így a munkahelyek száma rohamosan csökkent [2] . A keresztények közszférában elfoglalt helyzete, valamint az Új Rend korszakában végrehajtott iszlamizáció aggodalmat keltett bennük a jövőjük miatt, és néhány amboni keresztény politikus nyíltan kijelentette, hogy "veszélyt jelent a keresztény identitásra" [3] .
Az Ambon város Batumir kerületében koncentrálódó muszlimok érezték a keresztények felsőbbrendűségét velük szemben a foglalkoztatás terén. Maluku kormányzója, Latukonsina, akit az 1990-es években neveztek ki, muszlim politikát folytatott. Mind ő, mind keresztény riválisai az 1992-1997-es latukonsini időszakban bűnbandák segítségét kérték, hogy megfenyegessék politikai riválisaikat. 1998. november 22-én Indonézia fővárosában, Jakarta városában összecsapás történt keresztény és muszlim bandák között. A konfliktus oka a szerencsejáték-üzlet monopóliumáért folytatott küzdelem volt. 13 embert öltek meg, több mint száz banditát vett őrizetbe a rendőrség, és küldte vissza Ambonba. Sokan közülük kiképeztek, és pénzt kaptak olyan katonai körök alapjaitól, amelyek konfliktust próbáltak kiprovokálni; bár Anthony Regan, a gyarmatosítás utáni konfliktuskutató úgy vélte, hogy a felelősség hatalomra hárítása az indonéziai megosztottság elsimításának általános modellje. Így vagy úgy, a konfliktus mindkét fele végül konszenzusra jutott, hogy az incidenst külső provokátorok provokálták [4] .
1999. január 19-én összetűzés tört ki Ambonban egy keresztény buszsofőr és egy muzulmán utas, a Boogie népből származó emigráns között . A konfliktus kezdetben közösségek közötti volt, de hamarosan konfrontációvá fejlődött Ambon keresztény és muszlim területei között. Az oldal támadni kezdte egymás vallási helyszíneit. Ezt követően a konfliktus átterjedt Ambon egész szigetére és 14 másik Moluccára [5] .