Csillagtevékenység

A csillagaktivitás a restrikciós endonukleázok specifitásának csökkenésének vagy megváltozásának jelensége , ami a DNS válogatás nélküli vágásához (restrikciójához)  vezet az in vitro reakció során . A csillagaktivitás olyan körülmények között következik be, amelyek eltérnek az adott enzim optimumától. A csillagok aktivitása következtében a nem kanonikus helyeken restrikció lép fel, néha teljes a specificitás elvesztése.

A csillagok aktivitásának okai a következők lehetnek:

•  a pufferoldat alacsony ionerőssége ,
• magas pH -érték ,
• magas koncentrációjú  glicerin (> 5% v/v),
• dimetil-szulfoxid (DMSO) jelenléte ,
• Mg 2+ jelenléte ( HindIII endonukleáz esetén ) stb. [1]

A glicerin magas koncentrációja különösen fontos a laboratóriumi gyakorlatban, mivel a kereskedelemben kapható restrikciós endonukleázokat általában jelentős mennyiségű glicerint tartalmazó pufferben szállítják (50% v/v). Ezért az enzimoldat nem megfelelő hígítása csillagaktivitáshoz vezethet. 

Külső linkek

• Star Activity archiválva 2018. január 11-én a Wayback Machine -nél - New England Biolabs
• Star Activity (Relaxation of Specificity) archiválva 2009. szeptember 27-én a Wayback Machine -nél - Fermentas
• A restrikciós enzimek csillagaktivitása – a csillagaktivitások részletes listája a TaKaRa-tól
• H; Wei; Therrien, C; Blanchard, A; Guan, S; Zhu, Z. A Fidelity Index a DNS restrikciós endonukleázok csillagaktivitásának szisztematikus mennyiségi meghatározását nyújtja   // Nucleic Acids Research : folyóirat. - 2008. - Vol. 36 , sz. 9 . -50 o . _ - doi : 10.1093/nar/gkn182 . — PMID 18413342 .

Linkek

1. ↑ Robinson, CR; Sliger, SG A kötött víz által közvetített molekuláris felismerés: Az EcoRI restrikciós endonukleáz csillagaktivitásának mechanizmusa  //  Journal of Molecular Biology : folyóirat. - 1993. - 1. évf. 234. sz . 2 . - P. 302-306 . - doi : 10.1006/jmbi.1993.1586 . — PMID 8230215 .