Fehérje domén

A fehérjedomén a fehérje harmadlagos szerkezetének  egy eleme , amely a fehérje meglehetősen stabil és független alstruktúrája, amelynek feltekeredése a többi résztől függetlenül megy végbe. Egy tartomány általában több másodlagos szerkezeti elemet tartalmaz . A szerkezetben hasonló domének nemcsak rokon fehérjékben (például különböző állatok hemoglobinjaiban ), hanem teljesen eltérő fehérjékben is megtalálhatók.

A doméneket gyakran külön elnevezéssel látják el, mivel jelenlétük közvetlenül befolyásolja a fehérje által végzett biológiai funkciókat - például Calmodulin Ca 2+ -kötő domén , homeodomén , amely különböző transzkripciós faktorokban felelős a DNS - hez való kötődésért stb.

Mivel a domének meglehetősen „autonóm” szerkezetük kialakításában és funkciójuk ellátásában, a géntechnológia segítségével lehetőség nyílik valamelyik fehérjéhez egy másikhoz tartozó domén „varrására” (kiméra fehérje létrehozására ). Egy ilyen kiméra szerencsével kombinálja mindkét fehérje funkcióit. Például a Cas9 DNS-kötő doménjének különböző szabályozó doménekkel való fuzionálásával lehetőség nyílt olyan mesterséges transzkripciós faktorok (crisprTF) előállítása, amelyek szelektíven a genom kívánt régióiba irányíthatók, egyedi készítésű „RNS útmutatók” segítségével [1]. [2] [3] . A Cas9 domén mesterséges restrikciós endonukleázok , represszorok és epigenommódosító enzimek , például DNS - metilázok és demetilázok létrehozására is használható.

Példák fehérje doménekre

Lásd még

Jegyzetek

  1. Lei S. Qi, Matthew H. Larson, Luke A. Gilbert, Jennifer A. Doudna, Jonathan S. Weissman, Adam P. Arkin, Wendell A. Lim . (2013) A CRISPR újrahasznosítása RNS-vezérelt platformként a génexpresszió szekvencia-specifikus szabályozására. Cell, 152 (5): 1173-1183 DOI:10.1016/j.cell.2013.02.022
  2. Farzadfard, F., Perli, SD és Lu, TK (2013). Hangolható és többfunkciós eukarióta transzkripciós faktorok CRISPR/Cas alapján. ACS szintetikus biológia, 2(10), 604-613. DOI: 10.1021/sb400081r
  3. Gilbert, L. A., Larson, MH, Morsut, L., Liu, Z. és társai. & Qi, L. S. (2013). A CRISPR által közvetített moduláris RNS által vezérelt transzkripció szabályozása eukariótákban. Cell, 154(2), 442-451.