VONALAK
A LINE-ok ( Long interspersed nukleáris elem , Long Dispersed Repeats [1] ) hosszú (több ezer bázispár [ 2] ) DNS-szekvenciák az eukarióta genomban , amelyek retrotranszpozonok , amelyek nem tartalmaznak hosszú terminális ismétlődéseket .
A mintegy 6400 bázispár hosszúságú LINE szekvencia első leírását 1980-ban tették közzé. [3]
Épület
A 3' végén a LINE-ok vagy poli( A )-farkat, adeninben gazdag szekvenciát vagy tandem ismétlődő szekvenciákat tartalmaznak. A LINE-ok egy vagy két nyitott olvasási keretet tartalmaznak [4] .
A LINE-oknak 5 szupercsaládja van [4] :
- R2 . Egy nyitott leolvasási keretet tartalmaznak, amely egy reverz transzkriptázt és egy endonukleázt kódol . Úgy gondolják, hogy ez a retropozonok legősibb családja, amely nem tartalmaz hosszú terminális ismétlődéseket .
- R.T.E. _ Tartalmaznak egy nyitott leolvasási keretet is, amely apurin-apurimidin endonukleázt és reverz transzkriptázt kódol.
Három másik szupercsalád két nyitott olvasási keretet tartalmaz. Ennek első terméke (ORF1) a retrovírusok
gag génjének termékéhez hasonló tulajdonságú fehérjét kódol .
- zsoké . A második nyitott leolvasási keret (ORF2) az apurin-apurimidin endonukleázt és a reverz transzkriptázt kódolja.
- L1 . Az ORF2 ugyanazokat az elemeket kódolja, mint a Jockey szupercsalád . Ennek a szupercsaládnak a vonalai a legjobban tanulmányozottak és a legelterjedtebbek az emlős genomban. Így az emberi genom több mint 500 ezer LINE-1 retropozon másolatot tartalmaz , ami a genom körülbelül 17%-a.
- I. _ Az ORF2 az apurin-apurimidin endonukleáz és a reverz transzkriptáz mellett az RNáz H -t is kódolja.
Lásd még
Jegyzetek
- ↑ Singer MF SINE-ek és LINE-ok: erősen ismétlődő rövid és hosszú, egymásba szúrt szekvenciák az emlős genomokban. (angol) // Cell. - 1982. - 1. évf. 28, sz. 3 . - P. 433-434. — PMID 6280868 .
- ↑ Antonio Lima de Faria. Dicséret a kromoszóma "hülyeségéért": a kelletlen molekula megvallása. — Moszkva: Binom. Tudáslaboratórium, 2012. - S. 275. - 312 p. - ISBN 978-5-9963-0974-0 .
- ↑ Adams, JW , Kaufman, RE , Kretschmer, PJ , Harrison, M. , Nienhuis, AW Hosszú, ismétlődő DNS-szekvenciák családja, amelynek egyik példánya a humán béta-globin gén mellett található // Nucleic Acids Research: Journal. - 1980. - V. 8 , 24. sz . - S. 6113 . doi : 10.1093 / nar/8.24.6113 .
- ↑ 1 2 López-Flores I., Garrido-Ramos MA Az eukarióta genomok ismétlődő DNS-tartalma // Garrido-Ramos MA Genome Dynamics. - 2012. - T. 7 . - S. 1-28 . — ISBN 978-3-318-02149-3 . - doi : 10.1159/isbn.978-3-318-02150-9 .