SARS-CoV-2 | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
A SARS-CoV-2 koronavírus atommodellje. | ||||||
tudományos osztályozás | ||||||
Csoport:Vírusok [1]Birodalom:RiboviriaKirályság:OrthornaviraeTípusú:PisuviricotaOsztály:PisoniviricetesRendelés:NidoviralesAlosztály:CornidovirineaeCsalád:KoronavírusokAlcsalád:KoronavírusokNemzetség:bétakoronavírusAlnemzetség:SarbecovírusKilátás:Súlyos akut légúti szindrómával összefüggő koronavírusNincs rang:SARS-CoV-2 | ||||||
Nemzetközi tudományos név | ||||||
SARS-CoV-2 | ||||||
Szinonimák | ||||||
|
||||||
A Baltimore Csoport | ||||||
IV: (+)ssRNS vírusok | ||||||
|
A SARS-CoV-2 ( Súlyos akut légúti szindrómával kapcsolatos koronavírus 2 [2] , korábban 2019-nCoV [3] [4] ) egy burkos egyszálú (+)RNS-vírus [5] [6] , amely az alnemzetségbe tartozik. Sarbecovirus [7] a Betacoronavirus [6] [8] nemzetségbe tartozó vírus .
A SARS-CoV-2-t először 2019 decemberében azonosították, és a COVID-19 veszélyes fertőző betegséget okozza [6] .
2020 januárjában az Egészségügyi Világszervezet nemzetközi aggodalomra okot adó közegészségügyi vészhelyzetnek nyilvánította a SARS-CoV-2 kitörést [9] , 2020. március 11-én pedig világjárványnak minősítette a betegség világméretű terjedését [10] [11 ] ] .
A SARS-CoV-2 vírust először 2019 decemberében mutatták ki tüdőgyulladásban szenvedő betegnél végzett nukleinsavelemzés eredményeként [12] . 2019. december 31-én az Egészségügyi Világszervezetet több, ismeretlen kórokozó által okozott vírusos tüdőgyulladás esetére is riasztották . 2020. január 7-én megerősítették az új vírussal kapcsolatos információkat, és magát a vírust is koronavírusnak minősítették [13] . A kínai egészségügyi szolgálatok voltak az elsők, akik teljesen megfejtették a vírus genomját [14] , és január 10-én tették nyilvánosan elérhetővé [15] . Január 12-ig 5 genomot regisztráltak a GenBank adatbázisban [16] [17] , január 26-ra számuk 28-ra nőtt [18] . A legkorábbi genom kivételével a genomokat a GISAID embargó alá vonja . A filogenetikai elemzés a Nextrain -en keresztül érhető el [19] . 2020. január 20-án a vírus emberről emberre történő átvitelét megerősítették a kínai Guangdong tartományban [20] .
A koronavírusok, köztük a SARS-CoV-2, általában SARS -t okoznak, de ugyanabba a családba tartoznak a veszélyes SARS-CoV és MERS-CoV vírusok , amelyek súlyos akut légúti szindrómát , illetve közel-keleti légúti szindrómát okoznak [13] . A koronavírus-fertőzés zooantroponotikus , vagyis állatról emberre is átterjedhet. Kiderült, hogy a SARS-CoV forrása a civet, a MERS -CoV pedig egypúpú tevék [21] . Lehetséges, hogy a SARS-CoV-2 esetében az állatok a fertőzés forrásai - a vírus genetikai elemzése hasonlóságokat mutatott ki a patkódenevérek körében gyakori koronavírusokkal , de még mindig nem tudni biztosan, hogy ők a fertőzés eredeti forrásai. fertőzés. Jelenleg a vírus terjedésének fő módja a személyről emberre történő terjedés [22] .
Különböző országok tudósai elemezték a vírus genomját, és megerősítik azt a tényt, hogy a vírus nagy valószínűséggel természetes eredetű. A különböző összeesküvés-elméletek félelem, pletyka és előítéletek légkörét teremtik meg, ezeket az elméleteket a tudományos közösség elítéli. A WHO főigazgatójával együtt a tudósok a tudományos bizonyítékok előmozdítását szorgalmazzák a dezinformáció helyett [23] .
A lappangási idő maximum 14 nap [24] . Az inkubációs időszak szakaszában a betegek hőkamerával történő azonosítása nem hatékony, mivel a testhőmérséklet a normál tartományon belül lehet, vagy kissé megemelkedett [25] .
Az Egyesült Államok Betegségellenőrzési és Megelőzési Központja szerint feltételezhető, hogy a fertőzés cseppen keresztül , a fertőzött testrészek nyálkahártyához való érintésével, érintéssel is.[ hogyan? ] élelmiszeripari termékekre. Az Orosz Föderáció Egészségügyi Minisztériumának klinikai ajánlásai már kimondták, hogy a vírus átviteli mechanizmusa aeroszol (levegő, levegő) és érintkezés [26] .
A legfrissebb adatok szerint a SARS-CoV-2 (a SARS-CoV-1-hez hasonlóan) az objektum felületétől függően 3 órától 4 napig képes életképes maradni a testen kívül [27] . A vírus a legstabilabb marad a rozsdamentes acélon (2 nap) és a műanyagon (3 nap). Ebben az időszakban koncentrációja több mint 3 nagyságrenddel csökken. A körülményektől függően a vírus koncentrációja 2-szeresére csökken a rozsdamentes acélon az első 3-7 órában, és a műanyagon - az első 5,5-9 órában. A levegőben laboratóriumi körülmények között 3 óra alatt nagyságrenddel, acélon - 18-19 óra alatt, műanyagon - 20 óra, ritka kivétellel 22 óra alatt csökken a vírus koncentrációja. Csomagok vagy levelek átvételekor nincs fertőzésveszély [28] .
A kínai Betegségellenőrzési és Megelőzési Központ szerint a szaporodási index 2 és 3 közé esik, ami az index meghatározása szerint egy fertőzött személytől megfertőzöttek számának felel meg. 2020. január 22-én 2,2 (egy másik korábbi tanulmány 3,3–5,47 közötti tartományt mutatott [29] ). Általában ennek a számnak az 1-nél nagyobb értékei azt jelentik, hogy a járvány tovább fog terjedni, és a fertőzés terjedését megakadályozó intézkedések segítenek csökkenteni a számot [30] .
A COVID-19 első eseteit 2019 decemberében jelentették a kínai Vuhan városában . Az esetek többsége a helyi Huanan Seafood Wholesale Markethez kapcsolódott , ahol élő állatokat árultak [31] . A korai szakaszban a fertőzöttek száma körülbelül 7,5 naponként megduplázódott [32] ; 2020. január közepére a vírus átterjedt Kína más tartományaira is, amihez hozzájárult Vuhan fontos közlekedési csomóponti státusza és a közeledő kínai újév miatt megnövekedett utazások száma [33] . 2019 és 2020 telén az új esetek és halálesetek többsége Hubeiben volt, Kína Vuhan központjában fekvő tartományban; azonban már február 26-án a Kínán kívüli új COVID-19-es esetek száma meghaladta az országon belüli fertőzések számát [34] . 2020. január végén az Egészségügyi Világszervezet a „nemzetközi aggodalomra okot adó vészhelyzet” [9] státuszát rendelte hozzá a betegség terjedéséhez , márciusban pedig világjárványnak minősítette [10] .
A fertőzés enyhe akut légúti vírusfertőzés [35] és súlyos formában [36] egyaránt előfordulhat . A legtöbb embernél a betegség gyógyulással végződik, és nincs szükség speciális terápiás intézkedésekre [37] . A súlyos esetek szövődményei közé tartozhat a tüdőgyulladás vagy a légzési elégtelenség , ami halálos kockázattal jár [38] [39] .
SARS-CoV-2 a koronavírusok taxonómiájában [40] [40] | |||||
---|---|---|---|---|---|
Coronaviridae | Orthocoronavirinae | Alfakoronavírus | |||
Betacoronavírus_ | Sarbecovírus | SARS-CoV | SARS-CoV- 1 | ||
SARS-CoV-2 | |||||
... | |||||
Merbecovírus | MERS-CoV | ||||
... | |||||
Embecovírus | HCoV-HKU1 | ||||
Betacoronavirus 1 | HCoV-OC43 | ||||
... | |||||
Gammakoronavírus | |||||
Deltacoronavírus | |||||
Letovirinae |
A Betacoronavirus szekvenciái hasonlóságot mutatnak a Kínából származó denevérekben található bétacoronavírusokkal. A vírus azonban genetikailag különbözik más koronavírusoktól, amelyek a következőket okozzák [41] :
A SARS-CoV-2 a SARS-CoV-hoz hasonlóan a Beta-CoV B vonal tagja [41] .
2020. március 29-ig a SARS-CoV-2 vírus 2058 genomját izolálták, amelyekben már észrevehetőek az evolúciós tendenciák. Legalább 7 mutáció ugyanahhoz az őshez tartozik [42] .
A SARS-CoV-2 RNS - szekvencia körülbelül 30 000 nukleotid hosszú .
A SARS-CoV-2 Wuhan-Hu-1 RNS -változata [16] (GenBank száma MN908947, RefCeq NC_045512 [18] ) 29 903 nukleotidot tartalmaz , 281 és 325 nukleotid hosszúságú nem transzlált régiókkal . A feltételezett kódoló régiók 10 fehérjén oszlanak meg.
Genetikailag a vírus 80%-ban azonos a SARS-CoV-val .
A virion mérete körülbelül 50-200 nanométer . A dekódolt vírusgenomon alapuló fehérjemodellezés kimutatta, hogy a koronavírus spike receptorkötő glikoproteinje kellően nagy affinitással rendelkezhet a humán angiotenzin-konvertáló enzim 2 (ACE2) fehérjéhez, és azt a sejtbe való belépési pontként használhatja. [43] . 2020. január végén két csoport Kínában és az Egyesült Államokban egymástól függetlenül kísérletileg kimutatta, hogy az ACE2 a SARS-CoV-2 vírus [44] [45] [ 46] , valamint a SARS-CoV vírus receptora. 47] . 2020 márciusában a cikk preprintjében azt javasolták, hogy a vírus az SP fehérjét használja az emberi sejtekbe való behatoláshoz, amelyen keresztül kölcsönhatásba lép a fertőzött emberi sejt basigin (CD147) fehérjével [48] [49] .
A kínai járvány kezdetétől 2020 márciusáig legalább 149 változást találtak 103 nyilvánosan elérhető SARS-CoV-2 genom elemzése alapján. . Ahogy a tanulmány kimutatta[ mi? ] , a koronavírust két altípusra osztották: a leggyakoribb L-re (70%) és S-re (30%). Az L altípus gyakoribb volt a vuhani járvány korai szakaszában, azonban 2020 január elejére gyakorisága csökkent. Az emberi beavatkozás erős szelektív nyomást gyakorol erre az altípusra, amely agresszívebb és gyorsabban terjedhet. Másrészt az evolúciósan idősebb és kevésbé agresszív S altípus relatív abundanciája valószínűleg megnőtt a gyengébb szelektív nyomás miatt [50] [51] .
A beteg emberekből izolált SARS-CoV-2 genom 160 mintájának elemzése kimutatta, hogy az A és C koronavírus fajtái gyakoriak az európaiakban és az amerikaiakban, a B fajta pedig Kelet-Ázsiában a leggyakoribb [52] [53] .
VírusmutációkTöbb száz SARS-CoV-2 mutációt fedeztek fel. A tudósok azon dolgoznak, hogy megállapítsák, hogyan befolyásolja ez a vírus fertőzőképességét és letalitását. Az új-mexikói Los Alamos Nemzeti Laboratórium tudósai a vírus jellegzetes alakját adó tüske variációit elemzik. A Global Initiative on Sharing All Influenza Data (GISAID) szerint a kutatók elemezték a brit koronavírus-esetekre vonatkozó információkat Sheffieldben. .
A teszteredmények szerint emberekben több COVID-19-et mutattak ki a vírus ezen mutációjával. A tudósok azonban nem találtak bizonyítékot arra, hogy ezek az emberek súlyos koronavírus-fertőzést szenvedtek volna, vagy több időt töltöttek kórházban. .
A University College London kutatói a vírus 198 visszatérő mutációját tudták azonosítani. François Balloux azt mondta: "A mutációk önmagukban nem rosszak, és egyelőre nincs olyan adat, amely arra utalna, hogy a SARS-CoV-2 a vártnál gyorsabban vagy lassabban mutálna." .
A WHO képviselői arról számoltak be, hogy a D614G mutációt februárban azonosították, és körülbelül 50 víruslánc ismert.
A New York-i Genome Center és a New York-i Egyetem molekuláris biológusai szerint:
A széles körben elterjedt D614G mutáció jelentősen felgyorsítja a vírus átvitelét számos emberi sejttípus között, beleértve a tüdőből, a májból és a belekből származó sejteket. A vírus fokozott fertőzőképességének egyik oka az lehet, hogy ez a mutáció ellenállóbbá teszi a SARS-CoV-2-t az emberi enzimekkel szemben.
— [54]Egyértelmű és vitathatatlan adatok a SARS-CoV-2 vírussal szembeni immunitás eddigi időtartamáról[ mi? ] sz. Például Vinith D. Menaheri, a Galvestoni Texasi Egyetem virológusa azt sugallja, hogy az új koronavírus elleni immunitás az emberekben egy-két évig fennmaradhat. Florian Krammer, a New York-i Icahn Medical School mikrobiológusa ugyanakkor azt a véleményét fejezi ki, hogy a koronavírussal megbetegedetteknél a szervezet idővel, bár abbahagyja a SARS-CoV elleni antitestek termelését. 2, azonban az immunválasz elég erős marad, és lehetővé teszi az új betegségek átvitelét különösebb nehézségek nélkül [62] .
Ugyanakkor a pekingi orvosi főiskola tudósai, akik makákókon végeztek kísérleteket, kijelentették, hogy ezekben az állatokban lehetetlen a koronavírussal való újrafertőződés [63]. .
Az Orosz Föderáció Védelmi Minisztériumának Kirov Katonai Orvosi Akadémia kutatása szerint [64] , jelenleg a SARS-CoV-2 elleni immunitás időtartamára és intenzitására vonatkozó adatok halmozódnak fel, de egészséges embereknél a COVID-19 koronavírus-fertőzés előtt, egy határozott klinikai képű betegség után erős immunitás alakul ki a vírussal szemben. fejlett. A koronavírus -család többi tagjával szemben nem alakul ki immunitás a COVID-19 után.
Arra is van bizonyíték, hogy körülbelül 6 hónappal a kezdeti fertőzés után az újrafertőződés elleni védelem megközelítőleg 80%-os volt, a hímek és a nőstények újrafertőződési arányában nincs jelentős különbség. De a 65 év felettiek esetében ez a védelem 47%-ra csökken. Egy másik tanulmányban körülbelül 3500 véletlenszerűen kiválasztott vuhani háztartásból több mint 9500 embert teszteltek 9 hónapon keresztül, és a fertőzöttek körülbelül 40%-ánál fejlődtek ki semlegesítő antitestek, amelyek a teljes vizsgálati időszak alatt kimutathatók voltak [65] .
2020. január 22-én a Journal of Medical Virology című orvosi folyóirat kínai tudósok tanulmányát tette közzé, amelyben a SARS-CoV-2 vírus öt genomját hasonlították össze 276 ismert, embert és különböző állatokat érintő koronavírus genomi szekvenciával. . A tudósok szerint a koronavírusok megszerkesztett filogenetikai fája azt mutatja, hogy körülbelül két évvel ezelőtt új vírusok jelentek meg egy közös őstől a denevér koronavírus és valószínűleg a kínai kígyók koronavírusa - a dél-kínai többcsíkos krait vagy kínai kobra - közötti homológ rekombináció révén. (mindkét kígyófajtát élelmiszerként árultak a vuhani piacon [ ) [66] [67]
A Nature folyóiratban megjelent cikkben azonban számos kutató vitatja a kínai tudósok ezt a következtetését [68] [69] , és azzal érvelnek, hogy az ő szemszögükből nézve nem valószínű, hogy a kígyók fertőzésforrásként működnének. a legvalószínűbb jelöltek erre a szerepre az emlősök és a madarak . Paulo Eduardo Brandao, a São Paulo-i Egyetem virológusa szerint a kínai tudósok nem szolgáltattak bizonyítékot arra vonatkozóan, hogy a kígyók megfertőződhetnek egy új koronavírussal, és hordozóként szolgálhatnak, többek között azért, mert nincs megbízható bizonyíték a koronavírusok más hordozóiban való jelenlétére. mint az emlősök és a madarak. Cui Jie, a Shanghai Pasteur Intézet virológusa, aki 2017-ben tagja volt annak a csapatnak, amely SARS-hez kapcsolódó vírusokat azonosított denevérekben, azt mondja, hogy a 2002-2003-as SARS-járvány után végzett terepmunka csak emlősökben talált ilyen vírusokat. .
Kínai tudósok egy másik csoportja azt javasolta [70] , hogy a denevérek a SARS-CoV-2 vírus forrásai , mivel a SARS-CoV-2 minták RNS-e 96%-ban egybeesett a vírus RNS-ével, amelyet korábban ázsiai patkóban találtak. denevérek ( lat. Rhinolophus affinis ). Ezenkívül a SARS-CoV-2 koronavírus 79,5%-ban hasonlít a SARS-vírushoz, amelynek járványa 2002-ben kezdődött Kínában [71] . A Guangzhou-i Dél-Kínai Mezőgazdasági Egyetem és a montreali Quebec Egyetem kutatói úgy vélik, hogy a pangolinok lehettek az új koronavírus forrása [72] [73] .
A Nature Microbiology folyóiratban megjelent cikk szerzői megállapították, hogy a SARS-CoV-2 és a Rhinolophus affinis denevérből izolált RaTG13 denevérvírus 40-70 évvel ezelőtt hasadt szét. Ennek az eseménynek a legnagyobb valószínűsége, három különböző bioinformatikai megközelítéssel számolva, 1948-ra, 1969-re vagy 1982-re esett [74] [75] . A vírus gazdaszervezetében bekövetkezett változások általában új adaptációkkal járnak az új gazdafaj sejtjeinek optimális felhasználása érdekében, a SARS-CoV-2 úgy tűnik, hogy a világjárvány kezdete óta alig vagy egyáltalán nem igényelt jelentős humán alkalmazkodást. A SARS-CoV-2-höz legközelebb álló denevérvírus, az RmYN02 (közös őse 1976 körül) egyértelmű bizonyítékot mutat a denevérek társfertőzésére és evolúciójára más fajok részvétele nélkül. A SARS-CoV-2 progenitor képes hatékony emberről emberre átvitelre, mivel adaptív evolúciós története denevéreknél, nem pedig embereknél [76] .
A SARS-CoV-2 egy burokkal rendelkező vírus. Az ilyen vírusok burok- lipid kettős rétege meglehetősen érzékeny a kiszáradásra, a megemelt hőmérsékletre és a fertőtlenítőszerekre, így az ilyen vírusok könnyebben sterilizálhatók , mint a bevonat nélküli vírusok, kevésbé jól élnek túl a gazdasejten kívül, és általában gazdaszervezetről gazdára terjednek .
A mai napig (2020. március) nem állnak rendelkezésre kellően teljes és megbízható becslések a vírusaktivitás szervezeten kívüli életképességéről és perzisztenciájáról, a nagyszámú befolyásoló tényező, a viszonylag rövid megfigyelési idő és a kapott adatok kis mennyisége miatt.
A Szun Jat-szen Egyetem (Zsongshan) szakemberei által végzett elemzés alapján a következő becslések ismertek: a koronavírus terjedésének optimális feltételei az 5-8 °C közötti levegőhőmérséklet és 35-50%-os páratartalom [77 ] . Ezeket az eredményeket a 2020. január 20. és február 4. közötti csúcsincidencia elemzése során kaptuk Kínában és 26 másik országban, összesen 24 139 igazolt betegségeset alapján, amelyek közül a betegek 68,01%-a Hubei tartományból származott. Ugyanakkor figyelembe vették a lappangási időszakot, valamint a karanténintézkedéseket, amelyeket fokozatosan vezettek be a különböző városokban. A tanulmány kimutatta, hogy a Covid-19 aktivitása csökkent, ha a hőmérséklet meghaladta a 8,72 °C-ot. 30 °C-on a fertőzési arány nulla lett.
A kutatás során a Hongkongi Egyetem tudósai azonosították [78][79] , hogy a koronavírus körülbelül négy fokos hőmérsékleten hosszú ideig rendkívül stabil marad, és fertőtlenítés hiányában csak 14 nap múlva kezd csökkenni az aktivitása. Ugyanakkor a vírus nem tolerálja a magas hőmérsékletet, és 70 fokon öt percen belül deaktiválódik. Szerintük papíron három óra elteltével nem mutatták ki a vírust, a ruhákon és a kezelt fán legfeljebb két napig, az üvegen négy napig, a műanyagon hét napig tartott a vírus. Az orvosi maszkok külső felületén akár hét napig is kitart, ami azt jelzi, hogy alapos fertőtlenítésre van szükség.
Az egyesült államokbeli több kutatóközpont vizsgálati eredményei szerint a vírus három óra elteltével életképes maradhat a levegőben, réz felületen - akár négy óráig, kartonon - 24 óráig, műanyagon és rozsdamentes acélon - felfelé. két-három napig [80] .
Szótárak és enciklopédiák | |
---|---|
Taxonómia | |
Bibliográfiai katalógusokban |