Affinitás
Az affinitás az egyik objektum (test) azon képessége, hogy kommunikáljon egy másik tárggyal, és ezáltal új összetett objektumot alkosson. Az affinitás fogalmát mind fizikai objektumokra ( elemi részecskék , atomok - például elektronaffinitás ), mind összetett molekulákra (a kémiában ), beleértve a fehérjéket is ( biokémiában ) alkalmazzák. Az affinitás erősségét jellemző együttható a tárgyak (a továbbiakban molekulák) kötése során felszabaduló vagy elhasznált kötési energia , kilojoule-ban (kJ) vagy elektronvoltban (eV) mérve .
Az " affinitás " vagy "affinitás" kifejezés valójában az "affinitás" fogalmának szinonimája, de az orosz tudományos nyelvben ezt a szót inkább az immunológiában használják ( antigén és antitest kölcsönhatása ). A szervetlen kémiában az " elektronegativitás " kifejezés hasonló jelentéssel bír , az egyes atomok egymáshoz való affinitását jellemzi.
A biokémiában a ligandum receptorhoz való affinitását az úgynevezett K i koefficiens jellemzi ( a receptorkötődéshez használt disszociációs konstans és az enzimgátlás-disszociációs konstans rövidítése a receptorokhoz való kötődéshez ( receptor kötődés) kapcsolatban ) . valamint enzimgátlás ). K i kiszámítható [1] a következő képlettel. Ha az EC 50 a ligandum maximális hatásos koncentrációjának fele, ami a ligandum receptorra gyakorolt hatásának erősségét jellemzi, [ligand] a ligandum koncentrációja az oldatban, K d a ligandum-receptor kötés disszociációs állandója . .
![{\displaystyle K_{i}={\frac {EC_{50}}{1+{\frac {\left[{ligand}\right]}{K_{d}}}}}}](https://wikimedia.org/api/rest_v1/media/math/render/svg/727313502767ec31337b55f98a94f76b2c789836)
Tehát K i egy versengő ligandum koncentrációja, ha az a rendszer egyensúlyi állapotában a rendelkezésre álló receptorok feléhez kapcsolódik. Minél alacsonyabb a Kj , annál nagyobb az affinitás a receptorhoz ehhez a ligandumhoz. [egy]
Számos nyilvános adatbázis ( Ki Database ) létezik a Ki együtthatókról , mint például a BindingDB.org vagy a PDSP Ki Database .
Megjegyezzük, hogy K i a kölcsönhatás erősségét jellemzi (beleértve azt az időt is, ameddig a receptort a ligandum elfoglalja), de nem jellemzi ennek az erőnek a modalitását (polaritását) (a receptor gátlása vagy aktiválása).
Léteznek farmakológiai kutatásban használt szimulátorok , amelyekkel ki lehet számítani adott ligandumok adott receptorfehérjékhez való kapcsolódási együtthatóit ( lásd Molekuláris modellezés ).
Linkek
- Kémiai affinitás // Brockhaus és Efron enciklopédikus szótára : 86 kötetben (82 kötet és további 4 kötet). - Szentpétervár. , 1890-1907.
- Amilolitikus enzimek szerkezetének számítógépes modellezése
- Háttér a fehérjékről, a kis molekulákról és a kötődésről
Jegyzetek
- ↑ 1 2 kötődési adat a receptorok egy osztályával (hozzáférhetetlen kapcsolat)