Az emberi mikrobiom

Az oldal jelenlegi verzióját még nem ellenőrizték tapasztalt közreműködők, és jelentősen eltérhet a 2022. szeptember 3-án felülvizsgált verziótól ; az ellenőrzéshez 1 szerkesztés szükséges .

Az emberi mikrobiom az emberi testben élő mikrobák összessége [1] , beleértve az olyan területeket, mint a bőr, az emlőmirigyek, a nemi szervek, a tüdő, a nyálkahártyák, a testnedvek, az epeutak és a gyomor- bél traktus .

Az emberi mikrobiomba tartoznak a baktériumok , archaeák , gombák , protisták és vírusok [2] . A genomika összefüggésében az " emberi mikrobióma" kifejezést néha a rezidens mikroorganizmusok kollektív genomjaira utalják ; [3] Az emberi metagenom kifejezés azonban ugyanazt jelenti.

Az emberben élő mikroorganizmusok számának első becslése szerint a mikrobiális sejtek száma tízszerese az emberi sejtek számának, azonban a későbbi becslések ezt az arányt 3:1-re, sőt megközelítőleg ugyanennyire csökkentették. [4] [5] [6] [7] Az emberi szervezetben lévő mikroorganizmusok egy része kommenzális , azaz együtt élnek anélkül, hogy az embernek kárt okoznának; mások mutalista (kölcsönösen előnyös) kapcsolatokat ápolnak gazdáikkal. [3] [8] Ezzel szemben egyes nem patogén mikroorganizmusok károsíthatják az emberi szervezetet az általuk termelt metabolitokon, például a trimetilaminon keresztül, amelyet az emberi szervezet trimetil-amin-N-oxiddá alakít át az FMO3 oxidáló komplexen keresztül . [9] [10] Bizonyos mikroorganizmusok számos nagyon fontos feladatot látnak el, amelyekről ismert, hogy előnyösek az emberi gazdaszervezet számára, de legtöbbjük szerepe nem teljesen ismert. Normális mikrobiotának néha úgy tekintenek, hogy normális körülmények között jelen kell lennie anélkül, hogy betegséget okozna. [3]

Az emberi mikrobióta elemzésére a Human Microbiome projektet hajtották végre , amely számos problémát megoldott, mint például az emberi mikrobióta genomjának szekvenálása és elemzése, a bőrben, a szájban, az orrban, az emésztőrendszerben és a hüvelyben élő mikrobiotára összpontosítva. [3] 2012-ben mérföldkőhöz érkezett, amikor közzétette kezdeti eredményeit. [tizenegy]

Terminológia

Bár a szakirodalom gyakran használ olyan kifejezéseket, mint a flóra vagy a mikroflóra , szakkifejezéssel ez téves elnevezés, mivel a flóra gyökérszó a növényekre, míg a biota kifejezés egy adott ökoszisztéma élőlényeinek összességére utal. Jelenleg a  mikrobiota megfelelőbb kifejezést használják , bár használata nem árnyékolta be a flóra bevett használatát és felismerését a baktériumokkal és más mikroorganizmusokkal kapcsolatban. Mindkét kifejezést különféle szakirodalom használja. [nyolc]

Relatív számok

2014-től kezdve különböző források gyakran beszámoltak arról, hogy az emberi szervezetben a mikrobiális sejtek száma körülbelül 10-szer nagyobb, mint az emberi sejtek száma. Ez az adat azon becsléseken alapul, hogy az emberi mikrobiom körülbelül 100 billió baktériumsejtet és 10 billió egy felnőtt saját sejtet tartalmaz. [4] 2014-ben az Amerikai Mikrobiológiai Akadémia közzétett egy GYIK-et, amelyben kiemeli, hogy a mikrobiális sejtszám és az emberi sejtszám hozzávetőleges. Azt is megjegyezték, hogy a közelmúltban végzett tanulmányok új becslést adtak az emberi sejtszámra vonatkozóan, körülbelül 37,2 billió, ami azt jelenti, hogy az eredeti 100 billió baktériumsejtre becsült mikrobiális és emberi sejtek aránya helyes, közelebb a 3:1-hez . 4] [5] 2016-ban egy másik tudományos csoport új becslést készített, amely szerint az arány körülbelül 1:1. [7] [6]

Kutatás

A mikrobióma meghatározásának problémája a baktériumok, eukarióták és vírusok közé tartozó mikrobiális közösség tagjainak azonosításával kapcsolatos. [12] A DNS-t főként e közösségek azonosítására használják, bár RNS-t, fehérjéket és metabolitokat is használnak. [12] [13] A DNS-alapú mikrobióm-vizsgálatok általában a shotgun szekvenálási módszert alkalmazó, közelmúltbeli metagenomikai vizsgálatoknak tulajdoníthatók. Ez a módszer egy teljes metagenomikus megközelítés, amely a különböző közösségek funkcionális potenciáljának vizsgálatára is használható. [12] Az emberi mikrobiom kutatásának egyik problémája, hogy az emberi DNS nem vesz részt a kutatásban. [tizennégy]

Az egyik fő kérdés az emberi mikrobiom egyszerű elemzésén túl az, hogy létezik-e közös „csontváz”, vagy létezik-e olyan közös mikroorganizmuscsoport, amely tovább növeli az emberek fajdiverzitását. [15] [16] Ha létezik ilyen csontváz, akkor a fajösszetétel változásától függően lehetséges lenne a kialakuló betegségek azonosítása, ami a Human Microbiome Project egyik célja. Ismeretes, hogy az emberi mikrobióma (bél mikrobióma) rendkívül változatos és minden emberre egyedi, amit az egér tesztcsoportjaiban is megfigyeltek. [nyolc]

2012. június 13-án az NIH igazgatója, Francis Collins nyilatkozatot tett a Human Microbiome Project (HMP) fontosságáról. [11] A bejelentést egy sor tudományos közlemény kísérte, amelyek ugyanazon a napon jelentek meg a Nature -ben [17] [18] és a Public Library of Science -ben (PLoS). Az egészséges egyének mikrobiomtérképének genomszekvenálási technikák segítségével történő elemzésével a tudósok referencia-adatbázist hoztak létre a mikrobiális közösségek normális eltéréseihez. Több mint 5000 biológiai mintát gyűjtöttek 242 egészséges önkéntestől, a test különböző részeiről. Ennek eredményeként elemzést végeztek egy személy teljes DNS-éről és a benne élő mikrobiotáról. Az ilyen adatok a bakteriális riboszomális RNS, a 16S rRNS génjeinek azonosításával értelmezhetők . A kutatók megállapították, hogy több mint 10 000 mikroorganizmusfaj alkot összetett ökoszisztémát az emberben, és a nemzetségek 81-99%-át azonosítják az ilyen ökoszisztémában.

Shotgun Method

Gyakran nem lehetséges számos baktérium , archaea vagy vírus tenyésztése laboratóriumi környezetben. A probléma megoldása a metagenomikai technológiában használt szekvenálási technológiák bevezetése . A teljes működéskép elemzése és az egyes mikrobiális törzsek jellemzése nagy lehetőségeket rejt magában a terápia és az egészségi állapotok diagnosztizálása terén. [19]

Mintagyűjtés és DNS izolálás

A fő kihívás az elemzéshez elegendő mikrobiális DNS gyűjtése, miközben a minta tisztasága megmarad; ezért különféle dúsítási módszereket alkalmaznak. A DNS-kivonási módszer különösen univerzális eszköz az egyes baktériumtörzsekkel végzett munka során , ahol fontos a genom olyan stabil régióinak izolálása , amelyek nem alkalmasak a gyors lízisre . A mechanikai megsemmisítést általában előnyben részesítik a kémiai megsemmisítéssel szemben. [19]

Adattár előkészítése és szekvenálása

A szekvenálási reakciók leggyakrabban használt platformjai az Illumina , az Ion Torrent , az Oxford Nanopore MinION és a Pacific Bioscience Sequel. Nincs utalás a felhasználandó minta megfelelő mennyiségére. [19]

A metagenom összeállítása

Bár a megközelítést aktívan használják, vannak nehézségek, amelyeket le kell küzdeni. A lefedettség az egyes genomok bőségétől függ az adott közösségben; az alacsony abundanciájú genomok fragmentálhatók, ha a szekvenálás mélysége nem megfelelő (a hiányosságok elkerülésére használják). Szerencsére vannak összeszerelők, amelyek megkönnyítik a metagenom összefüggéseinek megtalálását, mert ha több száz törzs van jelen, akkor a szekvenálási mélységet maximalizálni kell. [19]

contig binning

Nem ismert eleve, hogy az egyes kontigek melyik genomból származnak , sem a mintában jelenlévő genomok száma. Ennek a lépésnek a fő célja a kontigok különböző típusokra történő szétválasztása. Az elemzés végrehajtásának mögöttes módszerei lehetnek felügyelt (pl. ismert szekvenciájú adatbázisok) vagy felügyelet nélküliek (kontig csoportok közvetlen keresése az összegyűjtött adatokban). Mindkét módszerhez azonban szükség van egy metrikára, amely meghatározza a hasonlósági pontszámot egy adott kontig és a csoport között, amelybe el kell helyezni, és egy algoritmusra van szükség a csoporteloszlás hasonlóságának átalakítására. [19]

Az eredmények elemzése feldolgozás után

Az eredmények megerősítésére számos statisztikai elemzést, például ANOVA -t kell végezni . Az ilyen tesztek értékelhetik és meghatározhatják a különböző csoportok közötti különbség mértékét. Ha a tesztek grafikus eszközökhöz kapcsolódnak, akkor az eredmények könnyen értelmezhetők a könnyebb bemutatás és érthetőség érdekében. [19]

Ha a kapott metagenomot a megfelelő sorrendben összeállítottuk, megkaphatjuk a mikrobiom funkcionális potenciálját. Az ilyen rendszerek számítása során számos probléma adódik, mivel a metagenom összeállító rendszerek az ilyen rendszerek összetettsége miatt gyengébb minőségűek, és sok gén hiányos vagy töredezett lehet. A génazonosítási lépést követően az adatok felhasználhatók funkcionális annotáció végrehajtására a célgének többszörös összehangolásával az ortológ adatbázisokkal. [húsz]

Gének markeranalízise

Ez egy olyan technika, amelyben primereket használnak egy adott genetikai régió megcélzására filogenetikai sorozat létrehozása érdekében . A genetikai domént egy nagyon variábilis régió jellemzi, amely részletes azonosítást biztosít. Ezzel együtt vannak olyan konzervált régiók is, amelyek a PCR -ben használt primerek kötőhelyeiként működnek . A baktériumokat és az archaeákat jellemző fő gén a 16S rRNS gén, míg a gomba azonosítás az Internal Transcribed Spacer (ITS) alapján történik. Ez a módszer gyors és elegendő a mikrobaközösség osztályozásához. A módszer alkalmas szennyezett DNS-re is (a gazdaszervezetből származó szennyeződés). A primer affinitása az összes DNS-szekvencia között változik, ami torzításhoz vezethet az amplifikációs reakció során. Ezért a primerek kiválasztásának optimalizálása segíthet csökkenteni az ilyen hibákat, ha teljes mértékben ismerjük a mintában jelenlévő mikroorganizmusokat és azok relatív abundanciáját. [21]

A génmarker analízise függhet a primer megválasztásától; az ilyen típusú elemzéseknél kívánatos egy jól validált protokollon belül végezni (például az Earth Microbiome Projectben használt protokollon belül ). Az elemzés első lépése a szekvenálási hibák eltávolítása. Sok szekvenáló platform nagyon megbízható, de a látszólagos szekvenciadiverzitás nagy része még mindig a szekvenálási folyamat hibáinak köszönhető. E hibák számának csökkentése érdekében használhatja a szekvenciák kombinációját egy operatív taxonómiai egységgé (OTU), amelyet a következő lépésben már használunk. Ez a módszer azonban elveti az SNP -ket , amint egy OTU-ba egyesülnek. Egy másik megközelítés az oligotipizáláson alapul , amely specifikus információkat tartalmaz a 16s rRNS szekvenálásáról a kis nukleotidvariációk kimutatására és a szorosan kapcsolódó, különálló taxonok megkülönböztetésére. Ezek a módszerek a DNS-szekvenciák táblázatát és a mintánkénti különböző szekvenciák számát adják meg kimenetként. [21]

Az elemzés másik fontos lépése a mikrobiális szekvenciák taxonómiai név hozzárendelése. Ez gépi tanulási megközelítésekkel történik, amelyek körülbelül 80%-os nemzetségszintű pontosságot érnek el. Más népszerű elemzőcsomagok támogatják a taxonómiai osztályozást a referencia-adatbázisokkal való pontos egyezések használatával, és nagyobb specifikusságot, de gyengébb érzékenységet biztosítanak. [21]

Filogenetikai elemzés

Számos filogenetikai feltevéseken alapuló módszer 16Sp RNS géneket használ az archaeákhoz és baktériumokhoz, illetve 18SRNS géneket az eukarióta sejtekhez. A filogenetikai összehasonlító módszerek a mikroorganizmusok számos karakterének összehasonlításán alapulnak; az elv a következő: minél közelebb állnak egymáshoz, annál több a közös bennük. Általában ezeket a módszereket filogenetikai általánosított legkisebb négyzetekkel vagy más statisztikai elemzésekkel használják, hogy értelmesebb eredményeket kapjanak. Ez általában a PICRUSt alkalmazáson keresztül történik , meglévő adatbázisok használatával. [22]

A filogenetikai távolságfelismerést általában UniFrac -al vagy hasonló eszközökkel, például a Sorezen-indexszel vagy a Rao-indexszel végzik a különböző közösségek közötti különbségek számszerűsítésére. Mindezeket a módszereket negatívan befolyásolja a horizontális géntranszfer (HGT), mivel hibákat vezethet be, és korrelációkhoz vezethet a távoli fajok között. Számos módja van a HGT negatív hatásának csökkentésére: több gén vagy számítási eszközök használata a feltételezett HGT események valószínűségének becslésére.

A mikrobák típusai

Baktériumok

A baktériumok és gombák a bőrön és a nyálkahártyákon a test különböző részein élnek. Szerepük része a normális, egészséges emberi fiziológia felépítésének, azonban ha a mikrobapopulációk a tipikus tartományon kívülre esnek (gyakran az immunrendszer károsodása miatt), vagy ha mikrobák telepednek meg (például rossz higiénia vagy sérülés miatt) a test, általában nem kolonizált vagy steril (pl. vér vagy alsó légutak vagy hasüreg) súlyos betegséghez vezethet (bakteremiát/szepsist, tüdőgyulladást és hashártyagyulladást okozva). [23]

A Human Microbiome projekttel kapcsolatos munka eredményei azt mutatták, hogy az emberek több ezer baktériumfajt tartalmaznak saját jellegzetességekkel a test különböző részein. Az olyan területeken, mint a bőr és a hüvely, kisebb a fajdiverzitás, mint a szájban és a belekben, ahol a diverzitás rendkívül nagy. Ezenkívül az azonos fajhoz tartozó, a szájüregben található baktériumoknak számos altípusa van, amelyek a szájüreg különböző helyein élnek. [24] [25]

Becslések szerint az emberi bélben élő 500-1000 baktériumfaj több csoportba tartozik: a Firmicutes és Bacteroidetes dominálnak , de előfordulnak Proteobacteria , Verrumicrobia , Actinobacteria , Fusobacteria és Cyanobacteria is . [26]

Számos baktérium, mint például az Actinomyces viscosus és az A. naeslundii , a szájban él, és a plakk nevű ragacsos anyag részei . Ha nem távolítják el őket a fogmosás során, akkor az egész massza megkeményedik és fogkő képződik . Egyes baktériumok egy sor savat választanak ki, amelyek feloldják a fogzománcot , ami fogszuvasodást okoz .

A hüvely mikroflórája főként különböző laktobacillusfajokból áll . Sokáig azt hitték, hogy ezek közül a fajok közül a legelterjedtebb a Lactobacillus acidophilus , de később kiderült, hogy valójában a L. iners volt a leggyakoribb , majd a L. crispatus . A hüvelyben található egyéb laktobacillusok a L. jensenii , a L. delbruekii és a L. gasseri . A hüvely mikroflórájának megzavarása olyan fertőzésekhez vezethet, mint a bakteriális vaginosis vagy candidiasis .

Archaea

Az archaeák jelen vannak az emberi bélben, de sokkal kisebb számban, mint a baktériumok . [27] Az uralkodó csoport a metanogének , különösen a Methanobrevibacter smithii és a Methanosphaera stadtmanae . [28] Mindazonáltal csak az emberek körülbelül 50%-ának van könnyen kimutatható változata ezeknek az archaeáknak. [29]

2007-ig nem találtak egyértelmű példát kórokozókra [ 30] [31] , annak ellenére, hogy összefüggést javasoltak néhány metanogén jelenléte és a parodontitis között . [32]

Gomba

A gombák, különösen az élesztőgombák , jelen vannak az emberi bélrendszerben. [33] [34] [35] [36] A legtöbbet vizsgált Candida törzsek annak köszönhetőek, hogy képesek patogénné válni immunhiányban , vagy akár zavarokat okozni egy egészséges gazdaszervezetben. [34] [35] [36] Egyes gombák megtelepednek a bőrön, [33] például a Malassezia törzsek , ahol a faggyúmirigyekből termelődő olajokat fogyasztják . [37] [38]

Vírusok

A vírusok, különösen a bakteriális vírusok ( bakteriofágok ), a test különböző területein laknak, beleértve a bőrt, [39] a beleket, [40] a tüdőt, [41] a szájüreget. [42] A vírusokat számos betegséggel hozták összefüggésbe. A vírusok a bakteriális közösségekkel fennálló kapcsolatok összetettségét tükrözik. [43] [44] [45]

Anatómiai zónák

Skin

A tíz egészséges egyén mindegyikén 20 bőrfolton végzett vizsgálat 205 azonosított nemzetséget tárt fel 19 baktérium törzsben, és a baktériumok többsége négy törzshöz tartozik: Actinobacteria (51,8%), Firmicutes (24,4%), Proteobacteria (16,5%) és Bacteroidetes (6,3%). [46] Az egészséges emberi bőrön nagyszámú gombanemzetség van jelen, a test bizonyos területein elváltozásokkal; kóros körülmények között azonban bizonyos nemzetségek hajlamosak uralni az érintett területet (például atópiás dermatitisben a Malassezia dominál ). [33]

A bőr gátként szolgál, hogy megakadályozza a kórokozó mikrobák behatolását, állandó vagy ideiglenes élőhelyük. A rezidens mikroorganizmusok típusai az emberi test bőrének típusától függően eltérőek. A legtöbb mikroba a bőr felszíni sejtjein található, vagy szívesebben kötődik a mirigyekhez (faggyúmirigyekhez vagy verejtékmirigyekhez), mivel ezek látják el a mikrobákat vízzel, aminosavakkal, zsírsavakkal és egyéb tápanyagokkal. [3]

A szem nyálkahártyája

Kis számban gombák és baktériumok vannak jelen a kötőhártyában [33] [47] , beleértve a Gram-pozitív coccusokat ( Staphylococcus és Streptococcus ), Gram-negatív rudakat és coccusokat ( Haemophilus és Neisseria ) [47] és gombákat ( Candida , Aspergillus , és Penicillium [ 33] A könnyek baktericideket, például lizozit tartalmaznak , így a mikroorganizmusok nehezen tudnak túlélni és megtelepedni a hámfelületeken .

Gasztrointesztinális traktus

Az emberi mikrobiom a születéskor jelenik meg, és attól függ, hogyan született a gyermek. [48] ​​Például a császármetszéssel történő gyermekvállalás több patogén mikroflórát, például Escherichia colit és Staphylococcust vezet be , és nagymértékben meghosszabbítja a nem patogén, jótékony mikrobióta kialakulásának idejét. [49] A hüvelyben született csecsemők normális, nem patogén, jótékony mikrobiótája hasonló az anyához. [ötven]

A bélmikrobióta és az emberi test közötti kapcsolat nemcsak kommenzális (ártalmatlan együttélés), hanem inkább kölcsönös (kölcsönösen előnyös). [3] A bélben egyes mikroorganizmusok segítik a gazdaszervezetet abban, hogy a különféle élelmi rostokat rövid szénláncú zsírsavakká alakítsák át , például ecetsavvá vagy vajsavvá , amelyeket aztán az emberi szervezet felszív. [8] [51] A bélbaktériumok fontos szerepet játszanak a B- és K -vitamin szintézisében , emellett metabolizálják az epesavakat , szterolokat és xenobiotikumokat . [3] [51] Az anyagcsere-ciklusok eredményeként a baktériumok a hormonokhoz hasonló anyagokat termelnek , és látszólag a mikrobiota endokrin mirigyként működik . [51] A bél mikrobiota diszregulációját számos gyulladásos és autoimmun állapottal korrelálták. [8] [52]

Az ember bélflórájának összetétele idővel változik az étrend és az általános egészségi állapot változásaival együtt. [8] [52] A 2016 júliusa óta végzett 15 , randomizált, embereken végzett kontrollos vizsgálat szisztematikus áttekintése azt találta, hogy a Bifidobacterium és Lactobacillus nemzetségbe tartozó probiotikus baktériumok néhány kereskedelmi forgalomban kapható törzse ( B. longum , B. breve , B. infantis , L. helveticus ) . _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ a központi idegrendszer bizonyos rendellenességei  – beleértve a szorongást , a depressziót , az autizmus spektrum zavarait és a kényszerbetegséget  – és javítja a memória bizonyos aspektusait . [53] A mikrobiom változásai azonban káros egészségügyi állapotokat is okozhatnak. Musso és munkatársai munkájában azt találták, hogy az elhízott egyének bélmikrobiótájában több Firmicutes és kevesebb Bacteroidetes található, mint az egészséges egyénekben. [54] Gordon és munkatársai egy másik tanulmánya megerősítette, hogy a mikrobiota összetétele okozza az elhízást, és nem fordítva. Ez úgy történt, hogy elhízott, vagy speciális diétán lévő egerekből származó bélmikrobiótát mikrobiómától megfosztott kontrollegerekbe ültettek át. Azt találták, hogy az elhízott egerekből származó bélmikrobiótával átültetett egerek zsírtartalma szignifikánsan magasabb volt, ha ugyanazt a táplálékot etették, mint azoknál az egereknél, amelyekbe diétázott állatokból származó mikrobiomát ültettek át. [55]

Húgycső és hólyag

Úgy tűnik, hogy a húgyúti rendszerben van egy mikrobiota [56] [57] , ami az eredmények hiánya miatt váratlan, ha klasszikus laboratóriumi mikrobiológiai tenyésztési módszerekkel elemezték a húgyúti fertőzések kimutatására ; . [58] A klasszikus tenyésztési módszerek nem mutatnak ki sokféle baktériumot és más mikroorganizmust . [58] A szekvenálási módszerek alapján azonban mikroorganizmus-azonosítást végeztek annak megállapítására, hogy vannak-e különbségek az egészséges egyének és a húgyúti problémákkal küzdők mikrobiótájában. [56] [57]

Hüvely

A hüvelyi mikrobiota olyan organizmusokat foglal magában, amelyek fontos szerepet játszanak a fertőzések elleni védelemben és a hüvely egészségének megőrzésében. [59] A premenopauzás nőkben előforduló leggyakoribb mikroorganizmusok a Lactobacillus nemzetségbe tartoznak , amelyek hidrogén-peroxid és tejsav termelésével gátolják a kórokozó szervezetek növekedését. [60] [59] [61] A mikrobiota összetétele nagymértékben függ a menstruációs ciklus szakaszától . [3] [62] Összefüggést állapítottak meg a szexuális kapcsolat, az antibiotikum-használat és a laktobacillusok elvesztése között nőknél. [61] Ezenkívül a vizsgálatok kimutatták, hogy az óvszerrel való közösülés megváltoztatja a laktobacillusok szintjét és növeli az E. coli szintjét a hüvelyben. [61] Az egészséges hüvelyi mikrobiotában bekövetkező összes változás különböző fertőzések kialakulását jelezheti, beleértve a candidiasist vagy a bakteriális vaginózist . [33] [60] [36]

Placenta

Egészen a közelmúltig a placentát sterilnek tekintették, de számos nem patogén baktériumot azonosítottak a placenta szövetében. [63] [64] [65]

Méh

Egészen a közelmúltig a női felső reproduktív traktus steril környezetnek számított. A reproduktív korban lévő egészséges, tünetmentes nők méhében számos mikroorganizmus él. A méh mikrobiomája jelentősen eltér a hüvely és a gyomor-bél traktus mikrobiómától. [66]

Szájüreg

A szájüreg biztosítja a szükséges feltételeket a mikroorganizmusok szaporodásához, beleértve a vizet, a tápanyagokat és a megfelelő hőmérsékletet. [3] A szájüregben található anaerob baktériumok közé tartozik : Actinomyces , Arachnia , Bacteroides , Bifidobacterium , Eubacterium , Fusobacterium , Lactobacillus , Leptotrichia , Peptococcus , Peptostreptococcus , Propionibacterium , Treponiellanas , Veilleenomonas . [67] A gombanemzetségek közé tartozik többek között: Candida , Cladosporium , Aspergillus , Fusarium , Glomus , Alternaria , Penicillium és Cryptococcus . [33]

A baktériumok a szájüreg kemény és lágy szöveteiben is felhalmozódnak egy biofilmben , lehetővé téve számukra, hogy megtapadjanak. Ennek eredményeként védelmet kapnak a környezeti tényezők és az antimikrobiális szerek ellen. [68] A nyál kulcsszerepet játszik a biofilm növekedésének és a baktériumok újratelepedésének feltételeinek fenntartásában a tápanyagellátás és a hőmérséklet szabályozása révén. A biofilm egy részének kimosásával szabályozza a mikroorganizmusok szaporodását is. [69] [70]

A szájban lévő baktériumok olyan mechanizmusokat fejlesztettek ki, amelyek érzékelik környezetüket, és elkerülik a gazdaszervezet megváltoztatását. A rendkívül hatékony, veleszületett emberi védelmi rendszer azonban folyamatosan ellenőrzi a baktériumok megtelepedését, és megakadályozza a bakteriális inváziót a helyi szövetekben. Dinamikus egyensúly van a plakkbaktériumok és a szervezet veleszületett védekező rendszere között. [71]

Az egészséges egyensúly egyfajta szimbiózis, amikor a szájüregből származó mikrobák korlátozzák a kórokozók szaporodását, megtapadását, az emberi szervezet pedig feltételeket biztosít a növekedésükhöz, fejlődésükhöz. [72] [68] Az ember életének megváltoztatása, beleértve az immunrendszert, a táplálkozást, a fajösszetétel átalakulását, felborítja ezt az egyensúlyt a kölcsönösen előnyösről a parazita hatásra. [68] Kimutatták, hogy a cukorbetegség és a szív- és érrendszeri betegségek összefüggésben állnak a száj egészségével. [72]

A rendszeres szájhigiénia a fő módszer a különféle betegségek kialakulásának megelőzésére. [72] A száj tisztítása csökkenti a potenciális patogén baktériumok túlszaporodását. [70] Előfordulhat azonban, hogy a megfelelő szájhigiénia nem elég, hiszen ez egy összetett rendszer, amelyben figyelembe kell venni az immunválaszt, a genetikát és a fajösszetételt. [70] Az antibiotikumok használhatók a fertőzések leküzdésére, de előfordulhat, hogy nem hatékonyak a biofilmek ellen. [70]

Tüdő

A szájüreghez hasonlóan a felső és alsó légúti rendszernek is van mechanikus eszköze a baktériumok eltávolítására. A serlegsejtek olyan váladékot termelnek, amely befogja a mikrobákat, és a folyamatosan mozgó csillós hámsejteken keresztül kihordja azokat a légzőrendszerből . Ezzel együtt a baktériumölő hatást a nyálka lizozimtartalma éri el. [3] A tüdőmikrobióta 9 nemzetségbe tartozik: Prevotella , Sphingomonas , Pseudomonas , Acinetobacter , Fusobacterium , Megasphaera , Veillonella , Staphylococcus és Streptococcus . Úgy gondolják, hogy ezeknek a "normális" baktériumoknak egy része nagyon súlyos betegségeket okozhat, különösen az immunhiányos embereknél. A baktériumok közé tartozik: Streptococcus pyogenes , Haemophilus influenzae , Streptococcus pneumoniae , Neisseria meningitidis és taphylococcus aureus . A tüdő mikobiómát alkotó gomba nemzetségek közé tartozik a Candida , Malassezia , Neosartorya , Saccharomyces , Aspergillus és mások. [33]

A baktérium- és gombanemzetségek szokatlan eloszlása ​​a légutakban a cisztás fibrózisban szenvedő betegeknél . [33] [73] Bakteriális környezetük gyakran tartalmaz antibiotikum-rezisztens és lassan növekvő baktériumokat, és ezeknek a kórokozóknak a gyakorisága az életkor függvényében változik. [73]

Epeutak

Hagyományosan úgy gondolják, hogy az epeutak általában sterilek, és a mikroorganizmusok jelenléte az epében a kóros folyamat markere. Ezt a feltételezést az is alátámasztotta, hogy a baktériumtörzseket nem sikerült izolálni a normál epevezetékből. 2013-ban kimutatták, hogy az epeúti normál mikrobiotája egy külön funkcionális réteg, amely megvédi az epeutakat az exogén mikroorganizmusok általi kolonizációtól.

Betegség és halál

Metagenómiai és epidemiológiai vizsgálatok azt mutatják, hogy az emberi mikrobiom fontos szerepet játszik a betegségek széles körének megelőzésében, a 2-es típusú cukorbetegségtől, az elhízástól, a gyulladásos bélbetegségtől a Parkinson-kórig, sőt a pszichiátriai betegségekig, például a depresszióig. [74] A bélmikrobióta és a különböző baktériumok közötti szimbiotikus kapcsolat befolyásolhatja az emberi immunválaszt. [75] Egyes tanulmányok arra utalnak, hogy a mikrobiom-korrekciós kezelés hatékony lehet a cukorbetegség kezelésében [76] .

Rák

Bár a rák genetikai betegségek és környezeti tényezők keveréke, a rákos esetek 20%-ában mikrobák vesznek részt. [77] A vastagbélrák egyes tényezői azt mutatják, hogy a vastagbélben milliószor több baktérium található, mint a vékonybélben , és körülbelül 12-szer több a vastagbélben, mint a vékonybélben, ami valószínűleg kórokozó szerepet játszik. mikrobiota a végbélben rák , [78] A mikrobiális elemzés prognosztikai eszközként használható a vastag- és végbélrák értékelésében. [78]

A mikrobióta három fő módon befolyásolhatja a karcinogenezist: (i) megváltoztatja a tumorsejtek szaporodásának és elhalásának egyensúlyát, (ii) szabályozza az immunrendszer működését, és (iii) befolyásolja az anyagcserét az elfogyasztott élelmiszerek és gyógyszerek emészthetőségének megváltoztatásával. [78] A különböző helyeken kialakuló daganatok általában a mikrobiotát érintik. A mikrobák ezeken a helyeken jobban alkalmazkodnak a csökkent oxigéntartalom vagy a kiegészítő táplálékforrás alapján. A specifikus mikrobák populációjának csökkenése vagy az indukált oxidatív stressz növelheti a rák kockázatát. [77] [78] Az 1030 ismert mikrobából 10- et rákkeltőnek minősített a Nemzetközi Rákkutató Ügynökség . [77] [78] A baktériumok fehérjéket vagy más olyan faktorokat szekretálhatnak, amelyek közvetlenül szabályozzák az emberi sejtburjánzást, ami fokozhatja vagy gyengítheti a gazdaszervezet immunrendszerét, beleértve az akut vagy krónikus gyulladást.

A gazdaszervezet és a mikrobiota közötti egyensúly felborulása csökkenti a rosszindulatú daganatokkal szembeni ellenállást, ami gyulladást és rákot okozhat. A védőgátak leküzdése után a mikrobák különféle módokon indukálnak gyulladást elősegítő vagy immunszuppresszív programokat. [77] Például úgy tűnik, hogy a rákkal összefüggő mikrobák aktiválják az NF-κΒ jelátvitelt a tumor mikrokörnyezetében. Más receptorok, például a Nod-szerű receptorok szerepet játszhatnak a vastag- és végbélrák közvetítésében. [77] Hasonlóképpen úgy tűnik, hogy a Helicobacter pylori a növeli a gyomorrák kockázatát a gyomorban kialakuló krónikus gyulladásos válasz miatt. [78]

Gyulladásos bélbetegség

A gyulladásos bélbetegségek közé tartozik a fekélyes vastagbélgyulladás és a Crohn-betegség. Ezeket a betegségeket a bélmikrobióta összetételi rendellenessége (más néven dysbiosis ) kíséri, és a bélben a mikrobiális sokféleség csökkenésében nyilvánul meg. [79] [80] Megállapították, hogy a dysbiosis korrelál a gazdagén hibáival, amelyek megváltoztatják az ember veleszületett immunválaszát. [79]

Humán immunhiány vírus

A HIV -betegség kialakulása befolyásolja a bélmikrobióta változását. A vírus megzavarja az epiteliális gát integritását azáltal, hogy befolyásolja a szoros csomópontokat . Ezek a rendellenességek gyulladás kialakulásához vezetnek a HIV-fertőzötteknél. [81]

A hüvelyi mikrobiota szerepet játszik a HIV átvitelében. Fokozott a betegség kockázata, ha egy nő bakteriális vaginosisban szenved . A fertőzőképesség csökkenése azonban megfigyelhető a hüvelyi Lactobacillus szintjének növekedésével , ami hozzájárul a gyulladásgátló állapot kialakulásához. [81]

Migráció

Az előzetes kutatások azt sugallják, hogy egy személy mikrobiomjában azonnali változások következhetnek be, amikor egy másik országba költöznek. [82] [83] Megállapították, hogy a fajdiverzitás csökkenése szignifikánsan nagyobb volt az elhízott emberek és a kivándorlók gyermekei között. [82] [83]

Mikrobióma elemzés

Jelenleg világszerte kereskedelmi megoldásokat vezetnek be az emberi mikrobiom elemzésére. A biotechnológiai cégek mikrobiota vizsgálati és elemzési szolgáltatásokat nyújtanak, különös tekintettel a bélflórára, és táplálkozási tanácsokat adnak. Így 2012-től megjelent az uBiome [84] cég első kereskedelmi terméke (jelenleg nem létezik), és az irányt olyan cégek fejlesztették tovább, mint a Viome [85] , BIOHM [86] , Thryve [87] . , iBIOM [88] , beleértve a hazai Atlaszt [89] és mások.

Mikrobióma változások COVID-19-betegeknél

A legújabb kutatások azt mutatják, hogy a SARS-CoV-2 vírusfertőzés után egy egészséges ember mikrobiotájában bekövetkezett változások lehetséges függőséget mutatnak. [90] A COVID-19-ben szenvedő betegek mikrobiotája jelentős változásokat mutatott a kontrollokhoz képest, amelyet az opportunista kórokozók feldúsulása és a jótékony baktériumok kimerülése jellemez a betegség során. A Coprobacillus, Clostridium ramosum és Clostridium hathewayi kiindulási abundanciája korrelált a COVID-19 súlyosságával, míg fordított korrelációt figyeltek meg a Faecalibacterium prausnitzii (gyulladáscsökkentő baktériumok) abundanciája és a betegség súlyossága között. [91]

Jegyzetek

  1. ↑ A mikrobiomkutatás szókincse: javaslat  (neopr.)  // Mikrobióma. - 2015. - T. 3 . - S. 31 . - doi : 10.1186/s40168-015-0094-5 . — PMID 26229597 .
  2. ↑ Stoma I.O. A mikrobiom az orvostudományban: útmutató a klinikusok számára . - Moszkva: GEOTAR-Media, 2020. - 320 p. — ISBN 978-5-9704-5844-0 . Archiválva : 2022. február 27. a Wayback Machine -nél
  3. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Sherwood, Linda; Willey, Joanne; Woolverton, Christopher. [ [1]  in Prescott's Microbiology  Google Books ] (újpr.) . — 9. - New York: McGraw-Hill Education , 2013. - 713-721. — ISBN 9780073402406 .
  4. ↑ 1 2 3 Amerikai Mikrobiológiai Akadémia GYIK: Emberi mikrobiom [{{{1}}} Archivált] {{{2}}}. 2014 január
  5. ↑ 1 2 Judah L. Rosner a Microbe Magazine számára, 2014. február. Tízszer több mikrobiális sejt, mint testsejt emberben? Archiválva : 2020. szeptember 17. a Wayback Machine -nél
  6. ↑ 1 2 Alison Abbott a Nature News-nak. 2016. január 8. A tudósok lerombolják azt a mítoszt, miszerint testünkben több baktérium van, mint emberi sejtben Archiválva : 2021. január 17. a Wayback Machine -nél
  7. ↑ 1 2 Sender, R. Valóban jelentős túlerőben vagyunk? A baktériumok és a gazdasejtek arányának újragondolása emberekben  (angol)  // Sejt  : folyóirat. - Cell Press , 2016. - január ( 164. évf. , 3. szám ). - P. 337-340 . - doi : 10.1016/j.cell.2016.01.013 . — PMID 26824647 .
  8. ↑ 1 2 3 4 5 6 Quigley, EM A bélbaktériumok az egészségben és a betegségekben  (neopr.)  // Gastroenterol Hepatol (NY). - 2013. - T. 9 , 9. sz . - S. 560-569 . — PMID 24729765 .
  9. ↑ A mikrobiológia találkozik a nagy adatokkal: A bélmikrobióta eredetű trimetilamin esete   // Annu . Fordulat. mikrobiol.  : folyóirat. - 2015. - Kt. 69 . - P. 305-321 . - doi : 10.1146/annurev-micro-091014-104422 . — PMID 26274026 .
  10. ↑ Archaea és az emberi bél: egy régi történet új kezdete  // World J. Gastroenterol  . : folyóirat. - 2014. - november ( 20. évf. , 43. sz.). - P. 16062-16078 . doi : 10.3748 / wjg.v20.i43.16062 . — PMID 25473158 .
  11. ↑ 1 2 Az NIH Human Microbiome Project meghatározza a test normál bakteriális felépítését . NIH News (2012. június 13.). Letöltve: 2020. február 3. Az eredetiből archiválva : 2012. június 17.
  12. ↑ 1 2 3 NIH Humán Mikrobióma Munkacsoport.  Az NIH Human Microbiome Project  // Genome Res : folyóirat. - 2009. - 1. évf. 19 , sz. 12 . - P. 2317-2323 . - doi : 10.1101/gr.096651.109 . — PMID 19819907 .
  13. ↑ Kuczynski, J. et al. Kísérleti és analitikai eszközök az emberi mikrobiom tanulmányozásához  (angol)  // Nature Reviews Genetics  : folyóirat. - 2011. - 20. évf. 13 , sz. 1 . - P. 47-58 . - doi : 10.1038/nrg3129 . — PMID 22179717 .
  14. ↑ Vestheim, H. Blocking primers to enhance ritka szekvenciák PCR-amplifikációja vegyes mintákban – esettanulmány a préda DNS-  éről antarktiszi krillgyomrokban //  BioMed Central : folyóirat. - 2008. - Vol. 5 . — 12. o . - doi : 10.1186/1742-9994-5-12 . — PMID 18638418 .
  15. ↑ Érintse meg; Julien; Mondot et al. Az emberi bélmikrobióta filogenetikai magja felé  (angol)  // Environmental Microbiology : Journal. - 2009. - 1. évf. 11 , sz. 102 . - P. 2574-2584 . - doi : 10.1111/j.1462-2920.2009.01982.x . — PMID 19601958 .
  16. ↑ Hamady, M.; Knight, R. Mikrobiális közösségek profilalkotása emberi mikrobiomprojektekhez  : Eszközök, technikák és kihívások  // Genome Research : folyóirat. - 2009. - 1. évf. 19 , sz. 7 . - P. 1141-1152 . - doi : 10.1101/gr.085464.108 . — PMID 19383763 .
  17. ↑ Human Microbiome Project Consortium. Az emberi mikrobiom kutatásának keretrendszere  (angol)  // Természet. - 2012. - Kt. 486 , sz. 7402 . - P. 215-221 . - doi : 10.1038/nature11209 . — . — PMID 22699610 .
  18. ↑ A Human Microbiome Project Consortium. Az egészséges emberi mikrobiom szerkezete, funkciója és sokfélesége  (angol)  // Nature : Journal. - 2012. - Kt. 486 , sz. 7402 . - P. 207-214 . - doi : 10.1038/természet11234 . — . — PMID 22699609 .
  19. ↑ 1 2 3 4 5 6 Birs, Christopher. Shotgun metagenomics, a mintavételtől az elemzésig  (angol)  // Nature Biotechnology  : Journal. - Nature Publishing Group , 2017. - szeptember 12. ( 35. évf. , 9. sz.). - P. 833-844 . — ISSN 1087-0156 . - doi : 10.1038/nbt.3935 . — PMID 28898207 .
  20. ↑ Claesson, Marcus J. A klinikai útmutató a mikrobiomelemzéshez  // Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology  : folyóirat  . - 2017. - augusztus 9. ( 14. évf. , 10. sz.). - P. 585-595 . — ISSN 1759-5045 . - doi : 10.1038/nrgastro.2017.97 . — PMID 28790452 .
  21. ↑ 1 2 3 Knight, Rob. A mikrobiomák elemzésének legjobb gyakorlatai  (angol)  // Nature Reviews Microbiology  : folyóirat. - 2018. - május 23. ( 16. évf. , 7. sz.). - P. 410-422 . — ISSN 1740-1526 . - doi : 10.1038/s41579-018-0029-9 . — PMID 29795328 .
  22. ↑ Washburne, Alex D. A mikrobiomadatok filogenetikai elemzésének módszerei  // Nature  Microbiology : folyóirat. - 2018. - május 24. ( 3. köt . 6. sz .). - P. 652-661 . — ISSN 2058-5276 . - doi : 10.1038/s41564-018-0156-0 . — PMID 29795540 .
  23. ↑ ES Van Amersfoort, TJC Van Berkel, J. Kuiper. A bakteriális szepszisben és a szeptikus sokkban szerepet játszó receptorok, mediátorok és mechanizmusok  //  Klinikai mikrobiológiai áttekintések. - 2003-07-01. — Vol. 16 , iss. 3 . - P. 379-414 . — ISSN 0893-8512 . - doi : 10.1128/CMR.16.3.379-414.2003 .
  24. ↑ PLoS Human Microbiome Project Collection Kézirat-összefoglalók archiválva 2014. március 4. a Wayback Machine -nél 2012. június 13.
  25. ↑ A tudósok konzorciuma feltérképezi az emberi test bakteriális ökoszisztémáját . ucsf.edu . Letöltve: 2020. február 3. Az eredetiből archiválva : 2019. július 30.
  26. ↑ Sommer, F. A bélmikrobióta – a gazdaszervezet fejlődésének és fiziológiájának mesterei  (Eng.)  // Nat Rev Microbiol  : folyóirat. - 2013. - április ( 11. évf. , 4. sz.). - P. 227-238 . - doi : 10.1038/nrmicro2974 . — PMID 23435359 .
  27. ↑ Az emberi bélmikrobiális flóra sokfélesége   // Tudomány . - 2005. - 20. évf. 308 , sz. 5728 . - P. 1635-1638 . - doi : 10.1126/tudomány.1110591 . - Iránykód . — PMID 15831718 .
  28. ↑ Tenyészthető baktériumdiverzitás az emberi vastagbélből   // Lett . Appl. mikrobiol. : folyóirat. - 2007. - Vol. 44 , sz. 4 . - P. 343-350 . - doi : 10.1111/j.1472-765X.2007.02129.x . — PMID 17397470 .
  29. ↑ Közös és egyedi környezeti tényezők határozzák meg a metanogének ökológiáját emberekben és patkányokban   // Am . J. Gastroenterol. : folyóirat. - 2000. - Vol. 95 , sz. 10 . - P. 2872-2879 . - doi : 10.1111/j.1572-0241.2000.02319.x . — PMID 11051362 .
  30. ↑ Az archaea és lehetséges szerepük az emberi betegségekben  //  Fertőzés és immunitás : folyóirat. - 2003. - 1. évf. 71 , sz. 2 . - P. 591-596 . - doi : 10.1128/IAI.71.2.591-596.2003 . — PMID 12540534 .
  31. ↑ Patogén archaeák: léteznek? (angol)  // BioEssays : folyóirat. - 2003. - 1. évf. 25 , sz. 11 . - P. 1119-1128 . doi : 10.1002 / bies.10354 . — PMID 14579252 .
  32. ↑ Methanogenic Archaea and human periodontális betegség  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : Journal  . - 2004. - 20. évf. 101 , sz. 16 . - P. 6176-6181 . - doi : 10.1073/pnas.0308766101 . - . — PMID 15067114 .
  33. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 8 9  Az emberi mikobióma az egészségben és a betegségekben  // Genome Med : folyóirat. - 2013. - július ( 5. köt. , 7. sz.). — 63. o . - doi : 10.1186/gm467 . — PMID 23899327 .
  34. ↑ 1 2 Candidiasis: hajlamosító tényezők, megelőzés, diagnózis és alternatív kezelés  (angol)  // Mycopathologia : folyóirat. - 2014. - június ( 177. évf . , 5-6. sz. ). - P. 223-240 . - doi : 10.1007/s11046-014-9749-1 . — PMID 24789109 .
  35. ↑ 1 2 Áttekintő cikk: gombás mikrobiota és emésztőrendszeri betegségek   // Aliment . Pharmacol. Ott. : folyóirat. - 2014. - április ( 39. évf. , 8. sz.). - P. 751-766 . - doi : 10.1111/apt.12665 . — PMID 24612332 .
  36. ↑ 1 2 3 Vékonybél gombás túlszaporodás  (neopr.)  // Curr Gastroenterol Rep. - 2015. - április ( 17. évf. , 4. sz.). - S. 16 . - doi : 10.1007/s11894-015-0436-2 . — PMID 25786900 .
  37. ↑ Malassezia spp. által okozott emberi fertőzések   // Mikrobiológiai és molekuláris biológiai áttekintések : folyóirat. – Amerikai Mikrobiológiai Társaság, 1992. - április 1. ( 5. köt. , 2. sz.). - 101-119 . o . - doi : 10.1128/CMR.5.2.101 . — PMID 1576583 .
  38. ↑ A bőr mikrobiális ökológiája   // Annu . Fordulat. mikrobiol. . - 1988. - 1. évf. 42 , sz. 1 . - P. 441-464 . - doi : 10.1146/annurev.mi.42.100188.002301 . — PMID 3144238 .
  39. ↑ Hannigan, Geoffrey D. Az emberi bőr kettős szálú DNS-vírusa: topográfiai és időbeli sokféleség, genetikai gazdagodás és dinamikus asszociációk a  gazdamikrobiómmal //  mBio : folyóirat. - 2015. - október 30. ( 6. évf. , 5. sz.). — P.e01578-15 . - doi : 10.1128/mBio.01578-15 . — PMID 26489866 .
  40. ↑ Minot, Samuel.  Az emberi bél virom: egyének közötti variáció és dinamikus válasz az étrendre  // Genome Research : folyóirat. - 2011. - október 1. ( 21. évf. , 10. sz.). - P. 1616-1625 . - doi : 10.1101/gr.122705.111 . — PMID 21880779 .
  41. ↑ Young, JC A Viral metagenomics feltárja az anellovírusok virágzását a tüdőtranszplantált betegek légzőrendszerében  // American  Journal of Transplantation : folyóirat. - 2015. - január 1. ( 15. évf . 1. sz .). - P. 200-209 . - doi : 10.1111/ajt.13031 . — PMID 25403800 .
  42. ↑ Abeles, Shira R. Az emberi szájüregi vírusok személyesek, tartósak és a nemhez konzisztensek  //  The ISME Journal : folyóirat. - 2014. - szeptember 1. ( 8. évf. , 9. sz.). - P. 1753-1767 . - doi : 10.1038/ismej.2014.31 . — PMID 24646696 .
  43. ↑ Ly, Melissa. Megváltozott orális vírusökológia a parodontális  betegséggel kapcsolatban //  mBio : folyóirat. - 2014. - július 1. ( 5. köt . 3. sz .). - P.e01133-14 . - doi : 10.1128/mBio.01133-14 . — PMID 24846382 .
  44. ↑ Monaco, Cynthia L. Megváltozott vírus és bakteriális mikrobiom az emberi immunhiányos vírussal összefüggő szerzett immunhiányos szindrómában   // Cell Host & Microbe : folyóirat. - 2016. - március 9. ( 19. évf. , 3. sz.). - P. 311-322 . - doi : 10.1016/j.chom.2016.02.011 . — PMID 26962942 .
  45. ↑ Norman, Jason M. Disease-specific alterations in the enteric virome in inflammator bowel disease  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 2015. - január 29. ( 160. évf. , 3. szám ). - P. 447-460 . - doi : 10.1016/j.cell.2015.01.002 . — PMID 25619688 .
  46. ↑ Grice, Elizabeth A. Az emberi bőr mikrobiomának topográfiai és időbeli sokfélesége  //  Science : Journal. - 2006. - 20. évf. 324. sz . 5931 . - P. 1190-1192 . - doi : 10.1126/tudomány.1171700 . - Irodai . — PMID 19478181 .
  47. ↑ 1 2 Az emberek normál bakteriális flórája . textbookofbacteriology.net . Letöltve: 2020. február 3. Az eredetiből archiválva : 2017. december 18.
  48. ↑ Yang, Irene.  The Infant Microbiome  // Nursing Research : folyóirat. - 2016. - Kt. 65 , sz. 1 . - 76-88 . o . - doi : 10.1097/NNR.0000000000000133 . — PMID 26657483 .
  49. ↑ Wall, R. Role of Gut Microbiota in Early Infant Development  (meghatározatlan)  // Clinical Medicine. Gyermekgyógyászat. - 2009. - március 4. ( 3. köt. ). - S. 45-54 . — ISSN 1178-220X . - doi : 10,4137/cmped.s2008 . — PMID 23818794 .
  50. ↑ Mueller, Noel T. A csecsemő mikrobióma fejlődése: az anya számít   // Trends in Molecular Medicine : folyóirat. - Cell Press , 2015. - február ( 21. évf. , 2. sz.). - 109-117 . o . - doi : 10.1016/j.molmed.2014.12.002 . — PMID 25578246 .
  51. ↑ 1 2 3 Clarke, G. et al. Minireview: A bél mikrobiota: az elhanyagolt endokrin szerv   // Mol Endocrinol : folyóirat. - 2014. - augusztus ( 28. évf. , 8. sz.). - P. 1221-1238 . — doi : 10.1210/me.2014-1108 . — PMID 24892638 .
  52. ↑ 1 2 Shen, S. Bugging gyulladás: szerepe a bél mikrobiota  (nem meghatározott)  // Clin Transl Immunology. - 2016. - V. 5 , 4. sz . - doi : 10.1038/cti.2016.12 . — PMID 27195115 .
  53. ↑ A probiotikumok hatása a központi idegrendszer működésére állatokban és emberekben – szisztematikus áttekintés  //  J. Neurogastroenterol Motil. : folyóirat. - 2016. - július ( 22. évf. , 4. sz.). - P. 589-605 . - doi : 10.5056/jnm16018 . — PMID 27413138 .
  54. ↑ Musso, G. Elhízás, cukorbetegség és bélmikrobióta: A higiéniai hipotézis bővült? (angol)  // Diabetes Care : folyóirat. - 2010. - szeptember 28. ( 33. évf. , 10. sz.). - P. 2277-2284 . doi : 10.2337 /dc10-0556 . — PMID 20876708 .
  55. ↑ Turnbaugh, Peter J. A diéta által kiváltott elhízás jelentős, de visszafordítható elváltozásokhoz kapcsolódik az egér disztális  bélmikrobiómájában  // Sejtgazda és mikroba : folyóirat. - 2008. - április ( 3. köt . 4. sz .). - P. 213-223 . - doi : 10.1016/j.chom.2008.02.015 . — PMID 18407065 .
  56. ↑ 1 2 Drake, MJ A húgyúti mikrobiom és hozzájárulása az alsó húgyúti tünetekhez  //  Neurourology and Urodynamics : Journal. - 2017. - április ( 36. évf. , 4. sz.). - P. 850-853 . - doi : 10.1002/nau.23006 . — PMID 28444712 .
  57. ↑ 1 2 Aragón, IM The Urinary Tract Microbiome in Health and Disease  //  European Urology Focus : Journal. - 2018. - január ( 4. évf . 1. sz .). - 128-138 . o . - doi : 10.1016/j.euf.2016.11.001 . — PMID 28753805 .
  58. ↑ 1 2 Schmiemann, G. A húgyúti fertőzés diagnózisa: szisztematikus áttekintés  //  Deutsches Aerzteblatt Online: folyóirat. - 2010. - 20. évf. 107 , sz. 21 . - P. 361-367 . - doi : 10.3238/arztebl.2010.0361 . — PMID 20539810 .
  59. ↑ 1 2 Petrova, Mariya I. Lactobacillus fajok, mint biomarkerek és szerek, amelyek elősegíthetik a hüvely egészségének különböző aspektusait  //  Frontiers in Physiology : Journal. - 2015. - Kt. 6 . — 81. o . - doi : 10.3389/fphys.2015.00081 . — PMID 25859220 .
  60. ↑ 1 2 Áttekintő cikk: gombás mikrobiota és emésztőrendszeri betegségek   // Aliment . Pharmacol. Ott. : folyóirat. - 2014. - április ( 39. évf. , 8. sz.). - P. 751-766 . - doi : 10.1111/apt.12665 . — PMID 24612332 .
  61. ↑ 1 2 3 Witkin, SS A női nemi traktus bakteriális flórája: Funkció és immunszabályozás  (angol)  // Best Practice & Research Clinical Obstetrics & Gynecology : folyóirat. - 2007. - Vol. 21 , sz. 3 . - P. 347-354 . - doi : 10.1016/j.bpobgyn.2006.12.004 . — PMID 17215167 .
  62. ↑ Onderdonk, AB A hüvelyi mikroflóra mennyiségi és minőségi értékelésének módszerei menstruáció alatt   // Alkalmazott és környezeti mikrobiológia : folyóirat. - 1986. - 1. évf. 51 , sz. 2 . - P. 333-339 . — PMID 3954346 .
  63. ↑ Fox, Chelsea. Az anyai mikrobiom és a terhesség eredményei  (neopr.)  // Termékenység és sterilitás. - 2015. - T. 104 , 6. sz . - S. 1358-1363 . - doi : 10.1016/j.fertnstert.2015.09.037 . — PMID 26493119 .
  64. ↑ Wassenaar, T.M. Steril környezetben fejlődik a magzat? (neopr.)  // Levelek az alkalmazott mikrobiológiából. - 2014. - T. 59 , 6. sz . - S. 572-579 . - doi : 10.1111/lam.12334 . — PMID 25273890 .
  65. ↑ Schwiertz, Andreas. Az emberi test mikrobiotája: következményei az egészségre és a  betegségekre . - 2016. - ISBN 978-3-319-31248-4 .
  66. ↑ Franasiak, Jason M. Reproductive tract microbiome in as assisted reproductive technologies  //  Fertility and Sterility : Journal. - 2015. - Kt. 104 , sz. 6 . - P. 1364-1371 . - doi : 10.1016/j.fertnstert.2015.10.012 . — PMID 26597628 .
  67. ↑ Sutter, VL Az anaerobok, mint a normál szájflóra  //  Reviews of Infectious Diseases : folyóirat. - 1984. - 1. évf. 6 1. melléklet . -P.S62- S66 . - doi : 10.1093/clinids/6.Supplement_1.S62 . — PMID 6372039 .
  68. ↑ 1 2 3 Purnima, Kumar. Orális mikrobiota és szisztémás betegség  (neopr.)  // Anaerob. - 2013. - december ( 24. köt. ). - S. 90-93 . - doi : 10.1016/j.anaerobe.2013.09.010 . — PMID 24128801 .
  69. ↑ Arweiler, Nicole B.; Netuschil, Lutz. Az emberi test mikrobiotája: következményei az egészségre és a  betegségekre . – Springer, Cham . - P. 45-60. — ISBN 978-3-319-31248-4 .
  70. ↑ 1 2 3 4 Avila, Maria.  Az orális mikrobiota: Élet állandó vendéggel  // DNS és sejtbiológia : folyóirat. - 2009. - 1. évf. 28 , sz. 8 . - P. 405-411 . — ISSN 1044-5498 . - doi : 10.1089/dna.2009.0874 . — PMID 19485767 .
  71. ↑ Rogers AH (szerkesztő). Molekuláris  szájmikrobiológia (neopr.) . – Caister Academic Press, 2008. - ISBN 978-1-904455-24-0 .
  72. ↑ 1 2 3 Zarco, MF Az orális mikrobiom az egészségben és a betegségekben, valamint a személyre szabott fogorvoslás lehetséges hatásai  //  Oral Diseases : Journal. - 2012. - Kt. 18 , sz. 2 . - P. 109-120 . — ISSN 1354-523X . - doi : 10.1111/j.1601-0825.2011.01851.x . — PMID 21902769 .
  73. ↑ 1 2 Beringer, P M. Szokatlan légúti bakteriális flóra cisztás fibrózisban: mikrobiológiai és klinikai jellemzők  //  Current Opinion in Pulmonary Medicine : folyóirat. Lippincott Williams & Wilkins, 2000. – November ( 6. köt. , 6. sz. ). - P. 545-550 . - doi : 10.1097/00063198-200011000-00015 . — PMID 11100967 . Archiválva az eredetiből 2013. október 16-án.
  74. ↑ Copeland CS. A világ bennünk: egészség és az emberi mikrobiom. Archiválva : 2019. december 7., a Wayback Machine Healthcare Journal of New Orleans, 2017. szeptember-okt.
  75. ↑ Honda, Kenya. A mikrobiota az adaptív immunhomeosztázisban és a betegségekben  (angol)  // Nature : Journal. - 2016. - július 7. ( 535. évf. , 7610. sz.). - 75-84 . o . - doi : 10.1038/nature18848 . — . — PMID 27383982 .
  76. ↑ Burton, JH Gasztrointesztinális mikrobiom modulátor hozzáadása a metforminhoz javítja a metformin toleranciát és az éhgyomri glükózszintet  //  Journal of Diabetes Science and Technology : folyóirat. - 2015. - Kt. 9 , sz. 4 . - P. 808-814 . doi : 10.1177 / 1932296815577425 . — PMID 25802471 .
  77. ↑ 1 2 3 4 5 Garrett, W. S. A rák és a mikrobiota   // Tudomány . - 2015. - április 3. ( 348. évf. , 6230. sz.). - P. 80-6 . - doi : 10.1126/science.aaa4972 . — . — PMID 25838377 .
  78. ↑ 1 2 3 4 5 6 Gagnière, J. A bél mikrobiota egyensúlyhiánya és a vastagbélrák  // World Journal of  Gastroenterology : folyóirat. - 2016. - Kt. 22 , sz. 2 . - P. 501-518 . - doi : 10.3748/wjg.v22.i2.501 . — PMID 26811603 .
  79. ↑ 1 2 Sartor, R. Balfour. Bélmikrobák gyulladásos bélbetegségekben  (neopr.)  // The American Journal of Gastroenterology Supplements. - 2012. - július ( 1. köt. 1. sz . ). - S. 15-21 . - doi : 10.1038/ajgsup.2012.4 .
  80. ↑ Hold, Georgina L. A bélmikrobióta szerepe a gyulladásos bélbetegségek patogenezisében: Mit tanultunk az elmúlt 10 évben? (angol)  // World Journal of Gastroenterology : folyóirat. - 2014. - február 7. ( 20. évf. , 5. sz.). - P. 1192-1210 . - doi : 10.3748/wjg.v20.i5.1192 . — PMID 24574795 .
  81. ↑ 1 2 Zilberman-Schapira, Gili. A bél mikrobiomája a humán immundeficiencia vírus fertőzésében  (angol)  // BMC Medicine : folyóirat. - 2016. - Kt. 14 , sz. 1 . — 83. o . - doi : 10.1186/s12916-016-0625-3 . — PMID 27256449 .
  82. ↑ 1 2 Vanagay, Pajau et al. Az amerikai bevándorlás nyugatiasítja az emberi bél mikrobiomát  (angol)  // Cell  : Journal. - Cell Press , 2018. - november 1. ( 175. évf. , 4. szám ). - P. 962-972 . — doi : 10.1016/j.cell.2018.10.029 . — PMID 30388453 .
  83. ↑ 1 2 Kaplan, Robert C. A bél mikrobiom összetételét a Hispanic Community Health Study/Study of Latinos a földrajzi helyváltoztatás, a környezeti tényezők és az elhízás befolyásolja  //  BioMed Central : folyóirat. - 2019. - november 1. ( 20. évf. , 1. sz.). - 219. o . — ISSN 1474-760X . - doi : 10.1186/s13059-019-1831-z . — PMID 31672155 .
  84. ↑ uBiome  //  Wikipédia. — 2020-08-25.
  85. ↑ Viome cégprofil és vezetés . Viome . Letöltve: 2020. október 20. Az eredetiből archiválva : 2020. október 21.
  86. ↑ Miért a Biohm Health |  Általános wellness a bél egészségének optimalizálásával . BIOHM Health . Letöltve: 2020. október 20. Az eredetiből archiválva : 2020. október 23.
  87. ↑ Tudományunk . _  Thryve-Gut egészségügyi program . Letöltve: 2020. október 20. Az eredetiből archiválva : 2020. október 21.
  88. ↑ Blog  (szlovén) . iBIOM . Letöltve: 2020. október 20. Az eredetiből archiválva : 2020. október 23.
  89. ↑ Mikrobióta . Atlas Blog . Letöltve: 2020. október 20. Az eredetiből archiválva : 2020. október 22.
  90. ↑ A bélmikrobióta és a Covid-19 lehetséges kapcsolata és következményei  //  Víruskutatás. — 2020-08-01. — Vol. 285 . — P. 198018 . — ISSN 0168-1702 . - doi : 10.1016/j.virusres.2020.198018 . Archiválva : 2020. október 21.
  91. ↑ Tüdőmikrobiom és koronavírus-betegség 2019 (COVID-19): Lehetséges kapcsolat és következmények  //  Human Microbiome Journal. — 2020-08-01. — Vol. 17 . - P. 100073 . — ISSN 2452-2317 . doi : 10.1016 / j.humic.2020.100073 . Archiválva : 2020. október 21.
  Ugrás a Wikidata elemre  Szótárak és enciklopédiák