Biológiai Matematikai Problémák Intézete RAS

Az Orosz Tudományos Akadémia Biológiai Matematikai Problémák Intézete a Szövetségi Állami Intézmény „Szövetségi Kutatóközpont Alkalmazott Matematikai Intézete V.I. M.V. Keldysh, az Orosz Tudományos Akadémia ” (rövidítve: IMPB RAS - az IPM M.V. Keldysh RAS -ról elnevezett ága ), így kezdett kinézni az intézet hivatalos neve a 2015-2016-os átszervezés után. [egy]

Az intézet célja matematikai és számítási módszerek kidolgozása a biológiai kutatásokhoz, valamint a számítási biológia problémáinak közvetlen megoldása ilyen módszerekkel.

Az Intézet kiadja a Mathematical Biology and Bioinformatics című tudományos folyóiratot. [2]

Az intézet felépítése

Az intézet magában foglalja [3] :

• Makromolekula-krisztallográfiai laboratórium
• Kvantummechanikai Rendszerek Laboratóriuma
• Molekuláris Dinamika Laboratórium
• Neurális Hálózati Laboratórium
• Alkalmazott Matematikai Laboratórium
• Számítási Ökológiai Laboratórium
• Fejlett Információs Technológiák Tanszék
  • Adatfeldolgozó laboratórium
  • Bioinformatikai Laboratórium
• Számítástechnikai és információs erőforrások részlege

Tudományos tevékenység

Tudományos irányok

• Elméleti fejlemények ;
  • a nanobioelektronika elméleti alapjai ;
  • spektrális-analitikai módszerek fejlesztése biológiai kísérletek adatainak feldolgozására;
  • numerikus-analitikai módszerek kidolgozása biológiai kísérletek adatainak feldolgozására;
  • integro-differenciálegyenletek analitikai megoldásai ;
  • dinamikus rendszerek elemzési módszerei .

• Adatelemzés
  • az emberi agyi tevékenység elemzése ;
  • a növénytakaró biológiai sokféleségének felmérésére szolgáló módszerek kidolgozása ;
  • genomi szekvenciák tanulmányozására szolgáló algoritmusok és programok fejlesztése : kódoló régiók és homogenitási területek felismerése;
  • számítógépes módszerek kidolgozása a biopolimerek primer szerkezetének tanulmányozására ;
  • új módszerek kidolgozása biopolimerek összehasonlítására és alkalmazása a fehérjék térszerkezeti típusának felismerésére;
  • új módszerek létrehozása a biológiai makromolekulák komplexeinek szerkezetének megfejtésére a röntgensugarak és a neutronok szóródására vonatkozó adatok alapján ;
  • digitális képek előállítására, feldolgozására és elemzésére szolgáló módszerek kidolgozása a biológiában és az orvostudományban.

• Számítógépes biológia
  • biomolekuláris rendszerek dinamikájának szimulációs modellezése;
  • Az agyi struktúrák információfeldolgozásának neurális hálózati modelljei ;
  • véletlen gráfok és alkalmazásaik a matematikai idegtudományban ;
  • gerjeszthető biomembránok feszültségfüggő ioncsatornáinak modelljeinek tanulmányozása ;
  • szoftver a sejtmetabolizmus tanulmányozásához ;
  • matematikai modellek a biomechanikában ;
  • szívfizikai problémák numerikus megoldása .

• Szinergetika (beleértve az olyan részeket, mint: Dinamikus rendszer , Káoszelmélet , Nem egyensúlyi termodinamika , Rendszerbiológia )
  • önbefogott állapotok nemlineáris modelljeinek tanulmányozása sűrített közegben;
  • aszimptotikus módszerek és numerikus szimuláció a gerjesztési hullámok vizsgálatában ;
  • bifurkációk a szimmetriával rendelkező rendszereket leíró differenciálegyenletekben ;
  • Bifurkációk a funkcionális differenciálegyenletekben és a bifurkációs memóriajelenségek .

• Bioinformatika

• Párhuzamos számítástechnika
  • nagy teljesítményű számítástechnikai klaszter fejlesztése ;
  • CUDA technológiák .

Speciális tudományos projektek

• projekt "Mathematical cell" [4] ;
• projekt " Általános spektrális-analitikai módszer " (GSAM) [5] [6] [7] .

Oktatási és társadalmi tevékenység

Az intézet munkatársai a Pushchino Állami Egyetemen [8] (PuschGU) tartottak előadásokat; A. M. Molchanov a Push State University Matematikai Biológiai Oktatási Központjának szervezője és dékánja volt 1994 és 2005 között, valamint a Push State University "Biológiai rendszerek modellezése" mesterképzésének vezetője (1994-2011).

Az Intézet 2006 óta kétévente tart „Matematikai biológia és bioinformatika” konferenciát.

Történelem

Az Intézetet 1972. február 17- én alapították Puscsinóban , igazgatójává AM Molcsanovot nevezték ki . 1992-ig a Szovjetunió Tudományos Akadémia Kutatói Számítástechnikai Központjának (NICC) hívták . 2016 februárjáig a Szövetségi Állami Költségvetési Tudományos Intézet az Orosz Tudományos Akadémia Biológiai Matematikai Problémái Intézete ( Institute of Mathematical Problems of Biology , IMPB RAS ) néven.

Mérföldkövek

• 1972. február 17. - megszervezték a Szovjetunió Tudományos Akadémia Kutatói Számítástechnikai Központját (NICC);
• 1972 - létrehozták a számítástechnikai tanszéket (vezető - V. G. Erokhin );
• 1983 - megalakult az Informatikai Tanszék (vezető - V. V. Kornilov ); később átalakult az információkereső rendszerek szektorába (vezető - V. V. Vasilchikov ), amely 1989-ig működött;
• 1984 - a Számítástechnika Tanszék feladattámogató csoportja Számítási Munkaszervezési Osztályrá alakult (vezető - V. A. Koroljev );
• 1986 - megalakult a Számítógépes tanulás problémáinak szektora ( R. M. Borisyuk vezetésével );
• 1990 - megalakult a biomechanika matematikai problémáinak szektora
• 1992 – A Szovjetunió Tudományos Akadémia NIVT-jeit átnevezték az Orosz Tudományos Akadémia Matematikai Biológiai Problémák Intézetére (IMPB); feloszlatták a számítástechnika és a számítási munkaszervezés tanszékeit;
• 1998 – A filozófia doktorát választották az intézet új igazgatójává. n. V. D. Lakhno
• 2000 - megalakult az Intézetközi Számítástechnikai és Információs Erőforrások Tanszék (MOVIR)
• 2004 – bioinformatikai laboratórium létrehozása
• 2015 - a FASO döntésével az intézetet összevonták az Alkalmazott Matematika Intézettel [1]

Vezetők

• Molchanov, Albert Makarievich (1972-1998, rendező)
• Lakhno, Viktor Dmitrijevics (1998-2016, rendező)
• Lakhno, Viktor Dmitrievich (2016 óta a fióktelep vezetője)

Nevezetes munkatársak

• Dedus, Fjodorovics Florenc
• Molcsanov, Albert Makarievich
• Shnol, Emmanuil Elevich

Linkek

• Hivatalos weboldal Archivált 2008. február 28-án a Wayback Machine -nél
• Az Intézet rövid története archiválva 2009. március 2-án a Wayback Machine -nél

Jegyzetek

1. ↑ 1 2 Parancs az IMPB csatlakozásáról az IPM-hez . Letöltve: 2016. március 1. Az eredetiből archiválva : 2016. március 6.. (határozatlan)
2. ↑ A folyóirat hivatalos weboldala . Letöltve: 2017. október 10. Az eredetiből archiválva : 2017. október 11.. (határozatlan)
3. ↑ Az IMPB RAS laboratóriumai . Letöltve: 2022. április 3. Az eredetiből archiválva : 2009. március 2. (határozatlan)
4. ↑ A Mathematical Cell projekt hivatalos weboldala . Hozzáférés dátuma: 2016. június 30. Az eredetiből archiválva : 2016. január 11. (határozatlan)
5. ↑ Proc. SPIE. Vol.2363. 1995. P.109-112 . Hozzáférés dátuma: 2016. június 30. Az eredetiből archiválva : 2016. augusztus 18. (határozatlan)
6. ↑ Proc. SPIE. Vol.2363. 1995. P.113-118 . Hozzáférés dátuma: 2016. június 30. Az eredetiből archiválva : 2016. augusztus 18. (határozatlan)
7. ↑ SBARS – spektrális alapú megközelítés ismétlődő kereséshez . Letöltve: 2017. szeptember 26. Az eredetiből archiválva : 2017. szeptember 26.. (határozatlan)
8. ↑ A Pushchino Egyetem hivatalos honlapja  (hozzáférhetetlen link)